本发明公开了柑橘果胶乙酰酯酶CsPAE及其编码基因和应用。本发明公开了柑橘感病蛋白CsPAE，如SEQ ID NO:1所示，及其编码框架核酸序列，如SEQ ID NO:2所示。此基因属于柑橘果胶乙酰酯酶家族成员。本发明还保护一种柑橘抗细菌性溃疡病的育种方法，包括如下步骤：使用RNAi的方式降低目的植物中CsPAE蛋白的含量和/或活性，从而提高目的柑橘属对柑橘溃疡病的抗病性。本发明对于柑橘的抗溃疡病育种具有重大的应用价值，这将为柑橘溃疡病抗病遗传育种奠定基础，大力促进柑橘抗溃疡病基因工程的发展和应用。
本发明涉及一种与柑橘果皮红黄颜色性状相关的序列，其序列如SEQ ID NO:1所示，所述位于编码类胡萝卜素裂解双加氧酶的基因上游。本发明还提供了上述序列在柑橘育种中的应用；还提供了一种在育种过程中预测柑橘果皮颜色或其子代的果皮颜色的方法，包括检测编码类胡萝卜素裂解双加氧酶的基因的上游SEQ ID NO:1所示序列的存在与否和/或所述序列中的SNP位点的多态性的步骤；还提供了一种改变柑橘果皮颜色的育种方法。本发明对于柑橘外观色泽的遗传改良，提高育种效率，节约育种成本具有非常重要的指导意义。
本发明公开了CsLYK基因及其编码蛋白在提高柑橘溃疡病抗性的应用。所述CsLYK基因的编码蛋白为柑橘LysM类受体蛋白磷酸激酶，命名为CsLYK蛋白，CsLYK基因的核苷酸序列为SEQ ID No.1所示的核苷酸序列；蛋白序列为SEQ ID No.2所示的氨基酸序列。本发明还保护一种柑橘抗细菌性溃疡病的育种方法，包括如下步骤：将一个柑橘LysM类受体蛋白磷酸激酶编码基因通过超表达载体整合到柑橘中，有效提高柑橘对细菌性溃疡病的抗性。本发明对于柑橘的抗溃疡病育种具有重大的应用价值，这将为柑橘溃疡病抗病遗传育种奠定基础，大力促进柑橘抗溃疡病基因工程的发展和应用。
本发明提供了一种基于基因干扰提高柑橘对溃疡病抗性的方法，通过将柑橘属植物中长链脂肪醇氧化酶CsFAO3基因的部分编码序列即如SEQ ID NO:3所示的序列作为干扰序列，导入干扰载体中，通过农杆菌介导的遗传转化法整合到柑橘基因组中，有效提高柑橘对溃疡病的抗性。本发明的方法可对引起柑橘溃疡病的致病细菌的大部分进行了直接抑制，且所干扰的基因在大大提高柑橘对溃疡病的抗性的同时，最大程度上减少了对柑橘已知品质和性能的不良影响，开辟了柑橘抗溃疡病育种的另外一条途径，促进了柑橘抗溃疡病育种的发展
