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[发明专利]药物与靶点间的相互作用关系预测方法及装置-CN202010824226.9在审
发明人：曹东升;印明柱;陈翔;杨素青;程岩 -专利权人：中南大学
申请日： 2020-08-17 - 公布日： 2020-12-25 - 主分类号： G16B15/30 文献下载
摘要：本申请涉及一种药物与靶点间的相互作用关系预测方法及装置，所述方法包括：获取待预测药物‑靶点对，待预测药物‑靶点对包括待预测药物的药物特征，以及待预测靶点的靶点特征；根据药物特征确定待预测药物与已知药物的相似度，根据靶点特征确定待预测靶点与已知靶点的相似度；根据待预测药物与各已知药物的相似度、待预测靶点与各已知靶点的相似度，以及药物与靶点之间的已知相互作用关系，确定待预测药物‑靶点对的相互作用关系预测结果。上述方法通过药物特征、靶点特征以及已知的药物靶点之间相互作用关系来预测药物靶点之间的相互作用关系，无需提前知道靶点蛋白的结构，使得药物‑靶点关系对的预测在实际情况中更容易实现。
药物靶点间相互作用关系预测方法装置

[发明专利]一种基于协同矩阵分解的药物靶点相互作用关系预测方法-CN201911301346.4有效
发明人：刘勇国;李杨;李巧勤;杨尚明 -专利权人：电子科技大学
申请日： 2019-12-17 - 公布日： 2023-04-28 - 主分类号： G16B15/30 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于协同矩阵分解的药物靶点相互作用关系预测方法，不仅考虑药物属性相似性和靶点属性相似性，同时结合药物拓扑结构相似性和靶点拓扑结构相似性，提高药物靶点相互作用关系预测准确率。包括：获取药物属性相似度和靶点属性相似度数据、药物靶点相互作用关系数据；构建药物属性特征相似度矩阵、靶点属性特征相似度矩阵、药物拓扑相似矩阵和靶点拓扑相似矩阵；对药物靶点关联矩阵进行基于图正则的协同矩阵分解，并整合药物和靶点的属性特征相似度和拓扑结构相似度信息，得到最终目标函数；用牛顿方法迭代更新得到药物和靶点的特征表示，重构药物‑靶点相互作用关系矩阵，进行药物靶点相互作用关系的预测。
一种基于协同矩阵分解药物相互作用关系预测方法

[发明专利]药物靶点相互作用分析方法、装置、设备及存储介质-CN202310857200.8在审
发明人：王俊 -专利权人：平安科技（深圳）有限公司
申请日： 2023-07-12 - 公布日： 2023-10-13 - 主分类号： G16B15/30 文献下载
摘要：本发明涉及人工智能技术及数字医疗领域，揭露一种药物靶点相互作用分析方法，包括：基于目标药物及目标靶点蛋白对预构建的药物靶点相互作用分析语句模板进行更新，得到相互作用分析任务语句；基于获取的药物靶点信息集中的每个药物靶点信息构建对应的药物靶点相互作用样本；基于所述药物靶点相互作用样本的格式，构建查询样本；基于所述相互作用分析任务语句、所述药物靶点相互作用样本及所述查询样本，利用预训练的大型语言模型进行自回归分析，得到相互作用关系分析结果。本发明还提出一种药物靶点相互作用分析装置、设备以及介质，可用于医疗领域，提高了药物靶点相互作用分析的便利性。
药物相互作用分析方法装置设备存储介质

[发明专利]基于网络药理学分析胎元饮作用靶点的方法-CN202210742050.1在审
发明人：郭鹊晖;欧阳秋芳;吴冬梅;游涛;林晴;许荣;汤丽珍 -专利权人：福建中医药大学附属第二人民医院（福建省第二人民医院）
申请日： 2022-06-27 - 公布日： 2022-10-11 - 主分类号： G16C20/50 文献下载
摘要：本发明公开了基于网络药理学分析胎元饮作用靶点的方法，属于医药技术领域，包括如下步骤：(1)检索筛选胎元饮中每种药物的成分，作为潜在活性成分；根据潜在活性成分筛选药物靶点；(2)检索疾病作用靶点；(3)药物靶点与疾病作用靶点取交集，获得药物‑疾病共同靶点；(4)构建药物‑成分‑靶点‑疾病网络，进行潜在活性成分排序，分析核心成分；(5)构建蛋白相互作用的PPI网络，筛选核心靶点；(6)根据药物‑疾病共同靶点进行关键靶基因GO富集分析与本发明通过药物及治疗对象之间的分子关联规律进行胎元饮作用靶点的解析，进而为药物作用机制的阐明以及临床合理用药、新药研发提供保障。
基于网络药理学分析胎元饮作用方法

