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[发明专利]基于有监督学习检测蛋白质复合物的方法及装置-CN202111558297.X有效
发明人：王荣全;赵贺;马惠敏;储华珍 -专利权人：北京科技大学
申请日： 2021-12-20 - 公布日： 2022-03-29 - 主分类号： G16B40/20 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于有监督学习检测蛋白质复合物的方法及装置，涉及蛋白质复合物检测技术领域。包括：构建具有权重的蛋白质相互作用网络；在具有权重的蛋白质相互作用网络中检测蛋白质复合物的核；根据有监督学习的蛋白质复合物模型训练方法，训练得到蛋白质复合物检测模型；基于局部搜索策略和构建好的蛋白质复合物检测模型，延伸蛋白质复合物的核形成蛋白质复合物；根据蛋白质复合物检测模型给蛋白质复合物进行打分并过滤掉低分且高度重叠的蛋白质复合物，得到挖掘出的蛋白质复合物。本发明能够进一步提高蛋白质复合物检测方法的精度；提取有效的拓扑特征描述蛋白质复合物；训练得到具有较强鲁棒性的基于有监督学习的蛋白质复合物模型。
基于监督学习检测蛋白质复合物方法装置

[发明专利]硝酸纤维素膜富集体液蛋白质组蛋白的用途-CN201210012275.8有效
发明人：刘雪姣;贾露露;高友鹤;李明喜;李雪梅;李学旺 -专利权人：中国医学科学院北京协和医院;中国医学科学院基础医学研究所
申请日： 2012-01-16 - 公布日： 2013-07-17 - 主分类号： G01N1/40 文献下载
摘要：本发明涉及硝酸纤维素膜富集体液蛋白质组蛋白的用途，特别是硝酸纤维素膜富集尿液蛋白质组蛋白、血清蛋白质组蛋白、血浆蛋白质组蛋白、脑脊液蛋白质组蛋白和组织液蛋白质组蛋白的新用途。本发明还涉及使用硝酸纤维素膜富集体液蛋白质组蛋白的方法，以及富集体液蛋白质组蛋白的试剂盒。
硝酸纤维素膜富集体液蛋白质组蛋白用途

[发明专利]蛋白质分解诱导标签及其用途-CN201680048166.8在审
发明人：宫本悦子;小泽正晃 -专利权人：学校法人东京理科大学
申请日： 2016-06-15 - 公布日： 2018-04-17 - 主分类号： C12N9/00 文献下载
摘要：本发明提供蛋白质分解诱导标签、蛋白质分解诱导分子以及它们的用途，所述蛋白质分解诱导标签为对蛋白酶具有亲和性且不抑制由蛋白酶导致的蛋白质分解的分子；所述蛋白质分解诱导分子为至少1个蛋白质分解诱导标签和能与蛋白质结合的至少1个蛋白质结合分子的缀合物。
蛋白质分解诱导标签及其用途

[发明专利]表达载体和蛋白质的制造方法-CN201380006276.4有效
发明人：小谷哲也;阿里木江·依地热斯;东田英毅 -专利权人：旭硝子株式会社
申请日： 2013-01-22 - 公布日： 2018-01-02 - 主分类号： C12N15/09 文献下载
摘要：本发明提供用于分泌要取得的蛋白质(Z)或具有该蛋白质(Z)部分的融合蛋白的表达载体、使用该表达载体的转化体的制造方法、该转化体和使用该转化体制造蛋白质的方法。表达载体，其特征在于，具有表达盒，该表达盒包含编码下述蛋白质(Y)的结构基因序列(y)、位于所述结构基因序列(y)的下游的编码作为要取得的蛋白质的蛋白质(Z)的结构基因序列(z)、用于表达包括所述蛋白质(Y)部分和所述蛋白质(Z)部分的融合蛋白的启动子序列和终止子序列，所述蛋白质(Y)为PDI1(蛋白质二硫键异构酶，Protein disulfide isomerase1)的全长蛋白质、PDI1的部分蛋白质或它们的突变蛋白质
表达载体蛋白质制造方法

