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[发明专利]生物医学实体展示平台的构建方法、装置和计算机设备-CN201910661861.7在审
发明人：何昆仑;石金龙;赵晓静;贾倩;贾志龙;吴世敬;杨鹏明 -专利权人：中国人民解放军总医院
申请日： 2019-07-22 - 公布日： 2019-12-10 - 主分类号： G06F16/34 文献下载
摘要：本发明涉及一种生物医学实体展示平台的构建方法、装置和计算机设备，所述方法包括：在文献数据库中获取与生物医学相关的文献摘要信息；对文献摘要信息中的生物医学实体数据进行识别；根据文献摘要信息训练实体关联分析模型，并根据训练后的实体关联分析模型输出识别后的各生物医学实体数据之间的关联关系，以构建生物医学实体库；将生物医学实体库中的数据进行图形化展示，以构建生物医学实体展示平台。通过上述方法，可以构建一个系统性、高质量的能够对众多生物医学实体数据进行分析和展示的生物医学实体展示平台。通过此平台，用户可以非常直观和便捷查看各个生物医学实体之间的关联关系以及生物医学实体的研究趋势。
生物医学构建实体数据实体展示摘要信息关联分析关联关系实体库计算机设备图形化展示文献数据库输出识别直观展示分析研究

[发明专利]生物医学大数据操作系统及生物医学大数据分析方法-CN202310573070.5在审
发明人：李亦学;张鑫;靖瑞锋;谭待;刘子青;于鸿磊;刘继龙;李召义;肖庆宇;陈易凡;李昭强;郎志坚;卢欣;杨广霞;程瑾瑜;肖华源;陈秭如;孙博文;周剑文;陈林 -专利权人：北京火山引擎科技有限公司;广州国家实验室
申请日： 2023-05-19 - 公布日： 2023-10-20 - 主分类号： G16B40/00 文献下载
摘要：本申请公开了一种生物医学大数据操作系统及生物医学大数据分析方法，该操作系统包括核心框架、外围组件、集成开发环境、应用仓库和数据仓库。外围组件提供了用户与该操作系统的交互接口。集成开发环境用于基于核心框架开发第一生物医学上层应用。应用仓库用于提供第二生物医学上层应用，数据仓库用于提供生物医学数据。如此，集成开发环境支持开发者更方便地开发适合生物医学的应用。应用仓库和数据仓库能够支持该操作系统的应用生态、数据生态。核心框架为该操作系统的核心部分，能够实现该操作系统中各种功能的组织和统筹管理，如基于核心框架执行生物医学分析项目时，可运行生物医学上层应用和调用生物医学数据，完成生物医学数据分析。
生物医学数据操作系统分析方法

[发明专利]用于生物医学模拟的系统和方法-CN201610608292.6有效
发明人：门冈良昌 -专利权人：富士通株式会社
申请日： 2016-07-28 - 公布日： 2019-04-09 - 主分类号： G16H50/50 文献下载
摘要：本发明公开了一种用于生物医学模拟的系统和方法。生物医学模拟系统基于心脏射血分数和心电图数据来确定是否执行生物医学模拟，并且在确定执行生物医学模拟时，基于层析图像来生成患者的心脏的生物医学模型。接下来，生物医学模拟系统基于生物医学模型来执行对患者执行手术之后患者的心脏的术后状况的生物医学模拟，并且确定生物医学模拟的结果是否满足与症状相关联的预定改善率。生物医学模拟系统在生物医学模拟的结果不满足预定改善率时确定不偿付针对患者的手术的医学治疗成本。当生物医学模拟的结果满足所述预定改善率时，生物医学模拟系统决定对患者执行手术。
用于生物医学模拟系统方法

