[发明专利]一种基因蛋白质序列关系分析系统及方法无效
申请号: | 201210492701.2 | 申请日: | 2012-11-27 |
公开(公告)号: | CN102968577A | 公开(公告)日: | 2013-03-13 |
发明(设计)人: | 史卫峰;柏佳宁;李先斌;凌诚;郭雪平;郑为民;黄锡鸿 | 申请(专利权)人: | 广州中国科学院先进技术研究所 |
主分类号: | G06F19/16 | 分类号: | G06F19/16 |
代理公司: | 广州嘉权专利商标事务所有限公司 44205 | 代理人: | 谭英强 |
地址: | 511458 广东*** | 国省代码: | 广东;44 |
权利要求书: | 查看更多 | 说明书: | 查看更多 |
摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基因 蛋白质 序列 关系 分析 系统 方法 | ||
1.一种基因蛋白质序列关系分析系统,其特征在于,包括:
文件选择模块,用于选择要读取的文件;
序列文件分析模块,用于对序列文件进行分析;
序列距离分析模块,用于计算序列间的距离,得出距离关系矩阵;
MDS分析模块,用于对距离关系矩阵进行分析;
结果显示模块,用于对分析的结果进行分类和显示。
2.根据权利要求1所述的一种基因蛋白质序列关系分析系统,其特征在于:所述的序列文件分析模块包括:
文件读取模块,用于读取序列文件;
头文件分析模块,用于将头文件存入数据结构,并对其进行分隔;
字段选择模块,用于选择后续结果显示时需要的字段。
3.根据权利要求1所述的一种基因蛋白质序列关系分析系统,其特征在于:所述的MDS分析模块包括:
算法选择模块,用于选择要调用的算法;
降维模块,用于对距离关系矩阵进行降维。
4.根据权利要求1所述的一种基因蛋白质序列关系分析系统,其特征在于:所述的结果显示模块包括:
标识选择模块,用于选择标识的形状和颜色;
序列显示模块,用于以选择的形状和颜色标识出各个序列在二维坐标系中的位置;
序列分类模块,用于对序列进行分类。
5.一种基因蛋白质序列关系分析方法,其特征在于,包括以下步骤:
A、选择要读取的文件;
B、对序列文件进行分析;
C、计算序列间的距离,得出距离关系矩阵;
D、对距离关系矩阵进行分析;
E、对分析的结果进行分类和显示。
6.根据权利要求5所述的一种基因蛋白质序列关系分析方法,其特征在于:所述的步骤B包括:
B1、读取序列文件;
B2、将头文件存入数据结构,并对其进行分隔;
B3、选择后续结果显示时需要的字段。
7.根据权利要求5所述的一种基因蛋白质序列关系分析方法,其特征在于:所述的步骤D包括:
D1、选择要调用的算法;
D2、对距离关系矩阵进行降维。
8.根据权利要求5所述的一种基因蛋白质序列关系分析方法,其特征在于:所述的步骤E包括:
E1、选择标识的形状和颜色;
E2、以选择的形状和颜色标识出各个序列在二维坐标系中的位置;
E3、对序列进行分类。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于广州中国科学院先进技术研究所,未经广州中国科学院先进技术研究所许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服】
本文链接:http://www.vipzhuanli.com/pat/books/201210492701.2/1.html,转载请声明来源钻瓜专利网。
- 同类专利
- 专利分类
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用