[发明专利]基于网络药理学分析心力衰竭治疗药物作用靶点的方法-CN202210957369.6在审
发明人：陈美华;郭进建;黄飞翔;欧阳秋芳;严萍;陈飞;倪志坚;严锦贤;游涛;叶盈;谢胜伟;王永 -专利权人：福建中医药大学附属第二人民医院（福建省第二人民医院）
申请日： 2022-08-10 - 公布日： 2022-11-18 - 主分类号： G16H70/40 文献下载
摘要：本发明公开了基于网络药理学分析心力衰竭治疗药物作用靶点的方法，属于医药技术领域，包括如下步骤：分别对白术、丹参、桂枝、红参、黄芪、蒲黄、葶苈子、猪苓的成分进行检索筛选，获得潜在活性成分，以筛选药物靶点；检索心力衰竭疾病作用靶点；药物靶点与疾病作用靶点取交集，获得药物‑疾病共同靶点；构建药物‑成分‑靶点‑疾病网络，进行潜在活性成分排序，分析核心成分；构建蛋白相互作用的PPI网络，筛选核心靶点；GO富集分析与本发明通过药物及治疗对象之间的分子关联规律进行心力衰竭治疗药物作用靶点的解析，为药物作用机制的阐明以及临床合理用药、新药研发提供保障。
基于网络药理学分析心力衰竭治疗药物作用方法

[发明专利]一种确定药物和药物靶点关联关系的方法-CN201811382264.2有效
发明人：陈壮志;赖力鹏;郑昱豪;温书豪;马健 -专利权人：北京晶派科技有限公司
申请日： 2018-11-20 - 公布日： 2020-09-15 - 主分类号： G16C20/50 文献下载
摘要：本发明提供了一种确定药物和药物靶点关联关系的方法，包括步骤：采集表征药物、药物靶点、疾病和副作用之间关联关系的数据；基于所采集到的数据分别生成药物和药物靶点对应的向量；组合各药物和各药物靶点所对应的向量，以生成对应的各药物‑药物靶点向量；以及基于预定模型确定出表征药物‑药物靶点向量所对应的药物和药物靶点的关联关系的分值。基于该方法，本发明一并公开了一种异质信息网络和预测药物和药物靶点相互作用关系的方法。
一种确定药物关联关系方法

[发明专利]一种用于药物-靶点相互作用数据的清洗方法和装置-CN202210929570.3在审
发明人：焦阳;吴俊峰;潘麓蓉 -专利权人：慧壹科技（上海）有限公司;香港圆壹智慧有限公司;美国圆壹智慧科技有限公司
申请日： 2022-08-03 - 公布日： 2022-10-11 - 主分类号： G16B50/30 文献下载
摘要：本发明提供一种用于药物‑靶点相互作用数据的清洗方法，包括如下步骤：提供原始的药物‑靶点相互作用数据集合；对所述原始的药物‑靶点相互作用数据集合根据预定的清洗规则进行筛选过滤，获得待研究的药物‑靶点相互作用数据集合本发明还提供用于药物‑靶点相互作用数据的清洗系统。本发明提供一种对药物靶点蛋白的结构、功能等进行恰当描述和比较从而使得靶点蛋白的差异可以被量化的方法和系统。
一种用于药物相互作用数据清洗方法装置

[发明专利]一种融合多层药物结构信息的药物-靶点相互作用预测方法-CN202111313022.X在审
发明人：车超;张培良 -专利权人：大连大学
申请日： 2021-11-08 - 公布日： 2022-02-18 - 主分类号： G16B15/30 文献下载
摘要：本发明提供了一种融合多层药物结构信息的药物‑靶点相互作用预测方法。首先，对药物组学数据库中的药物和靶点信息进行预处理，提取具有相互作用的药物和靶点信息；其次，将药物SMILES分子指纹表示为分子图结构，使用分子补全图卷积神经网络和Transformer网络提取药物特征信息；然后，使用卷积神经网络对靶点序列信息进行处理，并提取靶点特征信息；最后，将提取到的药物特征信息和靶点特征信息送入分类模型中进行训练，保存模型，并对药物和靶点进行关系预测。本发明有效的提取了药物分子结构中的特征信息，在进行药物‑靶点关系预测时准确率更高，提高了药物‑靶点关系验证的效率和精度，有效的缩短了药物研发的周期，极大的降低了新药研发的成本。
一种融合多层药物结构信息相互作用预测方法