[发明专利]基于文献的癌症相关生物医学事件数据库构建方法-CN202010629395.7有效
发明人：李丽双;连瑞源;黄梦佐;王泽昊;袁光辉 -专利权人：大连理工大学
申请日： 2020-07-03 - 公布日： 2022-09-20 - 主分类号： G06F40/279 文献下载
摘要：本发明属于自然语言处理技术领域，提供了基于文献的癌症相关生物医学事件数据库构建方法，由三大部分组成：1、基于实体关系图的生物医学实体及实体关系联合抽取；2、基于分层蒸馏网络的生物医学事件抽取；3、癌症相关的生物医学事件数据库构建在传统方法的基础上充分考虑生物医学文本中实体本身和上下文的特点，解决了生物医学事件抽取中存在的多类型实体识别及实体识别不完整的问题，并基于分层蒸馏网络获取更深层次的句法信息对生物医学事件进行抽取，提高复杂事件抽取的精度，能够帮助生物医学领域研究者对文本进行自动分析，可以提供对已知生物医学命名实体和生物医学事件检索的功能，帮助他们对生物医学相关文献进行研究和分析。
基于文献癌症相关生物医学事件数据库构建方法

[发明专利]一种基于生物医学文献的实体关系挖掘方法-CN202010208715.1有效
发明人：陈铭;陈琦;周银聪;胡大辉;吴文怡 -专利权人：浙江大学
申请日： 2020-03-23 - 公布日： 2022-05-27 - 主分类号： G06F16/35 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于生物医学文献的实体关系挖掘方法，包括以下步骤：(1)在公共数据库中查询疾病相关的生物医学文献，经数据预处理后，获得生物医学文本数据；(2)结合正则匹配模版和深度学习模型，对得到的生物医学文本数据进行生物医学命名实体识别本发明通过从网络上获取疾病相关的生物医学文献，抽取出摘要和标题并进行实体识别和关系挖掘，可有效地识别出文献中的生物医学名词实体，并挖掘出各类实体之间潜藏的关系。
一种基于生物医学文献实体关系挖掘方法

[发明专利]一种生物医学知识库的信息更新方法及系统-CN201710369021.4有效
发明人：王沫;朱延男;张梦龙;仓翠敏 -专利权人：至本医疗科技（上海）有限公司
申请日： 2017-05-23 - 公布日： 2018-09-18 - 主分类号： G06F17/30 文献下载
摘要：本发明提出了一种生物医学知识库的信息更新方法，包括如下步骤：第一生物医学知识库接收更新信息；第一生物医学知识库将更新信息生成临时版本信息；第一生物医学知识库将临时版本信息更新至第二生物医学知识库；第一生物医学知识库将临时版本信息升级为正式版本信息并存储；第二生物医学知识库用于生物医学研究的数据支撑和依据。本发明提供的一种生物医学知识库的信息更新方法及系统，让信息更新的历史可追溯查询，同时分离在用生物医学知识库和管理生物医学知识库，提高在用生物医学知识库的使用性能。
知识库生物医学信息更新版本信息更新信息版本信息更新生物医学研究使用性能数据支撑正式版本存储追溯查询升级管理

[发明专利]基于上下文向量图核的生物医学实体关系分类方法-CN201910037372.4在审
发明人：郑巍;林鸿飞 -专利权人：大连交通大学
申请日： 2019-01-15 - 公布日： 2019-06-11 - 主分类号： G06F16/28 文献下载
摘要：基于上下文向量图核的生物医学实体关系分类方法，属于生物医学文本挖掘和数据挖掘技术领域，解决生物医学文章中生物医学实体关系分类的问题。本发明方法包括S1、对生物医学文献进行文本处理；S2、句子的结构化表示；S3、构建上下文向量；S4、构建基于上下文向量的等价类划分；S5、基于等价类的上下文向量图核及特征提取；S6、归一化特征的权值；S7、构建生物医学实体关系分类模型；S8、预测生物医学文献中的生物医学实体关系。效果是能高效地对小语料长复杂句居多的生物医学文章中生物医学实体关系进行分类。
生物医学实体关系上下文向量构建图核分类等价类数据挖掘技术结构化表示分类模型特征提取文本处理文本挖掘归一化语料句子预测

