本发明公开了一种检测伊氏锥虫的引物对及其检测方法和试剂盒，通过针对PAG3基因在伊氏锥虫中部分特异缺失设计出一对能够特异性检测伊氏锥虫的引物对；所述引物对的序列如SEQ ID NO1和SEQ ID NO2所示；该引物对能特异性扩增出伊氏锥虫的PAG3片段，且灵敏度高，能够检测出仅仅含有50个锥虫的血液样本，或者是0.1ng的DNA样本；利用该引物对能够快速准确的将伊氏锥虫从其他锥虫以及利什曼原虫（Leishmania spp）中鉴定出来，不需要昂贵的显微镜和专业的病原学知识，检测快速方便，可用于动物锥虫感染的检测和混合感染的鉴定，有利于开展流行病学调查，预防和控制伊氏锥虫的传播。
本发明公开了一种检测路氏锥虫的引物对和试剂盒，即通过比对路氏锥虫和其他锥虫的大环序列，筛选出一对能够特异性检测路氏锥虫的引物对，所述引物对的序列如SEQ ID NO：1和SEQ ID NO：2所示；该引物对能特异性扩增出路氏锥虫的部分片段，且灵敏度高，能够检测出仅仅含有10个锥虫的样本，或者是10ng的DNA样本；利用该引物对能够快速准确的将其从其他锥虫亚属中，以及利什曼原虫（Leishmania amazonesis）鉴定出来，不需要昂贵的显微镜和专业的病原学知识，检测快速方便，可用于早期感染的检测，同时适用于动物锥虫混合感染的检测，有利于开展流行病学调查以及可能适用于人类感染路氏锥虫的检测
