[发明专利]嗜肺军团菌的基因分型芯片及检测用试剂盒有效
申请号: | 201210003928.6 | 申请日: | 2012-01-09 |
公开(公告)号: | CN102424862A | 公开(公告)日: | 2012-04-25 |
发明(设计)人: | 王磊;曹勃阳;姚芳芳;冯露;周光朋 | 申请(专利权)人: | 南开大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C40B40/06;C12R1/01 |
代理公司: | 天津市杰盈专利代理有限公司 12207 | 代理人: | 朱红星 |
地址: | 300457 天津市塘*** | 国省代码: | 天津;12 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 军团 基因 芯片 检测 试剂盒 | ||
1.一种检测嗜肺军团菌的基因芯片,包括固相载体和固定在该固相载体上的寡聚核苷酸探针,其特征在于该寡聚核苷酸探针包含下述DNA片段中的至少一种:
(1)嗜肺军团菌O4、O12、O13、O15的wzm基因中所选取的至少一种DNA片段;
(2)嗜肺军团菌O1、O2、O3、O5、O6、O7的wzt基因中所选取的至少一种DNA片段;
(3)嗜肺军团菌O11的wecA基因中所选取的至少一种DNA片段;
(4)(1)或(2)或(3)中选取的DNA片段的互补DNA片段;
上述所述的固相载体为带有活性基团的玻璃片。
2.权利要求1所述的基因芯片,其中所述寡聚核苷酸探针具有SEQ ID NO:1-23所示的核苷酸序列,或不同于SEQ ID NO:1-23但编码的氨基酸序列与SEQ ID NO:1-23所编码的氨基酸序列相同的核苷酸序列。
3.权利要求1或2所述的基因芯片,其中还包括正对照探针和负对照探针;具有SEQ ID NO:33-34所示的核苷酸序列。
4.权利要求1所述的基因芯片在制备检测水体中菌嗜肺军团菌11个血清型中至少一种致病菌的方面应用。
5. 权利要求1所述基因芯片的使用方法,其特征在于包含步骤:
(1)根据权利要求1所述病原菌的wzm基因、wzt基因和wecA 基因设计并合成用于PCR扩增的引物;
(2)制备待测样品的基因组DNA,使用步骤(1)中的引物,对待测样品基因组DNA进行PCR扩增,得到靶序列;
(3)标记步骤(2)中得到的靶序列;
(4)将标记后的靶序列与权利要求1所述的基因芯片杂交;
(5)用生物芯片扫描仪获取杂交信号并分析杂交结果。
6.权利要求5所述的方法,其特征在于步骤(1)中所述的引物包括SEQ ID NO: 24-32所示的核苷酸序列的至少一种。
7.一种检测嗜肺军团菌的试剂盒,其特征在于包含权利要求2所述SEQ ID NO:1-23所示的核苷酸序列或其互补核苷酸序列的至少一种。
8.权利要求7所述的试剂盒,其特征在于还包含PCR扩增的引物,该引物具有SEQ ID NO: 24-32的核苷酸序列的至少一种。
9.根据权利要求8所述的试剂盒,其特征在于还包含杂交盒、杂交液。
10. 权利要求7所述的试剂盒在制备检测嗜肺军团菌O1、O2、O3、O4、O5、O6、O7、O11、O12、O13和O15 共11种血清型中至少一种致病菌方面的应用。
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