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[发明专利]一种肿瘤分子分型预测系统-CN201610616774.6有效
发明人：王之琼;刘馨遥;李艳丽;曲璐渲;张锦辉;赵越 -专利权人：东北大学
申请日： 2016-08-01 - 公布日： 2018-10-23 - 主分类号： G16H50/30 文献下载
摘要：一种肿瘤分子分型预测系统，包括：基因表达数据提取模块：获取肿瘤基因表达数据；缺失值预处理器：对获取肿瘤基因表达数据进行缺失值填充；重要基因提取模块：提取肿瘤基因表达数据中决定生存时间的肿瘤重要基因；US‑ELM分子分型模块：利用US‑ELM对肿瘤重要基因数据进行肿瘤分子分型预测。本发明的肿瘤分子分型预测系统，克服了以往的针对肿瘤分子分型技术方法速度慢、泛化性能差、分类准确率低的缺陷，实现了快速且分类准确率高的肿瘤分子分型预测，并且能够对多个类别的肿瘤进行无监督机器学习。利用本发明系统进行肿瘤分子分型预测，能更好的判断肿瘤生物学行为，本发明的直接目的不是得到诊断结果，而是为制定个性化治疗方案提供参考依据。
一种肿瘤分子预测系统

[发明专利]一种基于高光谱成像的肿瘤基因分型系统及方法-CN202211605765.9在审
发明人：李玮;赵晗竹;雷晟暄;田崇轩;安皓源;张延冰;张振磊;宋峻林;赵宇航 -专利权人：山东大学
申请日： 2022-12-14 - 公布日： 2023-06-09 - 主分类号： G16B20/00 文献下载
摘要：本发明公开的一种基于高光谱成像的肿瘤基因分型系统及方法，包括：高光谱处理模块，用于获取肿瘤的高光谱图像，并从高光谱图像中提取每个像素点的光谱信息和每个波谱的影像信息；模型分析模块，用于通过获取的每个像素点的光谱信息、每个波谱的影像信息和训练好的肿瘤基因分型模型，获取肿瘤基因分型结果，其中，肿瘤基因分型模型以每个像素点的光谱信息和每个波谱的影像信息为输入，以肿瘤基因分型结果为输出，采用多核SVM模型构建获得。能够实现对肿瘤基因的准确分型。
一种基于光谱成像肿瘤基因系统方法

[发明专利]循环肿瘤细胞代谢分型标志物及其应用-CN201810047440.0有效
发明人：王前;蔡贞;陈静;郑磊;裘宇容 -专利权人：南方医科大学南方医院
申请日： 2018-01-18 - 公布日： 2021-08-03 - 主分类号： C12Q1/6886 文献下载
摘要：本发明公开了循环肿瘤细胞代谢分型标志物的应用，包括磷酸甘油酸激酶1PGK1和6‑磷酸葡萄糖脱氢酶G6PD。是从代谢活性的角度对循环肿瘤细胞(CTCs)进行功能分型，能更好地反映CTCs的变化趋势和生物学行为。在前列腺癌标本的验证结果表明与EMT分型相比，GM+CTCs亚型与肿瘤转移更为相关，并可作为肿瘤转移的辅助诊断标志物。因此，CTCs糖代谢分型是对CTCs计数和EMT表型分型的重要补充，可为临床疾病评估提供有益信息，在肿瘤转移诊断和监测中有良好的应用前景。
循环肿瘤细胞代谢标志及其应用

[发明专利]一种基于过表达人源HER-2的鼠源细胞肿瘤疫苗评价模型的构建方法-CN202310442447.3在审
发明人：胡策;谢鹏;唐玉巧 -专利权人：广州吉妮欧生物科技有限公司
申请日： 2023-04-21 - 公布日： 2023-08-18 - 主分类号： C12N15/867 文献下载
摘要：本发明属于生物医药技术领域，公开了一种基于过表达人源HER‑2的鼠源细胞肿瘤疫苗评价模型的构建方法。本发明利用生物信息学方法预测人源HER‑2蛋白在不同人群HLA分型以及小鼠MHC分型的抗原表位，并按亲和力阈值进行截断，然后构建相互匹配的抗原表位序列、HLA分型以及小鼠MHC分型组合；基于这些组合，可以根据目标HLA分型人群，去选择对应的肿瘤疫苗抗原表位序列，并用相匹配的小鼠品系和鼠源肿瘤细胞系来构建动物评价模型。所得动物评价模型能够更真实地反映和预测目标HLA分型人群的肿瘤疫苗疗效。
一种基于表达 her 细胞肿瘤疫苗评价模型构建方法