[发明专利]用于药物的靶点蛋白质预测方法及装置、设备、存储介质-CN202310525852.1有效
发明人：徐敏捷;耿威;李世博;吕川 -专利权人：上海微观纪元数字科技有限公司
申请日： 2023-05-11 - 公布日： 2023-08-01 - 主分类号： G16B15/30 文献下载
摘要：本发明提供了用于药物的靶点蛋白质预测方法及装置、设备、存储介质，预测方法包括：获取药物数据、靶点蛋白质数据以及相互作用数据；根据相互作用数据，构建多个药物数据与多个靶点蛋白质数据的第一相互作用关系；对第一相互作用关系进行调整，以将不确定值调整为结合可能值，得到第二相互作用关系；根据第二相互作用关系中至少一个药物数据与靶点蛋白质数据的结合可能值，对靶点蛋白质数据进行排序，并将排名在预设范围内的靶点蛋白质数据作为第一靶点蛋白质数据本发明通过第二相互作用关系中至少一个药物数据与多个靶点蛋白质数据的结合可能值，对多个靶点蛋白质数据进行排序，能够极大减少算力，从而提高对药物的靶点蛋白质的预测效率。
用于药物蛋白质预测方法装置设备存储介质

[发明专利]一种药物-靶点蛋白质相互作用预测的方法及系统-CN202211322181.0在审
发明人：张越;胡玉晴;刘晓勇;赵慧民 -专利权人：广东技术师范大学
申请日： 2022-10-26 - 公布日： 2023-04-04 - 主分类号： G16B15/30 文献下载
摘要：本发明公开了一种药物‑靶点蛋白质相互作用预测的方法及系统，其方法包括：获取待预测药物分子数据和待预测靶点蛋白质分子数据，并进行预处理；对所述预处理后的药物分子数据和靶点蛋白质分子数据进行特征提取；对所述药物分子和靶点蛋白质分子的隐特征进行筛选并进行拼接处理；对所述药物分子和所述靶点蛋白质分子之间的相互作用关系进行预测。本发明通过采用变分自编码器提取待预测药物分子和待预测靶点蛋白质分子的隐特征，并通过注意力机制进行筛选，最后基于多层感知机进行药物分子和靶点蛋白质分子之间的相互作用关系的预测，提高了预测精度，能够更好地实现药物与靶点蛋白质之间相互作用关系的预测
一种药物蛋白质相互作用预测方法系统

[发明专利]一种融合多维度特征的药物-靶点相互作用预测方法-CN202310038717.4在审
发明人：车超;姚奎 -专利权人：大连大学
申请日： 2023-01-13 - 公布日： 2023-06-02 - 主分类号： G16H70/40 文献下载
摘要：本发明提供了一种融合多维度特征的药物‑靶点相互作用预测方法；从医学数据库中提取具有相互作用的药物和靶点以及相关疾病和药物副作用的信息，并构建一个异构网络；使用异构图注意力神经网络提取异构网络中的拓扑结构特征；将药物SMILES分子序列表示为分子图结构，提取药物特征信息；同时提取靶点特征信息；将提取到的药物和靶点特征信息融入异构图注意力神经网络的消息传递过程中进行训练，保存模型，并对药物和靶点进行关系预测。本发明有效地利用了药物和靶标的生物特征信息，在进行药物‑靶点关系预测时具有更高的准确率，提高了药物‑靶点关系验证的效率和精度，有效缩短了药物研发周期，大大降低了新药研发成本。
一种融合多维特征药物相互作用预测方法