[发明专利]从食品中分离蛋白质的方法-CN201110160614.2无效
发明人：赵成捘;徐尚铉;韩成旭;柳济熏;朴承源 -专利权人： CJ第一制糖株式会社
申请日： 2011-06-15 - 公布日： 2011-12-21 - 主分类号： A23J1/00 文献下载
摘要：本发明涉及一种采用等电点沉淀法从食品中分离蛋白质的方法，该方法包括：通过在介质中调节原料食品的pH值以获得蛋白质提取物；将蛋白质提取物的pH值调节为所需蛋白质的等电点以沉淀蛋白质；以及，通过离心处理沉淀的蛋白质以分离蛋白质滤液后，回收沉淀的蛋白质；该方法还进一步包括通过加热蛋白质提取物或者蛋白质滤液到60-145℃，以热沉淀蛋白质的步骤。根据上述方法获得的高产率蛋白质能够用作食品添加剂或者食品营养强化剂。
食品分离蛋白质方法

[发明专利]一种重组蛋白质微球及其制备方法和应用-CN202210254210.8在审
发明人：齐欣;崔晗;闫平平;毕孝瑞 -专利权人：齐欣
申请日： 2022-03-15 - 公布日： 2022-09-02 - 主分类号： B01J13/02 文献下载
摘要：本发明提出了一种重组蛋白质微球及其制备方法和应用，属于生物诊断技术领域，包括：S1.将结核分枝杆菌接种于TSB培养基中培养，离心，洗涤，加入蛋白酶抑制剂，超声，离心，得到菌体蛋白，与琼脂糖凝胶混合，孵育，洗涤，洗脱，得到结核分枝杆菌Rv1886c蛋白；S2.将结核分枝杆菌Rv1886c蛋白溶于水中，得到水相；S3.将PLGA、表面活性剂溶于有机溶剂中，得到油相；S4.将水相和油相混合后，加入PVA溶液，乳化，反应，离心，洗涤，干燥，得到重组蛋白质微球。本发明制得的重组蛋白质微球性能好、成囊成膜性强、制备方便，可以灵敏的用于制备结核病诊断或鉴定的药物及产品中，灵敏度高，特异性好，准确度高。
一种重组蛋白质及其制备方法应用

[发明专利]包含病原体关联性分子模式与抗原的组合物及其刺激免疫反应的用途-CN200680002615.1无效
发明人：汤玛斯·J·普威尔;弗利立安·纳卡尔;朗秋·尚;詹姆士·W·胡利特;威廉·F·麦当劳;杜安·D·黑威特 -专利权人：法克斯因内特公司
申请日： 2006-01-19 - 公布日： 2008-01-23 - 主分类号： C07K14/00 文献下载
摘要：本发明揭示一种组合物，其包括一种抗原的至少一部分以及一种缺少铰链区域的鞭毛蛋白的至少一部分。本发明还揭示一种组合物、融合蛋白质及多肽，其包括至少一种病原体关联性分子模式的至少一部分以及至少一种病毒蛋白质的至少一部分。本发明组合物、融合蛋白质及多肽的病毒蛋白质，是黄病毒蛋白质，其包括西尼罗黄病毒蛋白质、登革黄病毒蛋白质、冷岳黄病毒蛋白质、昆津黄病毒蛋白质、墨累谷脑炎黄病毒蛋白质、日本脑炎黄病毒蛋白质、壁虱性脑炎黄病毒蛋白质、黄热黄病毒蛋白质以及C型肝炎黄病毒蛋白质。本发明的组合物、融合蛋白质及多肽是用于在个体中刺激免疫反应。
包含病原体关联性分子模式抗原组合及其刺激免疫反应用途

[发明专利]泥炭生物菌体蛋白饲料的制作方法-CN200510043129.1无效
发明人：郭志忠;陈铁山;杜双田;郭强 -专利权人：郭志忠
申请日： 2005-08-22 - 公布日： 2006-02-08 - 主分类号： A23K1/00 文献下载
摘要：本发明提供一种以草本泥炭为原料，采用生物工程技术生产菌体蛋白饲料的方法。围绕微生物的同化异化作用、发酵的降解作用、酶所特有的催化性能、分解泥炭中的纤维素，合成新的蛋白质、氨基酸、维生素，提高饲料的营养价值。节约饲料用粮，原创性开辟菌体蛋白饲料来源新途径，为畜牧业的大发展提供丰富的物质基础。
泥炭生物菌体蛋白饲料制作方法

