[发明专利]一种基因蛋白质序列关系分析系统及方法无效

专利信息
申请号: 201210492701.2 申请日: 2012-11-27
公开(公告)号: CN102968577A 公开(公告)日: 2013-03-13
发明(设计)人: 史卫峰;柏佳宁;李先斌;凌诚;郭雪平;郑为民;黄锡鸿 申请(专利权)人: 广州中国科学院先进技术研究所
主分类号: G06F19/16 分类号: G06F19/16
代理公司: 广州嘉权专利商标事务所有限公司 44205 代理人: 谭英强
地址: 511458 广东*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 一种 基因 蛋白质 序列 关系 分析 系统 方法
【权利要求书】:

1.一种基因蛋白质序列关系分析系统,其特征在于,包括:

文件选择模块,用于选择要读取的文件;

序列文件分析模块,用于对序列文件进行分析;

序列距离分析模块,用于计算序列间的距离,得出距离关系矩阵;

MDS分析模块,用于对距离关系矩阵进行分析;

结果显示模块,用于对分析的结果进行分类和显示。

2.根据权利要求1所述的一种基因蛋白质序列关系分析系统,其特征在于:所述的序列文件分析模块包括:

文件读取模块,用于读取序列文件;

头文件分析模块,用于将头文件存入数据结构,并对其进行分隔;

字段选择模块,用于选择后续结果显示时需要的字段。

3.根据权利要求1所述的一种基因蛋白质序列关系分析系统,其特征在于:所述的MDS分析模块包括:

算法选择模块,用于选择要调用的算法;

降维模块,用于对距离关系矩阵进行降维。

4.根据权利要求1所述的一种基因蛋白质序列关系分析系统,其特征在于:所述的结果显示模块包括:

标识选择模块,用于选择标识的形状和颜色;

序列显示模块,用于以选择的形状和颜色标识出各个序列在二维坐标系中的位置;

序列分类模块,用于对序列进行分类。

5.一种基因蛋白质序列关系分析方法,其特征在于,包括以下步骤:

A、选择要读取的文件;

B、对序列文件进行分析;

C、计算序列间的距离,得出距离关系矩阵;

D、对距离关系矩阵进行分析;

E、对分析的结果进行分类和显示。

6.根据权利要求5所述的一种基因蛋白质序列关系分析方法,其特征在于:所述的步骤B包括:

B1、读取序列文件;

B2、将头文件存入数据结构,并对其进行分隔;

B3、选择后续结果显示时需要的字段。

7.根据权利要求5所述的一种基因蛋白质序列关系分析方法,其特征在于:所述的步骤D包括:

D1、选择要调用的算法;

D2、对距离关系矩阵进行降维。

8.根据权利要求5所述的一种基因蛋白质序列关系分析方法,其特征在于:所述的步骤E包括:

E1、选择标识的形状和颜色;

E2、以选择的形状和颜色标识出各个序列在二维坐标系中的位置;

E3、对序列进行分类。

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