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[发明专利]基于纳米孔测序同时获取病毒整合转录本和RNA修饰的检测方法和应用-CN202210932147.9在审
发明人：倪守峰;王伟伟;刘星宇;张利利;田埂 -专利权人：北京元码医学检验实验室有限公司
申请日： 2022-08-04 - 公布日： 2022-10-18 - 主分类号： C12Q1/70 文献下载
摘要：本发明公开一种基于纳米孔测序同时获取病毒整合转录本和RNA修饰的检测方法及应用。包括：获得生物样品的总RNA；使总RNA经过分离纯化得到mRNA；将mRNA与逆转录接头连接；使逆转录接头与纳米孔测序接头连接；通过链特异性测序，使带有病毒整合的mRNA的文库单链通过位于芯片的纳米孔，而不测序互补cDNA链，同时检测出病毒整合转录本和RNA上的修饰信息。此外，本发明的方法能够避免反转录和PCR中的偏好性，以及逆转录和扩增过程中对RNA修饰信息的丢失，保留RNA天然属性，获得多种碱基变异，结构变异与修饰信息，从而能够区分高度相似的异构体、识别新转录本。
基于纳米孔测序同时获取病毒整合转录 rna 修饰检测方法应用

[发明专利]基于三代测序的RHD、RHCE mRNA全长的测定方法及试剂盒-CN202211659889.5在审
发明人：刘忠;王珏;官笑羽;纪欣 -专利权人：中国医学科学院输血研究所
申请日： 2022-12-23 - 公布日： 2023-03-28 - 主分类号： C12Q1/6869 文献下载
摘要：本发明公开了基于三代测序的RHD、RHCE mRNA全长的测定方法及试剂盒，属于生物技术领域，解决现有技术不能测定RHD、RHCE mRNA全长，不能检测低水平剪切体、不能对转录本相对定量的问题。本发明测定方法包括：mRNA的抽提及cDNA逆转录；PCR扩增；三代测序文库构建及上机测序；测序数据过滤与质控；转录本的表达量分析。本发明的试剂盒包括有同时扩增RHD、RHCE转录本全长的引物。本发明成功利用长链单分子测序技术对RHD、RHCE基因进行全长转录本测序，检测出RhD阳性和Del型样本中RHD、RHCE基因的多种转录本，并可对不同转录本的表达水平进行相对定量，为揭示RH血型变异的分子机制提供了新方法
基于三代测序 rhd rhce mrna 全长测定方法试剂盒

[发明专利]疟原虫和猴D型逆转录病毒的检测试剂、试剂盒及双重PCR检测方法-CN202210963988.6在审
发明人：朱婷;杨玲焰;许姗姗;时长军 -专利权人：苏州西山生物技术有限公司
申请日： 2022-08-11 - 公布日： 2023-03-14 - 主分类号： C12Q1/70 文献下载
摘要：本发明涉及一种疟原虫和猴D型逆转录病毒的检测试剂、试剂盒及双重PCR检测方法，检测试剂包括引物、探针和阳性质控质粒，所述引物包括疟原虫上游引物、疟原虫下游引物、猴D型逆转录病毒上游引物和猴D型逆转录病毒下游引物，所述探针包括疟原虫探针、猴D型逆转录病毒探针a、猴D型逆转录病毒探针b，疟原虫扩增片段长度为199 bp，猴D型逆转录病毒扩增片段长度为122 bp。本发明能特异性识别疟原虫及猴D型逆转录病毒，本发明还揭示了采用该引物、探针的双重实时荧光定量PCR试剂盒，敏感性高、特异性强、重复性好，能够为非人灵长类实验动物临床诊断和疫情监控提供有力的支持。
疟原虫逆转录病毒检测试剂试剂盒双重 pcr 方法

[发明专利]莫洛尼氏鼠白血病病毒逆转录酶突变体及其表达方法和应用-CN200910036929.9有效
发明人：张芃伟;彭涛;周荣 -专利权人：广州华银医药科技有限公司;中国科学院广州生物医药与健康研究院
申请日： 2009-01-23 - 公布日： 2009-12-30 - 主分类号： C12N9/00 文献下载
摘要：本发明提供一种莫洛尼氏鼠白血病病毒逆转录酶的突变体及其制备方法和应用。该突变体为将莫洛尼氏鼠白血病病毒逆转录酶的自N端第196位脯氨酸残基取代为丙氨酸的蛋白质。本发明的莫洛尼氏鼠白血病病毒逆转录酶突变体的方法是将含莫洛尼氏鼠白血病病毒逆转录酶突变体编码基因的表达载体转化到大肠杆菌中，培养阳性克隆，表达得到莫洛尼氏鼠白血病病毒逆转录酶突变体。本发明的莫洛尼氏鼠白血病病毒逆转录酶改造所得到的逆转录酶的突变体具有保真功能。
莫洛尼氏鼠白血病病毒逆转录突变体及其表达方法应用

