本发明提供了一种条石鲷性别连锁的微卫星标记及遗传性别鉴定方法,属于基因工程技术领域。本发明公开了条石鲷雄性连锁的微卫星标记,核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,以及条石鲷性别连锁的微卫星标记的PCR引物,正义引物序列如SEQ ID NO:2所示,反义引物序列如SEQ ID NO:3本发明首次筛选到条石鲷性别连锁的微卫星标记,建立条石鲷遗传性别的鉴定方法;所述遗传性别鉴定方法具有准确、灵敏、可靠等优点,不仅对鱼类性别机制研究具有重要的科学价值,而且为鱼类性别控制和选择育种具有重要的意义和应用价值