[发明专利]一种检测miRNA来源的方法

权利要求书

1.一种检测秀丽隐杆线虫假基因miRNA来源的方法，其特征在于，包括以下步骤：

1)提供物种的待检测miRNA前体序列的信息；

2)提供假基因数据库中所述物种的假基因信息；

3)将所述待检测miRNA前体序列与所述物种假基因的核苷酸序列的物理位置比较是否重合，将与miRNA前体序列的物理位置具有重合度的假基因确定候选假基因；

4)根据待检测miRNA前体序列与所述物种基因组的假基因序列在染色体所在的物理位置，计算两类序列的重合度，当所述重合度I符合1≧I0.3条件时，确定待检测miRNA是由所述步骤3)得到的候选假基因所产生；

所述步骤1)中信息包括待检测miRNA前体序列在染色体上的物理位置、名称及所在DNA链的正负性；

所述步骤2)中的信息包括假基因在染色体上的物理位置、名称及假基因所在DNA链的正负性；

所述步骤4)中重合度I的计算公式为：

I＝待检测miRNA前体序列与候选假基因核苷酸序列相互重合部分的长度/待检测miRNA前体序列的长度；

所述计算公式的适用情形包括以下三种：(1)目标miRNA前体序列的起点和终点均位于候选假基因核苷酸序列的内部；(2)目标miRNA前体序列的起点位于候选假基因核苷酸序列的内部，终点位于候选假基因核苷酸序列的外部；(3)目标miRNA前体序列的终点位于候选假基因核苷酸序列的内部，起点位于候选假基因核苷酸序列的外部；

所述步骤1)和步骤2)之间没有时间顺序限定。