[发明专利]三重转录因子及其在哺乳动物蛋白表达系统的应用-CN201710658328.6有效
发明人：何南海;路杨;杨东晖;王骥 -专利权人：杭州阿诺生物医药科技有限公司
申请日： 2017-08-04 - 公布日： 2021-07-27 - 主分类号： C07K14/47 文献下载
摘要：本发明涉及基因工程技术领域，具体涉及三重转录因子及其在哺乳动物蛋白表达系统的应用。本发明提供了一种转录因子组合物，其含有ELL转录因子、AFF转录因子和CRTC转录因子，本发明提供了一种重组载体，其是将转录因子组合物克隆到哺乳动物表达载体中而得到。本发明还提供了一种哺乳动物蛋白表达系统，其通过将重组表达载体与目的基因表达载体共同转染到细胞株中表达得到，所述重组表达载体的总量与目的基因表达载体的总量的比为1：1‑5，或者通过将含有三重转录因子的目的基因表达载体转染到细胞株中表达得到
三重转录因子及其哺乳动物蛋白表达系统应用

[发明专利]高效RNA逆转录合成cDNA的方法-CN201210478994.9有效
发明人：白宪鹤;付光宇;李桂林;高利飞;张岚;马建军;吴学炜;苗拥军 -专利权人：郑州安图绿科生物工程有限公司
申请日： 2012-11-23 - 公布日： 2013-02-27 - 主分类号： C12P19/34 文献下载
摘要：本发明公开了一种高效RNA逆转录合成cDNA的方法，它是以正链RNA或mRNA为模板，使用逆转录引物，在逆转录酶的作用下进行cDNA的合成；其中：所选逆转录模板的目标区段的3’端依次称为特异性引物结合区R1、间隔区S和部分模板片段区R2；所用的逆转录复合序列引物由分别含有模板负链序列和正链序列的两段脱氧核苷酸片段组合而成：其中逆转录引物的3’端的P1区是一组和模板特异性引物结合区R1相互补的特异性脱氧核苷酸序列，逆转录引物的5’端的P2区是一组和部分模板片段区R2序列相同的特异性脱氧核苷酸序列。
高效 rna 逆转录合成 cdna 方法

[发明专利]杜绝光盘转录的方法-CN201010278217.0有效
发明人：方可成 -专利权人：方可成
申请日： 2010-09-10 - 公布日： 2012-04-04 - 主分类号： G11B20/00 文献下载
摘要：本发明涉及一种杜绝光盘转录的方法，主要是将一具有覆写模块的杜绝转录模块分散结合至欲保护数据文件来形成一杜绝转录数据文件，并把杜绝转录数据文件写入一不可复写式的光盘储存媒体；其中杜绝转录数据文件是透过杜绝转录模块的覆写模块分散排列于数据文件的各个数据区块之间，使杜绝转录数据文件依序排列成第一资料区块、第一覆写模块、第二组及第二组以上的数据区块及覆写模块。
杜绝光盘转录方法

[发明专利]音乐数据转录的方法-CN200510107954.3有效
发明人：施宣明 -专利权人：迈世亚(北京)科技有限公司
申请日： 2005-09-30 - 公布日： 2006-06-07 - 主分类号： G06F12/00 文献下载
摘要：本发明涉及一种音乐数据转录的方法，1.用户将外部移动存储设备连接到计算机，触发计算机操作系统运行音乐数据转录程序；2.音乐数据转录程序查找模块在计算机本地或外设上查找音乐数据文件，若存在则执行3；否则结束；3.音乐数据转录程序提取模块从计算机本地或外设上提取音乐数据文件；4.音乐数据转录程序转换模块将提取出的文件转换为另一格式；5.音乐数据转转录程序的存储模块将另一格式文件存储到外部移动存储设备中。将外部移动存储设备映射为具有自动运行功能的设备，利用自动运行功能自动启动音乐数据转录程序。本发明使用户能够方便地将计算机本地或外设上的音乐转换为其他格式并存储到外部移动存储设备中。
音乐数据转录方法