[发明专利]生物医学文献摘要的结构化方法、系统、设备及介质-CN202111081575.7在审
发明人：王则远;周永杰;穆树仁;任丽军 -专利权人：灵犀量子（北京）医疗科技有限公司
申请日： 2021-09-15 - 公布日： 2021-12-24 - 主分类号： G06F16/34 文献下载
摘要：本发明提供生物医学文献摘要的结构化方法，包括：根据预设分类规则将生物医学文献摘要分类为完全结构化文献摘要、部分结构化文献摘要、或完全非结构化文献摘要，所述部分结构化文献摘要中包括待结构化部分和已结构化部分；利用生物医学文献摘要结构化模型对分类为部分结构化文献摘要或完全非结构化文献摘要的生物医学文献摘要进行结构化，得到生物医学结构化文献摘要；其中，所述生物医学文献摘要结构化模型基于摘要文本数据训练得到。本发明的生物医学文献摘要的结构化方法，能够保证对生物医学文献摘要的全部内容进行结构化，使得生物医学文献摘要的内容更加规范化，有效提高生物医学研究工作者的科研效率和创新效率。
生物医学文献摘要结构方法系统设备介质

[发明专利]基于预训练模型和自注意力机制的生物医学关系抽取方法-CN202010017867.3在审
发明人：张益嘉;于洪海;田方正;刘雨;张雨琪 -专利权人：大连理工大学
申请日： 2020-01-08 - 公布日： 2020-06-02 - 主分类号： G06F40/295 文献下载
摘要：本发明属于自然语言处理的技术领域，涉及一种基于预训练模型和自注意力机制的生物医学关系抽取方法。本发明使用ELMO预训练模型可以提取生物医学句子中更为复杂的信息，从而提升对生物医学文本的句子特征的表达效果，更好的提取生物医学实体之间的关系；加入位置特征学习到句子的内部结构和生物医学实体之间的位置关系，使用自注意力机制更好的捕捉到句子中的数据和特征的内部相关性，从而更好地完成生物医学关系抽取的任务。本发明解决当前生物医学关系抽取中大多只关注句子序列的简单语义的问题，不仅可以增强正规生物医学文本的关系抽取效果，对于社交媒体上的非正规的生物医学文本的关系抽取也有较好的效果。
基于训练模型注意力机制生物医学关系抽取方法

[发明专利]基于生物医学文献和领域知识数据的药物重定位预测方法-CN202010344114.3在审
发明人：张益嘉;于子洋;熊振康;杨宏伟;王健 -专利权人：大连理工大学
申请日： 2020-04-27 - 公布日： 2020-08-18 - 主分类号： G16C20/70 文献下载
摘要：本发明属于生物医学文献技术领域，具体涉及一种基于生物医学文献和领域知识数据的药物重定位预测方法。本发明基于深度学习模型和Attention机制，抽取生物医学文献中的药物重定位信息；基于异构网络模型，整合生物医学文献知识和领域数据；基于元路径模型和机器学习方法，在异构药物重定位关系网络中预测药物与疾病隐含作用关系本发明解决了当前药物重定位预测中无法有效整合非结构化文本数据和结构化领域数据源的问题，能够充分利用生物医学文献和领域数据提升药物重定位预测的准确性。
基于生物医学文献领域知识数据药物定位预测方法

[发明专利]基于多层神经网络与外部知识库的生物医学语义关系提取方法-CN201910357259.4有效
发明人：李辰;李质婧;马骁勇 -专利权人：西安交通大学
申请日： 2019-04-29 - 公布日： 2021-01-19 - 主分类号： G06F40/30 文献下载
摘要：本发明提供基于多层神经网络与外部知识库的生物医学语义关系提取方法，实现从生物医学文本中提取实体‑关系对，为挖掘海量生物医学文本数据，构建生物医学的关系网络提供技术支持。在不同数据集上都取得了较好的效果，能够高效、准确地从海量生物医学文本中提取语义关系。并且通过合理地引入外部生物医学数据库中的知识，包含针对单一实体的UniProtKB数据库以及针对二元关系的BAR、IntAct数据库，配合Attention机制可以有效地对单一实体信息进行筛选，提升外部知识的利用效果
基于多层神经网络外部知识库生物医学语义关系提取方法