[发明专利]基于模块分解的蛋白质功能预测的方法、装置、设备-CN201910936767.8有效
发明人：郑莹;吴峥;展路彬 -专利权人：长沙理工大学
申请日： 2019-09-29 - 公布日： 2022-03-22 - 主分类号： G16B15/00 文献下载
摘要：本发明公开了基于模块分解的蛋白质功能预测的方法、装置、设备，包括以下步骤：将蛋白质互作网络数据输入到系统中；对蛋白质互作网络数据进行预处理；使用模块分解技术对目标蛋白质互作网络数进行分解，得到约简后的蛋白质网络约简图；将蛋白质网络约简图与蛋白质功能对应的网络数据进行匹配对比，得出蛋白质的功能；将模块分解技术运用在蛋白质互作网络中进行分解计算，可以快速有效地在蛋白质互作网络中查找关键蛋白，对分析蛋白质互作网络结构以及蛋白质复合物挖掘的处理速度更快
基于模块分解蛋白质功能预测方法装置设备

[发明专利]一种基于最小生成树Prim的蛋白质复合物识别方法-CN202010378184.0有效
发明人：梁冰;吕嘉庆 -专利权人：大连理工大学
申请日： 2020-05-07 - 公布日： 2023-03-10 - 主分类号： G16B20/00 文献下载
摘要：本发明提供一种基于最小生成树Prim的蛋白质复合物识别方法。本发明方法，包括：S1、计算蛋白质相互作用关系网中蛋白质节点的度，识别蛋白质相互作用关系网的蛋白质簇；S2、采用Prim生成树，对识别出的蛋白质簇进行扩展；S3、采用内聚性方法，判断每次扩展后的蛋白质簇的内聚性；S4、若蛋白质簇的内聚性增加，则继续扩展；若蛋白质簇的内聚性减小，则撤回此次扩展，并将此次扩展前的蛋白质节点加入到蛋白质簇中，得到蛋白质复合物集合。本发明提出的蛋白质识别方法能够对蛋白质复合物进行精准预测，识别正确率高。精准的蛋白质复合物识别能够有效的识别导致疾病的蛋白质复合物，为疾病的根源提供线索，为识别疾病基因和研发新的药物靶点提供依据。
一种基于最小生成 prim 蛋白质复合物识别方法

[发明专利]一种相对重要节点挖掘方法及系统-CN202210396436.1在审
发明人：刘前;赵娜;王剑;赵志丹;景铭;李杰;张农海;刘文涛;龙镇;王鑫锴;文俊杰;陈琳洁 -专利权人：云南大学
申请日： 2022-04-15 - 公布日： 2022-09-27 - 主分类号： G16B40/00 文献下载
摘要：本发明涉及一种相对重要节点挖掘方法及系统，涉及网络节点重要性分析领域，方法包括：获取蛋白质网络G，并确定已知酵母菌蛋白质集R和未知蛋白质集T；基于节点之间的最短距离，计算蛋白质网络G中所有蛋白质节点的距离分布；计算余弦相似度对应的权重、欧氏距离对应的权重以及相对熵对应的权重；计算未知蛋白质集T中所有蛋白质节点的相对重要性得分；对所有蛋白质节点的相对重要性得分进行排序，得分最高的蛋白质节点视为相对重要节点；所述相对重要节点为蛋白质网络G中未知的酵母菌蛋白质。本发明中的上述方法能够在已知某一些酵母菌蛋白质的前提下，从未知蛋白质集的所有蛋白质中找出未知的酵母菌蛋白质。
一种相对重要节点挖掘方法系统

[发明专利]采用果蝇优化方法识别蛋白质复合物-CN201610178586.X有效
发明人：雷秀娟;丁玉连;吴振强;裘国永 -专利权人：陕西师范大学
申请日： 2016-03-25 - 公布日： 2019-02-12 - 主分类号： G16B20/00 文献下载
摘要：一种采用果蝇优化方法识别蛋白质复合物，由如下步骤组成：将蛋白质相互作用网络转化为无向图、对蛋白质相互作用网络边和结点预处理、构建动态蛋白质相互作用网络、设置参数、形成果蝇的位置、对应果蝇到蛋白质相互作用的网络中、确定初始化果蝇位置、确定果蝇气味浓度、更新果蝇位置、产生蛋白质复合物、过滤蛋白质复合物。该方法考虑了蛋白质网络的动态性、蛋白质复合物内部核心‐附件结构以及蛋白质相互作用网络的局部性和全局性，能准确地识别蛋白质复合物。仿真实验结果表明，正确率、查全率等指标性能较优。与其他聚类方法相比，结合蛋白质网络和蛋白质复合物特性，实现蛋白质复合物识别过程，提高了蛋白质复合物的识别准确率。
采用果蝇优化方法识别蛋白质复合物

