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[发明专利]一种活动性肺结核蛋白表达差异质谱模型及构建方法-CN201210499636.6无效
发明人：李继承;徐丹丹 -专利权人：浙江大学
申请日： 2012-11-18 - 公布日： 2013-04-24 - 主分类号： G06F19/18 文献下载
摘要：本发明公开了一种活动性肺结核蛋白表达差异质谱模型及构建方法，通过比较活动性肺结核组与健康对照组、肺炎组、肺癌组、COPD组的蛋白质组学差异，获得活动性肺结核的蛋白表达差异质谱。此外，本发明还涉及活动性肺结核蛋白表达差异质谱模型构建的新方法，利用相对和绝对定量的同位素ITRAQ标记及串联质谱技术，能有效地对血清里的蛋白进行鉴定和相对定量，采用该技术能获得活动性肺结核病人血清中的蛋白表达差异质谱
一种活动性肺结核蛋白表达差异模型构建方法

[发明专利]基于血浆分泌蛋白与血浆piRNA的结直肠癌诊断方法及应用-CN202310110370.X有效
发明人：丁克峰;胡烨婷;陆玮;徐佳升;肖乾;刘军;代晓转 -专利权人：浙江大学
申请日： 2023-02-14 - 公布日： 2023-10-03 - 主分类号： C12Q1/6886 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于血浆分泌蛋白与血浆piRNA的结直肠癌诊断方法及应用，所述方法是采用Luminex流式荧光检测技术建立结直肠癌血浆分泌蛋白表达谱，以及采用小RNA转录组测序技术获得结直肠癌血浆piRNA表达谱，并联合血浆分泌蛋白表达谱和血浆piRNA表达谱，得到用于结直肠癌早期诊断的血浆细胞分泌蛋白与血浆piRNA组合，并基于血浆细胞分泌蛋白与血浆piRNA组合建立了结直肠癌早期诊断模型。本发明能够有效地区分结直肠癌患者与健康患者，有助于降低基因表达检测的成本，值得在临床应用中的推广。
基于血浆分泌蛋白 pirna 直肠癌诊断方法应用

[发明专利]基于血浆分泌蛋白与血浆miRNA的结直肠癌诊断方法及应用-CN202310110372.9有效
发明人：陆玮;丁克峰;胡烨婷;徐佳升;肖乾;刘军;代晓转 -专利权人：浙江大学
申请日： 2023-02-14 - 公布日： 2023-10-03 - 主分类号： C12Q1/6886 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于血浆分泌蛋白与血浆miRNA的结直肠癌诊断方法及应用，所述方法是采用Luminex流式荧光检测技术建立结直肠癌血浆分泌蛋白表达谱，以及采用小RNA转录组测序技术获得结直肠癌血浆miRNA表达谱，并联合血浆分泌蛋白表达谱和血浆miRNA表达谱，得到用于结直肠癌早期诊断的血浆细胞分泌蛋白与血浆miRNA组合，并基于血浆细胞分泌蛋白与血浆miRNA组合建立了结直肠癌早期诊断模型。本发明能够有效地区分结直肠癌患者与健康患者，有助于降低基因表达检测的成本，值得在临床应用中的推广。
基于血浆分泌蛋白 mirna 直肠癌诊断方法应用

[发明专利]抗体基因芯片的研制和应用-CN201210107180.4无效
发明人：朱有凯 -专利权人：朱有凯
申请日： 2012-04-13 - 公布日： 2013-10-30 - 主分类号： G01N33/577 文献下载
摘要：一种能够检测组织切片蛋白质表达谱的技术发明。由多个不同抗体同时与肿瘤组织多种待测蛋白质结合后，经PCR扩增的标识性V-D-J序列与抗体基因芯片杂交，通过杂交结果显示肿瘤组织的蛋白质表达谱；可选择性通过免疫组织化学显示其中某些蛋白质原位表达状况。可应用于临床检测患者个性化肿瘤相关性蛋白质表达谱，解决组织切片原位检测大量蛋白表达的难题，其次将蛋白质组研究成果直接应用于临床的诊疗过程，是实现疾病个性化治疗的重要前提。
抗体基因芯片研制应用

