[发明专利]T细胞抗原受体β链CDR3的处理方法在审
申请号: | 201610316348.0 | 申请日: | 2016-05-12 |
公开(公告)号: | CN107345240A | 公开(公告)日: | 2017-11-14 |
发明(设计)人: | 眭维国;戴勇;赖柳生 | 申请(专利权)人: | 眭维国;戴勇;赖柳生 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 广州华进联合专利商标代理有限公司44224 | 代理人: | 何平 |
地址: | 541000 广西壮族*** | 国省代码: | 广西;45 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 细胞 抗原 受体 cdr3 处理 方法 | ||
1.一种T细胞抗原受体β链CDR3的处理方法,其特征在于,包括以下步骤:
设置实验组与对照组,每组包括若干份相异人体的已经脱离人体的外周血标本;
分离各所述外周血标本的T细胞,并分别提取所述外周血标本T细胞中的DNA;
采用多重PCR技术,扩增出T细胞受体β链的CDR3区;
对所述T细胞受体β链的CDR3区进行高通量测序,对所述实验组及对照组中T细胞受体β链进行DNA分析。
2.根据权利要求1所述的处理方法,其特征在于,采用多重PCR技术之前,所述处理方法还包括测定DNA的含量以及检测DNA完整性的步骤。
3.根据权利要求2所述的处理方法,其特征在于,采用荧光分析法测定DNA的含量,用琼脂糖凝胶电泳法检测DNA完整性。
4.根据权利要求1所述的处理方法,其特征在于,利用Illumina MiSeq平台对CDR3区进行高通量测序。
5.根据权利要求1所述的处理方法,其特征在于,采用多重PCR技术,扩增出T细胞受体β链的CDR3区,包括构建DNA文库,其具体包括:
计算所述实验组及对照组中DNA的取用量,称取,并加入V区引物及J区引物进行多重PCR;
电泳检测回收多重PCR产物;
加入末端修护混合液进行末端修护反应,并纯化;
将纯化后的产物在3’端连上A碱基;
在接头连接反应体系中进行接头连接;
通过PCR反应富集经过接头修饰的DNA片段,并对PCR产物进行琼脂糖凝胶电泳,切取目的片段后,纯化回收,得到DNA文库。
6.根据权利要求5所述的处理方法,其特征在于,所述V区引物包括TRBV2、TRBV3-1、TRBV4-1/2/3、TRBV5-1、TRBV5-4/5/6/8、TRBV6-4.1、 TRBV6-8/5/1.2、TRBV6-9/7/1.1/6、TRBV6-4.2、TRRBV6-2/3、TRBV7-2/4/6/7/8、TRBV7-3、TRBV7-9、TRBV9、TRBV10-1、TRBV10-2/3、TRBV11-1/2/3、TRBV12-3.2/5.2、TRBV12-3.1/4/5.1、TRBV13、TRBV14、TRBV15、TRBV16、TRBV18、TRBV19、TRBV20-1、TRBV24-1、TRBV25-1、TRBV27-1、TRBV28、TRBV29-1及TRBV30-F5。
7.根据权利要求5所述的处理方法,其特征在于,所述J区引物包括TRBJ1.1、TRBJ1.2、TRBJ1.3、TRBJ1.4、TRBJ1.5、TRBJ1.6、TRBJ2.1、TRBJ2.2、TRBJ2.3、TRBJ2.4、TRBJ2.5、TRBJ2.6及TRBJ2.7。
8.根据权利要求5所述的处理方法,其特征在于,构建DNA文库后,还包括检测所述DNA文库的插入片段范围及对所述DNA文库的浓度进行定量。
9.根据权利要求1所述的处理方法,其特征在于,分离各所述外周血标本的T细胞包括:分离出所述外周血标本的淋巴细胞及分离出所述淋巴细胞中的T细胞。
10.根据权利要求9所述的处理方法,其特征在于,采用Ficoll密度梯度离心法分离出所述外周血标本的淋巴细胞。
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