[发明专利]油料种子蛋白质分离物的生产-CN02813483.4无效
发明人： L·D·巴克;R·W·马滕斯;E·D·默里 -专利权人：伯康营养科学(MB)公司
申请日： 2002-05-03 - 公布日： 2004-08-25 - 主分类号： A23J1/14 文献下载
摘要：本发明以至少大约100wt％(Nx6.25)的高纯度产生了油料种子蛋白质分离物，特别是卡诺拉蛋白质分离物，在所用的方法中，油料种子蛋白质从油料种子粗粉中提取，产生的蛋白质水溶液浓缩至蛋白质含量至少为大约200g/L，蛋白质浓缩液加入温度低于大约15℃的冷水中形成蛋白质微胶粒，这些蛋白质微胶粒沉降形成蛋白质微胶粒团(PMM)。蛋白质微胶粒团和上清液分离，并可以被干燥。可以通过将上清液浓缩并干燥的方法对上清液进行加工，回收更多的油料种子蛋白质分离物，产生的蛋白质分离物中蛋白质的含量至少为大约90wt％。浓缩的上清液可以和至少部分PMM以不同的比例相混合，对混合物加以干燥产生蛋白质的含量至少为大约90wt％的蛋白质分离物中。
油料种子蛋白质分离生产

[发明专利]一种基于循环网络的蛋白质与蛋白质相互作用预测方法-CN202110086831.5在审
发明人：胡俊;樊学强;郑琳琳;董世建;白岩松;张贵军 -专利权人：浙江工业大学
申请日： 2021-01-22 - 公布日： 2021-05-25 - 主分类号： G16B15/30 文献下载
摘要：一种基于循环网络的蛋白质与蛋白质相互作用预测方法，首先，根据输入的待测定蛋白质‑蛋白质作用的蛋白质序列信息，生成蛋白质序列的残基组成特征、残基过渡特征、残基分布特征；其次，生成蛋白质序列的残基组成特征、残基过渡特征、残基分布特征；然后，生成蛋白质序列的残基组成特征、残基过渡特征、残基分布特征；再次，搭建循环神经网络框架，从PDB库中收集已有蛋白质‑蛋白质界面相互作用的蛋白质序列和标签，计算蛋白质序列的特征张量，与对应的标签组成数据集，使用循环神经网络框架在数据集上学习预测模型；最后，将待进行蛋白质‑蛋白质界面相互作用预测的特征向量输入模型中，得到界面作用预测结果。
一种基于循环网络蛋白质相互作用预测方法

[发明专利]一种在蛋白质芯片表面固定蛋白质的方法-CN03157199.9有效
发明人：王战会;靳刚 -专利权人：中国科学院力学研究所
申请日： 2003-09-18 - 公布日： 2005-03-23 - 主分类号： G01N33/68 文献下载
摘要：本发明涉及一种在蛋白质芯片表面固定蛋白质的方法。该方法使用组分A和组分B的无水乙醇溶液浸泡蛋白质芯片，所述组分A为能够使蛋白质芯片表面呈疏水性的有机化合物；所述组分B为一端含有能够与所需固定的蛋白质分子以共价连接的活性基团、一端含有极性基团的有机化合物；然后使用常规方法活化组分B的极性基团；最后将此蛋白质芯片放入所需固定的蛋白质溶液中浸泡。该方法固定的蛋白质比较稳定；而且能够有效降低蛋白质芯片表面与蛋白质分子间的相互作用，减少蛋白质芯片表面对蛋白质分子的空间构像的影响；通过这种方法固定的蛋白质的生物活性比通过物理吸附或单纯组分B固定的蛋白质生物活性提高
一种蛋白质芯片表面固定方法

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