[发明专利]对在人类血清中指示人类肺组织的病理学状态的蛋白质的鉴定-CN201410482100.2在审
发明人： R·T·斯特里佩;E·伊兹比卡;S·H·贝克 -专利权人：癌症预防和治疗有限公司
申请日： 2008-09-11 - 公布日： 2015-01-21 - 主分类号： G01N33/68 文献下载
摘要：鉴定在人类血清中存在的蛋白质的方法，所述蛋白质在正常个体和按照医生诊断已知患有非小细胞肺癌和哮喘的患者之间差异地表达。将来自各个群体的人类血清试样用胰蛋白酶或任何其它合适的内切蛋白酶消化，并且使用液相色谱电喷雾离子化质谱仪进行分析。比较来自各个群体的质谱数据以确定具有在正常、哮喘和肺癌群体之间显著差异地表达的表达强度的蛋白质。发现11种蛋白质具有在所述群体之间显著差异地表达的表达强度。最后，通过将所述质谱数据与具有已知蛋白质的质谱数据文库的已知数据库比较，获得11种蛋白质的特征。
人类血清指示组织病理学状态蛋白质鉴定

[发明专利]对在人类血清中指示人类肺组织的病理学状态的蛋白质的鉴定-CN200880113342.7无效
发明人： R·T·斯特里佩;E·伊兹比卡;S·H·贝克 -专利权人：癌症预防和治疗有限公司
申请日： 2008-09-11 - 公布日： 2010-09-15 - 主分类号： G01N27/00 文献下载
摘要：鉴定在人类血清中存在的蛋白质的方法，所述蛋白质在正常个体和按照医生诊断已知患有非小细胞肺癌和哮喘的患者之间差异地表达。将来自各个群体的人类血清试样用胰蛋白酶或任何其它合适的内切蛋白酶消化，并且使用液相色谱电喷雾离子化质谱仪进行分析。比较来自各个群体的质谱数据以确定具有在正常、哮喘和肺癌群体之间显著差异地表达的表达强度的蛋白质。发现11种蛋白质具有在所述群体之间显著差异地表达的表达强度。最后，通过将所述质谱数据与具有已知蛋白质的质谱数据文库的已知数据库比较，获得11种蛋白质的特征。
人类血清指示组织病理学状态蛋白质鉴定

[发明专利]植物作为宿主在表达HIV中和抗体中的应用-CN201910129295.5在审
发明人：王跃驹 -专利权人：王跃驹
申请日： 2019-02-21 - 公布日： 2019-05-21 - 主分类号： C12N15/82 文献下载
摘要：本发明涉及生物技术领域，特别涉及植物作为宿主在表达HIV广谱中和抗体的应用。本发明利用植物例如生菜作为重组蛋白质生产的有效表达平台，利用简单以及有效的农杆菌介导真空渗透方法来表达HIV广谱中和抗体。该表达体系确定植物外源蛋白在农杆菌侵染4天后就可以收集。利用WesternBlot蛋白杂交法确定HIV广谱中和抗体成功表达，对HIV毒株SF162的中和活性测试表明利用生菜生产的HIV抗体具有中和HIV的生物活性。
广谱中和抗体宿主生菜重组蛋白质生产生物技术领域农杆菌介导农杆菌侵染表达体系蛋白杂交生物活性外源蛋白有效表达真空渗透中和活性中和抗体应用中和测试成功生产

[发明专利]一种糖尿病肾病血清标本中差异表达的蛋白质谱检测方法-CN202010868895.6在审
发明人：贺理宇;陈愔音 -专利权人：中南大学湘雅二医院;湖南省人民医院
申请日： 2020-08-25 - 公布日： 2020-12-15 - 主分类号： G01N27/62 文献下载
摘要：本发明属于疾病检测技术领域，公开了一种糖尿病肾病血清标本中差异表达的蛋白质谱检测方法，所述糖尿病肾病血清标本中差异表达的蛋白质谱检测方法包括建立和优化表面加强激光解吸电离飞行时间质谱技术模型；进行糖尿病肾病晨尿上清液、血清、肾脏皮质标本中蛋白质指纹图谱的确定以及诊断模型的建立；依据建立的蛋白质指纹图谱以及诊断模型进行糖尿病肾病血清标本中差异表达的蛋白质谱检测。本发明结合糖尿病肾病进行晨尿上清液、血清以及肾脏皮质标本中蛋白的测定以及模型建立，以该三者为检测对象，检测标本中的蛋白质的差异表达的组合结果，获得的模型可以为糖尿病肾病的诊断及病理机制提供参考信息。
一种糖尿病肾病血清标本差异表达蛋白质检测方法