[发明专利]链置换引物和细胞转录组文库构建方法-CN202010515520.1有效
发明人：徐家伟;姚欢;孙莹璞;杨运桂;张楠;郭佳;杨莹 -专利权人：郑州大学第一附属医院
申请日： 2020-06-08 - 公布日： 2021-09-14 - 主分类号： C12N15/10 文献下载
摘要：本发明提供一种单细胞全转录组文库构建方法，其中本发明单细胞全转录组文库构建方法包括步骤：（A）逆转录细胞RNA，以产生相应于所述细胞RNA的第一链cDNA，其中逆转录RNA所使用的链置换引物的5′末端带有多个（B）由所述第一链cDNA产生相应的第二链cDNA，从而产生双链cDNA；（C）通过PCR扩增所述双链cDNA，其中PCR扩增所使用的扩增引物的5′末端带有T7启动子序列和（D）通过T7 RNA聚合酶转录PCR扩增得到的cDNA，本发明单细胞全转录组文库构建方法受转录本本身的含量影响小和能够准确反应样品中RNA的含量而不会受到PCR重复读长的影响，且其流程简单易行，成本低廉。
置换引物细胞转录文库构建方法

[发明专利]一种基于第三代测序的单细胞转录组测序方法-CN202010327919.7有效
发明人：范小英;苏丹 -专利权人：生物岛实验室
申请日： 2020-04-23 - 公布日： 2021-07-30 - 主分类号： C12Q1/6806 文献下载
摘要：本发明提供了一种基于第三代测序的单细胞转录组测序方法，所述方法包括以下步骤：(1)采用逆转录引物对单细胞RNA进行逆转录，得到带有条形码的cDNA；(2)对带有条形码的cDNA进行PCR扩增，将获得的不同单细胞来源的PCR扩增产物混合；或将不同单细胞来源的带有条形码的cDNA混合后进行PCR扩增；所述逆转录引物从5’端到3’端依次为锚定序列、条形码序列和poly dT。本发明在逆转录引物中添加条形码序列对单细胞全长RNA进行逆转录，实现了对不同单细胞来源的序列进行标记，对不同来源的DNA扩增产物混合达到了第三代测序平台对模板量的要求，利用第三代测序平台实现了对全长转录本的精确测序
一种基于第三代单细胞转录组测序方法

[发明专利]一种药物作用后差异转录表达谱及药物适应症的预测方法-CN202210257005.7有效
发明人：季序我;彭鑫鑫;余丹阳 -专利权人：普瑞基准生物医药（苏州）有限公司;普瑞基准科技（北京）有限公司;北京普康瑞仁医学检验所有限公司
申请日： 2022-03-16 - 公布日： 2022-05-17 - 主分类号： G16H70/40 文献下载
摘要：一种药物作用后差异转录表达谱及药物适应症的预测方法，包括：建立预测药物作用后差异转录表达谱的深度学习模型；基于深度学习模型预测药物作用后差异转录表达谱，预测包括不同细胞系、扰动时长与药物剂量条件下的差异转录表达谱；以及将预测获得的药物作用后差异转录表达谱与已有药物的差异转录表达谱进行相似性比较，预测药物的适应症。还公开了对应的系统、电子设备以及可读存储介质，直接通过药物的分子信息，预测药物在不同种类细胞系、不同剂量、不同处理时间后的差异转录表达谱，一定程度上减少临床前开发的资金与时间投入，与已知适应症药物的表达谱进行相似度计算
一种药物作用差异转录表达适应症预测方法

[发明专利]单细胞转录组与翻译组联合测序的多组学方法-CN201911164186.3有效
发明人：颉伟;熊竹清;邹卓宁 -专利权人：清华大学
申请日： 2019-11-25 - 公布日： 2022-08-26 - 主分类号： C12Q1/6869 文献下载
摘要：本发明提出了同时进行转录组测序和翻译组测序的方法，其特征在于，包括：将细胞与裂解缓冲液进行第一步裂解处理，以便得到第一裂解液；混匀并离心后，取上清液中部分所述第一裂解液，作为转录组模板，取剩余部分所述上清液与所述裂解缓冲液进行第二裂解处理，以便得到第二裂解液；将所述第二裂解液进行离心，收集上清液，作为翻译组模板；利用所述转录组模板获得转录组cDNA文库，并对所述转录组cDNA文库进行测序；从所述翻译组模板中提取出核糖体保护的RNA片段，本方法能够同时获得高质量的全基因组范围的转录组和翻译组数据，尤其适用于单细胞，从而为了解单细胞转录、翻译层次的协同调控提供可能性。
单细胞转录翻译联合多组学方法

