本发明涉及植物生物技术领域,具体涉及一种水稻抗白叶枯病基因xa5的分子标记及其应用。本发明提供由如SEQ ID NO.1‑3所示的引物扩增得到的水稻抗白叶枯病基因xa5的分子标记以及包括SEQ ID NO.1‑3所示引物的xa5基因特异性引物组合。该标记实现了只需将简易提取的DNA样品通过简单的PCR和PAGE凝胶电泳检测即可完成对xa5的基因分型,预测水稻白叶枯病抗性,具有基因分型准确、成本更低廉、检测通量和检测效率更高等优势,为水稻抗白叶枯病新种质的筛选和xa5基因在种质资源抗性改良中的应用提供了高效的方法。
一种生物技术领域的激发水稻产生抗病反应的无毒基因avrxa5,该基因序列为SEQ ID NO.1,序列长度为3717bp,基因上的酶切位点与avrBs3/PthA家族基因相同,102bp重复单元在基因内重复数为19.5;无毒基因avrxa5编码1238个氨基酸,氨基酸的序列为SEQ ID NO.2,由102bp编码的34个氨基酸重复单元在该蛋白中重复19.5次。本发明获得的avrxa5基因基因可作为水稻抗白叶枯病抗病育种的基因资源,将基因导入水稻白叶枯病菌PXO99A菌株后,可使含xa5抗病基因的水稻产生抗病性反应,使白叶枯病菌难以有效侵染水稻
本发明公开了一种水稻Xa7基因高精度分子标记Xa7‑SM5,分子标记的扩增引物选自下列引物对,正向5’TCTAGCTACAGAATCCGATCGAAT 3’,反向5’CCAATTAGCAATCCTGTGTACCAT其能用于含Xa7的水稻与不含Xa7的水稻之间的分子检测及其后代的标记辅助选择;当PCR扩增产物的电泳中含有如SEQ ID NO1所示序列时,为含Xa7的水稻;反之,则为不含Xa7的水稻。
本发明公开了一种水稻Xa7基因高精度分子标记Xa7‑SM7,正向引物5’CATGCACTGATATCTTTCCTCACA 3’,反向引物5’TCATATGCAATTCCTCCAAGTAG 3’。本发明还同时公布了上述水稻Xa7基因高精度分子标记Xa7‑SM7的用途用于含Xa7的水稻与不含Xa7的水稻之间的分子检测及其后代的标记辅助选择。当PCR扩增产物的电泳中含有如SEQ ID NO1所示序列时,为含Xa7的水稻;反之,则为不含Xa7的水稻。