[发明专利]一种酵母中总RNA的快速提取方法有效
申请号: | 201210062093.1 | 申请日: | 2012-03-09 |
公开(公告)号: | CN102586233A | 公开(公告)日: | 2012-07-18 |
发明(设计)人: | 史锋;詹武兵;王小元 | 申请(专利权)人: | 江南大学 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
代理公司: | 北京汇信合知识产权代理有限公司 11335 | 代理人: | 王秀丽 |
地址: | 214122 江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 酵母 rna 快速 提取 方法 | ||
技术领域
本发明涉及酵母中RNA的提取,属于基因工程技术领域。
背景技术
RNA即Ribonucleic Acid,是生物细胞以及部分病毒、类病毒中重要的遗传信息的载体,是由至少几十个核糖核苷酸通过磷酸二酯键连接而成的一类核酸,因含有核糖而简称为RNA。RNA普遍存在于动物、植物、微生物及某些病毒和噬菌体内,RNA和蛋白质的合成有密切的关系。
RNA作为沟通DNA和蛋白质之间的遗传信息的载体,其稳定性较差,在生物体内,一般半衰期也比较短。在体外,由于受温度和RNA酶等各种因素的限制,其稳定性就更差了。加之在人体皮肤表面和呼吸的气体中,都遍布这种RNA酶,且RNA酶抗逆能力极强,高温和酸性都很难使其变性,所以对RNA进行实际操作时,RNA极易被降解。
提取组织中的RNA时,首先面对的是对组织的破壁问题,目前比较常用的方法是液氮冷冻研磨或冷冻匀浆,国内外各种RNA提取试剂盒的原理主要是利用酸性硫氰酸胍及苯酚、氯仿等有机溶剂的作用破壁离心沉淀的方法得到RNA。最早文献报道见于Chomczynski P和Sacchi N,此种方法较为经典,至今已沿用了20多年。但其自身使用到硫氰酸胍且在酸性条件下,因而也存在着较大的诟病,硫氰酸胍的危险类别码为R32:与酸接触释放出毒性很高的气体。另外,目前商业化的RNA提取试剂盒也存在着步骤多、操作较为繁琐、耗时长和价格昂贵等问题,此外市场上这类产品也是良莠不齐,有时即使严格按照说明步骤操作也无法达到令人满意的效果。
发明内容
本发明要解决的技术问题是提供了一种快速、简单的RNA提取方法。
为解决上述技术问题,本发明的技术方案为:收集菌体后,用DEPC处理过的超纯水洗涤;洗涤后的菌体沉淀中加入裂解缓冲液,悬浮细胞沉淀,然后加入0.3g玻璃珠及1∶1的苯酚和氯仿,涡旋混匀;加入TE溶液高速离心;取上清,加入氯仿,剧烈摇晃,高速离心;取上清,加入异丙醇沉淀RNA,并用75%乙醇洗涤沉淀,获得总RNA,所述离心均需要低温控制。
所述裂解缓冲液成分为:2%体积百分比Trition-100、1%质量百分比SDS、100mM NaCl、100mM Tris,pH8和100mM EDTA。
本发明提供的方法步骤简单,操作过程对设备要求低,对操作人员要求较低,使用到的试剂均为实验室常用试剂,较大程度上避免了使用毒性较高试剂对操作人员的伤害;采用本方法提取的RNA浓度和质量都很好,可直接用于逆转录。
说明书附图
图1实施例1逆转录PCR结果
M:1kb marker 1:crtBY 2:crtE
图2实施例2逆转录PCR结果
M:1kb marker 1:hmg1
具体实施方式
以下通过实施例来进一步阐明本发明,下列实施例用于说明目的而非用于限制本发明范围。
材料和试剂:
裂解缓冲液:2%(V/V)Trition-100
1%(w/v)SDS
100mM NaCl(AC)
100mM Tris,pH8(AC)
100mM EDTA(AC)
PC苯酚-氯仿1∶1(V/V)
TE(Tris-EDTA):10mM Tris-HCl,1mM Na2EDTA,pH8
100%EtOH
玻璃珠(0.45mm)
(配制制剂的水均为DEPC-treated water;所用的枪头和EP管也均为无RNA酶污染;AC:121摄氏度灭菌。)
实施例1:红发夫酵母中RNA的提取
1、取1.5mL红发夫酵母细胞培养液,离心去上清,用DEPC处理过的超纯水洗涤沉淀一次;
2、向洗涤后的细胞沉淀中加入200ul裂解缓冲液,悬浮细胞沉淀,然后加入0.3g玻璃珠及200ul PC,涡旋3min;然后加入200ul TE,4度14000rmp离心5min;
3、将上清液转移到一个干净的离心管,加入0.2mL氯仿,剧烈摇晃15s,在室温下放置10min,12000rpm、4度离心15min;
4、取上层无色水相置于一个干净的离心管,加入500ul异丙醇,混匀,在室温下放置10min,12000rpm、4度离心10min,弃上清液;
5、加入1mL75%乙醇,涡旋混匀,12000rpm、4度离心5min;
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