本发明涉及一种百子莲赤霉素合成双加氧酶APGA20ox蛋白及其编码基因和探针,所述蛋白质为如SEQ ID NO.2所示的氨基酸序列组成的蛋白质。本发明还提供相应的核酸序列,以及检测探针;步骤如下:通过RACE技术分别扩增得到APGA20ox基因的3′和5′端,进行基因全长序列拼接和同源性分析,通过时空表达模式分析以及外源调控物质处理,分析APGA20ox为了验证本发明涉及的APGA20ox的功能,通过RNAi技术转化百子莲胚性愈伤组织,APGA20ox基因沉默可以得到矮化的百子莲植株,更加确切表明本发明涉及的APGA20ox核苷酸序列在百子莲株高改良中具有特异的效果本发明可调控百子莲赤霉素合成双加氧酶APGA20ox基因的时空表达特性,进而能够改变植物株高发育。