[发明专利]DNA纳米技术与液相色谱联用的转录因子多通路检测方法-CN202010015149.2有效
发明人：周学敏;李昺之;陈月;严孝强;朱婉莹;王晶;卢巧云;洪俊丽 -专利权人：南京医科大学
申请日： 2020-01-07 - 公布日： 2022-10-04 - 主分类号： C12Q1/6844 文献下载
摘要：本发明公开了一种DNA纳米技术与液相色谱技术联用的转录因子多通路检测方法，该方法为：先用捕获有待测转录因子的探针修饰的磁珠捕获待测转录因子，将捕获的待测转录因子与对应掩蔽链序列结合，将待测转录因子的信号转化为核酸信号的释放然后核酸信号在对应扩增模板、Bst 2.0 DNA聚合酶、Nt.BstNBI核酸内切酶的作用下触发多通路等温扩增，产生具有多种编码的寡核苷酸作为信号DNA；最后采用高效液相色谱检测信号DNA，得到待测转录因子的浓度本发明检测方法过程简单，能够一次性同时检测多种待测转录因子，实现了多目标检测，在多通路检测中获得良好的检测结果，本发明检测方法方便、可靠地对不同保留行为的DNA报告进行定量定性分析，提高了检测效率。
dna 纳米技术色谱联用转录因子通路检测方法

[发明专利]循环无细胞DNA转录因子结合位点的甲基化水平分析方法及装置-CN202211059714.0有效
发明人：吕芳;黄宇;陈维之;杜波 -专利权人：臻和（北京）生物科技有限公司;臻悦生物科技江苏有限公司
申请日： 2022-09-01 - 公布日： 2022-11-25 - 主分类号： G16B20/30 文献下载
摘要：本发明提供了一种循环无细胞DNA转录因子结合位点的甲基化水平分析方法及装置，包括：接收待分析血浆样本的甲基化测序数据并从中提取循环无细胞DNA分子片段；提取转录因子结合位点上下游区域CpG位点的甲基化状态；以转录因子结合位点的基因组位置作为参照，将其上下游区域的CpG位点的坐标对齐；针对每个转录因子，分别统计各相对坐标上甲基化的CpG分子片段占比；计算转录因子结合位点中心点与侧翼区域的甲基化占比差值；将甲基化占比差值输入甲基化水平分析模型，根据甲基化水平分析模型的输出结果完成对待分析血浆样本循环无细胞DNA转录因子结合位点甲基化水平的分析，实现通过甲基化数据对转录因子的集合状态进行评估的目的。
循环细胞 dna 转录因子结合甲基化水平分析方法装置

[发明专利]基于转录因子的癌症早期筛查诊断方法-CN202211717385.4有效
发明人：李振聪;张轶群;万千惠;张怡然;裴志华;王东亮;牛孝亮 -专利权人：北京求臻医学检验实验室有限公司
申请日： 2022-12-30 - 公布日： 2023-04-07 - 主分类号： G16B20/30 文献下载
摘要：本发明涉及癌症筛查技术领域，尤其是指基于转录因子的癌症早期筛查诊断方法，包括以下步骤：S1，对样本进行测序获得下机数据进行拆分得到单个样本的测序数据，转换成FASTQ文件；S2，对FASTQ文件进行获得矫正的BAM文件；S3，从GTRD数据库中筛选得到可信转录因子，在每个转录因子结合位点计算上下游1000BP每个位置的深度，并取平均值；S4，上下游1000BP深度按照Savitzky‑Golay拆分成高频和低频信号，计算得TFscore；S5，筛选转录因子；S6，计算待测样本每个转录因子Zscore，最终取‑ΣlogPvalue作为该样本的指标。本发明中转录因子的选择不仅基于数据库，还使用自建队进行列筛；计算TFscore用的转录因子的选择，使方法具备鲁棒性,各批次样本中具有稳定性。
基于转录因子癌症早期诊断方法