[发明专利]联合attention机制与神经网络的生物医学实体关系分类方法-CN201810554915.5在审
发明人：林鸿飞;郑巍 -专利权人：大连理工大学
申请日： 2018-06-01 - 公布日： 2018-11-23 - 主分类号： G06K9/62 文献下载
摘要：一种联合attention机制与神经网络的生物医学实体关系分类方法，属于生物医学和数据挖掘技术领域，用以解决生物医学实体关系分类问题，要点是包括S1、基于指代解析的文本处理；S2、构建基于attention机制的模型输入向量；S3、构建基于双向LSTM的生物医学实体关系分类模型；S4、利用关系分类模型进行生物医学实体关系分类。本发明针对生物文献中的句子设计了基于following的指代解析，然后从构成句子的基本单位单词出发，利用attention机制加权于单词的嵌入向量，突出对生物医学实体关系分类有重要影响的关键词的权重，使候选实体间的关系更清晰明了，进行生物医学实体关系分类。
生物医学实体关系分类神经网络构建向量单词句子解析数据挖掘技术分类模型分类问题关系分类候选实体基本单位模型输入文本处理重要影响权重加权嵌入联合清晰

[发明专利]生物医学耗材采购分析系统及方法-CN202110150603.X在审
发明人：严太亨;严惠霖 -专利权人：严太亨;严惠霖
申请日： 2021-02-04 - 公布日： 2022-08-05 - 主分类号： G16H40/20 文献下载
摘要：本发明公开了一种可根据生物医学耗材的销售及使用数据进行分析的生物医学耗材采购分析系统，包括：分别在销售位置和使用位置识别和读取生物医学耗材的第一数据点和第二数据点，合并生成可读数据包后发出；交互装置获得在第二数据点的检测结果数据；采集生物医学耗材使用者的个人数据后与检测结果数合并生成可读数据包后发出；不同于前两个数据点的第三数据点接收可读数据包，判断在不同数据点接收的可读数据包之间是相互匹配的，得到生物医学耗材的生命周期数据；生命周期数据与所述检测结果数据和个人数据相结合，得到个人数据、购买习惯和相应的检测结果之间的相关性数据。
生物医学耗材采购分析系统方法

[实用新型]利用耳机插头执行数据传输的生物医学装置-CN201120363887.2有效
发明人：陈均裕 -专利权人：晶镭科技股份有限公司
申请日： 2011-09-26 - 公布日： 2012-09-05 - 主分类号： A61B19/00 文献下载
摘要：本实用新型为一种利用耳机插头执行数据传输的生物医学装置，包括：一量测单元、一微控制单元、一耳机麦克风插头、一开关单元、一准位迁移单元、一放大单元、与一电源管理单元。在本实用新型之中，通过将一生物医学装置的一耳机插头插入于一可携式电子装置的一耳机麦克风插孔，如此，使得该生物医学装置与该可携式电子装置进行数据传输，而不需要事先通过可携式电子装置制造商所规定的传输格式认证程序此外，使用者除了可以把生物医学数据输入该可携式电子装置之内，以通过可携式电子装置记录并追踪每日的生物医学数据，使用者亦可通过可携式电子装置将生物医学数据上传至一云端数据库之中，以作为远距医疗管理之用。
利用耳机插头执行数据传输生物医学装置

[发明专利]一种用于生物医学的数据统计系统及其分析方法-CN202011422018.2在审
发明人：郑思思;唐启盛;陈宝宇 -专利权人：郑思思
申请日： 2020-12-08 - 公布日： 2021-03-16 - 主分类号： G16H50/70 文献下载
摘要：本发明创造公开了一种用于生物医学的数据统计系统及其分析方法，其系统包括：信息录入装置、信息验证装置和存储装置，所述信息验证装置分别与信息录入装置和信息存储装置连接，其特征在于，所述信息验证装置还分别连接有生物医学信息库其方法包括：输入待解决问题；提取待解决问题关键词；选择所述关键词所匹配的生物医学数据；将所选择的匹配的生物医学数据进行存储本发明创造所述的提供了一种用于生物医学的数据统计系统及其分析方法，其能通过系统进行自动化信息收集并分析
一种用于生物医学数据统计系统及其分析方法

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