[发明专利]一种抗肿瘤药物的筛选靶点、应用及筛选方法-CN202010166309.3有效
发明人：姜恩鸿;赫卫清;夏明钰;王东;姜勋东;赵小峰 -专利权人：沈阳福洋医药科技有限公司
申请日： 2020-03-11 - 公布日： 2023-02-03 - 主分类号： A61K45/00 文献下载
摘要：本发明属于生物技术领域，公开了一种抗肿瘤药物的筛选靶点、应用及筛选方法。本发明一方面公开了一种筛选治疗和/或预防肿瘤药物的作用靶点，所述筛选治疗和/或预防肿瘤药物的作用靶点包括硒蛋白；以及一种筛选预防肿瘤转移药物的作用靶点，所述筛选预防肿瘤转移药物的作用靶点包括硒蛋白；另一方面公开了一种筛选治疗和/或预防肿瘤药物、预防肿瘤转移药物的方法：将候选药物与硒蛋白相互作用；根据候选药物与硒蛋白的亲和力筛选药物，将与硒蛋白亲和力强的候选药物作为候选初筛药物。本发明提供了一种新的抗肿瘤药物的筛选靶点和筛选方法，可以快速高效地筛选出治疗和/或预防抗肿瘤的药物、预防肿瘤转移药物。
一种肿瘤药物筛选应用方法

[发明专利]一种基于图表示和深度学习的药物发现方法-CN202210654570.7在审
发明人：林晓丽;张硕;张晓龙 -专利权人：武汉科技大学
申请日： 2022-06-10 - 公布日： 2022-09-06 - 主分类号： G16B15/30 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于图表示和深度学习的药物发现方法，应用于药物‑靶点相互作用预测和药物‑药物相互作用预测。该方法结合图表示学习和深度学习，基于DrugBank数据库、KEGG数据库和PharmGKB数据库整合与药物、靶点相关的数据，构建两个知识图谱：KG‑DTI知识图谱和KG‑DDI知识图谱。然后，利用改进的图表示学习模型(MHRW2Vec模型)，获得反映药物和靶点相互作用关系的特征向量。最后，将获得的特征向量输入到改进的TBAN模型中，用于药物‑靶点相互作用预测和药物‑药物相互作用预测。实验表明，本发明的方法可以更深入地发现药物与其潜在邻域之间的关系，有利于提高药物‑靶点相互作用和药物‑药物相互作用预测的精度。
一种基于图表深度学习药物发现方法

[发明专利]元学习药物-靶点相互作用预测系统及预测方法-CN202110467829.2有效
发明人：金淑婷;刘向荣;黄伟;曾湘祥 -专利权人：厦门大学
申请日： 2021-04-28 - 公布日： 2023-08-25 - 主分类号： G16B15/30 文献下载
摘要：元学习药物‑靶点相互作用预测系统及预测方法，涉及药物与靶点相互作用。系统包括知识图谱构建模块、知识图谱特征获取模块和元学习药物‑靶点相互作用预测模型；知识图谱构建模块用于生成以药物和靶点为中心的知识图谱数据集；知识图谱特征获取模块用于学习药物、靶点及其邻域的特征信息；元学习药物‑靶点相互作用预测模型用于利用知识图谱嵌入模块获取的药物和靶点特征来辅助关联预测。
学习药物相互作用预测系统方法

[发明专利]一种多模态药物-蛋白质靶点相互作用预测方法及系统-CN202211691945.3在审
发明人：王鹏磊;柳俊宏;刘勇;李欣泽 -专利权人：星希尔生物科技（上海）有限公司
申请日： 2022-12-28 - 公布日： 2023-04-18 - 主分类号： G16B15/30 文献下载
摘要：本发明公开了一种多模态药物‑蛋白质靶点相互作用预测方法，包括：S1，对药物分子进行特征编码从而获取药物分子的特征表示；S2，对蛋白质靶点进行特征编码从而获取蛋白质靶点的特征表示；S3，将多模态药物分子的特征表示和多模态蛋白质靶点的特征表示进行特征融合获得融合后的相互作用特征；S4，将融合后的相互作用特征作为分类器的输入，基于带标签训练集对预测模型进行训练后获得相互作用预测模型，从而基于相互作用预测模型预测药物分子和蛋白质靶点之间的相互作用。通过融合药物分子和蛋白质靶点的结构与语义多模态特征，对药物分子和蛋白质靶点完整充分描述，利用Transformer网络能够对相互作用有效建模，更准确的进行DPI预测。
一种多模态药物蛋白质相互作用预测方法系统

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