所述引物探针组合包括用于检测百日咳鲍特氏菌的引物和探针,所述用于检测百日咳鲍特氏菌的引物包括上游引物和下游引物,其中,所述用于检测百日咳鲍特氏菌的上游引物如序列表中SEQ ID NO.1所示;所述用于检测百日咳鲍特氏菌的下游引物如序列表中SEQ ID NO.2所示;所述用于检测百日咳鲍特氏菌的探针如序列表中SEQ ID NO.3所示。本发明提供的引物探针组合和试剂盒,根据百日咳鲍特氏菌的基因序列,设计出特异性好的引物对和探针,提供的试剂盒仅能检测出百日咳鲍特氏菌,试剂盒特异性好。
本发明提供一种对鲍氏志贺氏菌2型(Shigellabodyii 2)的O-抗原特异的核苷酸,它是鲍氏志贺氏菌2型中控制O-抗原合成的基因簇的核苷酸全序列,如SEQ ID NO:1所示的分离的核苷酸,全长13234个碱基;或者具有一个或多个插入、缺失或取代的碱基,同时保持所述分离的核苷酸功能的SEQ ID NO:1的核苷酸;还包括源于鲍氏志贺氏菌2型的O-抗原基因簇中的wzx基因或与wzx有相似功能的基因和本发明通过PCR证实寡核苷酸对鲍氏志贺氏菌2型的O-抗原都有高度的特异性。本发明还公开了用本发明的寡核苷酸检测和鉴定人体及环境中的鲍氏志贺氏菌2型的方法。
本发明公开一种用于检测百日咳鲍特氏菌的引物探针组合。包括用于检测百日咳鲍特氏菌的上游引物、下游引物和探针,所述上游引物如序列表中SEQ ID NO.1所示;所述下游引物如序列表中SEQ ID NO.2所示;所述探针如序列表中SEQ ID NO.3所示。本发明还提供一种包含用于检测百日咳鲍特氏菌的引物探针组合的试剂盒及其应用。本发明提供的用于检测百日咳鲍特氏菌的引物探针组合和试剂盒,根据百日咳鲍特氏菌的基因序列,设计出高灵敏性的引物对和探针,提供的试剂盒仅能检测出百日咳鲍特氏菌,试剂盒特异性好。
本发明提供一种对大肠杆菌O167型和鲍氏志贺氏菌3型的O-抗原特异的核苷酸,它是大肠杆菌O167型和鲍氏志贺氏菌3型中控制O-抗原合成的基因簇的核苷酸全序列,如SEQ ID NO:1所示的分离的核苷酸,大肠杆菌O167型全长12864个碱基,鲍氏志贺氏菌3型全长12199个碱基;或具有一个或多个插入、缺失或取代的碱基,同时保持所述分离的核苷酸功能的SEQ ID NO:1的核苷酸;还包括源于大肠杆菌O167型和鲍氏志贺氏菌3型的O-抗原基因簇中的糖基转移酶基因和寡糖单位处理基因的寡核苷酸;本发明通过PCR证实寡核苷酸对大肠杆菌O167型和鲍氏志贺氏菌3型的O-抗原有高度特异性;本发明还公开了用本发明寡核苷酸检测和鉴定大肠杆菌O167型和鲍氏志贺氏菌3型的方法。