[发明专利]一种检测差异表达蛋白质的方法-CN201310397694.2有效
发明人：刘超;宋春青;迟浩;孙瑞祥;董梦秋;贺思敏 -专利权人：中国科学院计算技术研究所
申请日： 2013-09-04 - 公布日： 2014-05-07 - 主分类号： G01N27/62 文献下载
摘要：本发明涉及一种检测差异表达蛋白质的方法，面向定量蛋白质组学中的基于一级谱图信息的标记和非标记的相对定量数据分析，包括肽谱匹配、可信度评价、肽段信号提取、肽段比值计算、蛋白质比值计算、统计学分析，根据某蛋白质在两种或多种样品中对应的质谱信号强度比值判断其是否是差异表达蛋白质对于近百GB的规模的质谱实验采集的数据，快速地自动化分析，对不同蛋白质在质谱仪中的信号尽可能精准地提取蛋白质信号；从统计学意义上确定蛋白质差异表达，并对结果的准确性进行评价。
一种检测差异表达蛋白质方法

[发明专利]大豆种子蛋白表达谱的构建方法及大豆蛋白表达谱在分析生物代谢途径中的应用-CN201811489089.7在审
发明人：邱丽娟;张明俊;赵宇杨 -专利权人：中国农业科学院作物科学研究所
申请日： 2018-12-06 - 公布日： 2019-04-09 - 主分类号： G01N30/02 文献下载
摘要：本发明提供了大豆蛋白表达谱的构建方法及大豆蛋白表达谱在分析生物代谢途径中的应用，属于蛋白表达谱构建技术领域。本发明采用SDS‑PAGE等技术得到大豆蛋白电泳胶片，通过对大豆蛋白电泳胶片分级，对分级蛋白分别进行胰蛋白酶酶解和液相色谱法质谱联用(LC‑MS)鉴定大豆蛋白的种类和含量。大豆蛋白根据电泳进行分级鉴定，有助于检测低含量的蛋白，避免低丰度的蛋白被高丰度蛋白覆盖，从而得到更多蛋白。通过对大豆蛋白的分级鉴定，从生物信息学的角度出发找到大豆蛋白的功能特征，并进行蛋白的分类与数据库构建，为从事大豆蛋白相关研究提供技术和数据支撑。
大豆蛋白表达谱蛋白构建蛋白表达谱代谢途径电泳胶片分级鉴定分析生物分级胰蛋白酶酶解高丰度蛋白生物信息学数据库构建液相色谱法电泳大豆种子功能特征数据支撑质谱联用低丰度多蛋白应用分类覆盖检测研究

[发明专利]日本血吸虫雌虫发育调控关键核糖体蛋白的鉴定方法-CN201410582375.3在审
发明人：孙军;王素文 -专利权人：同济大学
申请日： 2014-10-27 - 公布日： 2015-02-18 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：本发明涉及一种日本血吸虫雌虫发育调控关键核糖体蛋白的鉴定方法，包括以下步骤：用血吸虫尾蚴分别感染小鼠；对感染后的小鼠在SPF级动物房饲养；分别收集单性和双性感染的日本血吸虫雌虫；分别对该雌虫做solexa分析与iTRAQ分析；通过对比这四个发育阶段核糖体蛋白表达谱和基因表达谱，得到雌虫在不同发育阶段，核糖体蛋白在蛋白和基因两个水平的表达特点。与现有技术相比，本发明通过Solexa和iTRAQ组合分析雌雄血吸虫合抱前后雌虫核糖体基因表达谱和蛋白表达谱，并结合real-time PCR和western技术验证，可有效确定雌虫发育调控中关键核糖体蛋白该蛋白的鉴定将为通过影响虫体核糖体功能为目的，以干预宿主体内虫体发育并维持宿主伴随免疫保护力的防治措施的研发提供关键依据。
日本血吸虫发育调控关键核糖体蛋白鉴定方法

