本发明涉及在低盐和高盐渗透胁迫下杜氏盐藻(Dunlaliella virids)差异表达基因片段及其分离方法。本发明使用SAGE技术由极端模式生物盐藻(Dunaliellaviridis)中得到8个与盐胁迫相关的基因标签,通过PCR获得对应标签的基因片段,经RT-PCR验证这8个受盐胁迫诱导表达的基因片段SEQID NO:9~16,确实与盐胁迫相关基因。其中,SEQ ID NO:9~12所代表的4个基因在低盐渗透环境下高水平表达,在高盐渗透环境呈低水平表达;而SEQ ID NO:13~16所代表的4个基因在高盐渗透胁迫条件下高水平表达,低盐渗透胁迫条件下呈低水平表达为进一步研究盐藻耐盐分子机制奠定了基础。