本发明涉及编码RNA引导的DNA核酸内切酶的核酸分子,其是(a)编码包含SEQ ID NO:29、1或3的氨基酸序列或由SEQ ID NO:29、1或3的氨基酸序列组成的RNA引导的DNA核酸内切酶的核酸分子;(b)包含SEQ ID NO:30、2或4的核苷酸序列或由SEQ ID NO:30、2或4的核苷酸序列组成的核酸分子;(c)编码氨基酸序列与(a)的氨基酸序列至少90%、优选至少92%和最优选至少95%相同的RNA引导的DNA核酸内切酶的核酸分子;(d)包含与(b)的核苷酸序列至少90%、优选至少92%和最优选至少95%相同的核苷酸序列或由与(b)的核苷酸序列至少90%、优选至少92%和最优选至少95%相同的核苷酸序列组成的核酸分子;(e)相对于(d)的核酸分子简并的核酸分子;(f)对应于(a)至(d)中任一项的核酸分子的核酸分子,其中T被U替代。