[发明专利]一种基于深度学习特征提取的胃癌蛋白质组学分型框架识别方法-CN202210175784.6在审
发明人：白明泽;赵雪霏 -专利权人：重庆邮电大学
申请日： 2022-02-24 - 公布日： 2022-05-27 - 主分类号： G16B40/00 文献下载
摘要：本发明属于人工智能和蛋白质组学领域，具体涉及一种基于深度学习特征提取的胃癌蛋白质组学分型框架识别方法，该方法包括：获取待识别的蛋白表达谱，对蛋白表达谱进行预处理；将预处理后的蛋白表达谱输入到训练好的自动编码器，提取自动编码器瓶颈层的节点，利用该节点进行一致性聚类，得到待识别蛋白表达谱的聚类标签；根据聚类标签训练分类器，对未知标签样本进行预测，完成胃癌蛋白质组学分型框架识别；本发明使用深度学习的自动编码器对来自多中心的二期
一种基于深度学习特征提取胃癌蛋白质学分框架识别方法

[发明专利]广谱细菌宿主绿色荧光蛋白表达载体的构建方法-CN200710133803.4无效
发明人：李国才;朱立天;王晓红;王劲松;焦红梅;季明春;龚卫娟;潘兴元 -专利权人：扬州大学
申请日： 2007-10-22 - 公布日： 2008-05-07 - 主分类号： C12N15/70 文献下载
摘要：广谱细菌宿主绿色荧光蛋白表达载体的构建方法，涉及微生物学领域。技术方案是：PCR扩增氨苄青霉素抗性基因的Amp启动子，将Amp启动子与绿色荧光蛋白结构基因连接，得到以其启动绿色荧光蛋白表达的广谱型原核表达载体。本发明利用能在细菌中广泛发挥作用的氨苄青霉素抗性基因(Amp)的启动子构建了一种广谱型GFP表达载体，所构建的载体表达GFP不受细菌型别和种类的限制，也不受细菌生长环境的限制，只要转化进细菌细胞，即可发挥作用，表达GFP，因而大大扩展了应用领域。
广谱细菌宿主绿色荧光蛋白表达载体构建方法

[发明专利]复杂样本的蛋白检测方法-CN201910351754.4有效
发明人：秦钧;汪宜;丁琛;李恺;宋雷;石文昊;刘明伟 -专利权人：北京谷海天目生物医学科技有限公司
申请日： 2019-04-28 - 公布日： 2022-01-07 - 主分类号： G01N30/88 文献下载
摘要：本发明提供了一种复杂样本的蛋白检测方法，该方法包括：对复杂样本进行色谱分离以及质谱扫描采集质谱数据，在质谱扫描采集质谱数据的过程中，采用DDA模式扫描采集的过程中穿插PRM模式的扫描采集；对质谱数据中的蛋白进行定性和定量分析，获得复杂样本的全谱蛋白的表达信息。通过对现有的两种质谱数据的采集模式进行调整，在DDA采集过程中穿插PRM采集模式对目标蛋白进行更准确地定量，在较短的时间范围内既获得了此类样本的全谱蛋白表达情况，也获得了目标蛋白的更准确的定量。该方法兼顾了DDA采集模式下蛋白全谱覆盖的高通量和PRM采集模式下靶向定量的高灵敏度和精确度的优点，且操作简单、耗时少、实验周期短。
复杂样本蛋白检测方法

[发明专利]蛋白质查找方法和设备-CN200780033987.5无效
发明人：寺本礼仁;皆川宏贵;上條宪一 -专利权人：日本电气株式会社
申请日： 2007-07-09 - 公布日： 2009-08-26 - 主分类号： G06F19/00 文献下载
摘要：一种蛋白质查找方法，其中基于通过蛋白质组分析获得的蛋白质表达谱图数据查找与信息直接或间接相关的蛋白质作为目标蛋白质，该方法包括基于通过对谱图数据中的信息和蛋白质表达量的监督学习获得的蛋白质的显著性选择与信息有关的蛋白质作为目标蛋白质；以及基于评估数据评估目标蛋白质的性能。
蛋白质查找方法设备

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