[发明专利]成熟B细胞肿瘤的分型标志物及其应用-CN202111013754.7有效
发明人：穆亚飞;李桂彬;蒙裕欢;陈禹欣;范喜杰;王冀;黄晓强;缪夏萍;陈涛;陈娜;林俊维;袁杰铖;夏阳;宋月;彭梓月 -专利权人：广州市金域转化医学研究院有限公司;广州金域医学检验中心有限公司
申请日： 2021-08-31 - 公布日： 2022-08-16 - 主分类号： C12Q1/6886 文献下载
摘要：本发明涉及一种成熟B细胞肿瘤的分型标志物及其应用，属于生物医学技术领域。该分型标志物包括175个血液肿瘤相关基因中的至少16个基因的组合，采用该分型标志物，能够在兼顾控制成本和分型诊断准确性的基础上，解决临床上部分疑难病例亚型诊断困难的情况并在初诊时辅助预后评估，对成熟B细胞肿瘤的分型诊断和分层精准治疗有十分重要的临床意义
成熟细胞肿瘤标志及其应用

[发明专利]基于随机丢弃的肿瘤分子分型方法及系统-CN202111413309.X在审
发明人：薛宇;林少峰;张玮之 -专利权人：华中科技大学
申请日： 2021-11-25 - 公布日： 2022-03-04 - 主分类号： G16B15/00 文献下载
摘要：本发明属于肿瘤组学分析领域，公开了一种基于随机丢弃的肿瘤分子分型方法及系统，该方法包括以下步骤：(S1)组学数据的预处理；(S2)初始分型的获得；(S3)随机丢弃迭代以优化分型：对差异特征分子进行随机丢弃；采用初始分型的聚类方法及距离计算方法，计算新分子亚型；对新分子亚型进行分型评估，若评估结果相较于初始分型的评估结果有变优或不变，则保留本次的丢弃；若评估结果有变劣，则取消本次的丢弃；如此重复随机丢弃，迭代运算，即可得到优化后的分型结果。本发明通过引入对特征分子随机丢弃(dropout)迭代优化处理，能够在不破坏不同肿瘤亚型的分子特征前提下，提升对肿瘤患者数据进行分型的效果。
基于随机丢弃肿瘤分子方法系统

[发明专利]基于抗血管治疗显著改变共表达基因模块的肿瘤分型方法-CN202310217562.0有效
发明人：白雪;于子航;张艳培;郭泽钦;董忠谊;吴德华 -专利权人：南方医科大学南方医院
申请日： 2023-03-08 - 公布日： 2023-10-24 - 主分类号： G16B25/10 文献下载
摘要：本发明公开基于抗血管治疗显著改变共表达基因模块的肿瘤分型方法，包括：获取抗血管治疗队列数据并筛选抗血管治疗显著改变的基因、在TCGA数据库泛癌种基因表达谱进行加权共表达网络分析、分析基因模块的生物功能及其在抗血管治疗中发挥的作用以及根据筛选的基因模块对肿瘤进行与治疗疗效和预后有关的分型；本发明通过抗血管治疗队列数据整合分析抗血管治疗基因表达谱，提供肿瘤抗血管治疗中表达显著改变的基因，并通过加权共表达网络分析构建共表达基因模块，再对基因模块进行筛选，对患者肿瘤的分型，使该分型方法与肿瘤抗血管治疗反应性和预后有极强的相关性，有助于肿瘤抗血管治疗决策并提高对抗血管治疗肿瘤微环境改变和治疗耐药的理解。
基于血管治疗显著改变表达基因模块肿瘤方法

[发明专利]肿瘤分子分型方法及装置、终端设备及可读存储介质-CN202110374936.0有效
发明人：周杨;赵义;方璐;杨滢;何骥;杜波 -专利权人：臻和（北京）生物科技有限公司;臻和精准医学检验实验室无锡有限公司
申请日： 2021-04-08 - 公布日： 2021-07-02 - 主分类号： G06K9/62 文献下载
摘要：本发明提供了一种肿瘤分子分型方法及装置、终端设备及可读存储介质，其中，方法包括：获取多个肿瘤组织样本的测序数据，并计算拷贝数数值；筛选各肿瘤组织样本中发生变异的基因；对发生变异的基因进行无监督聚类得到多个样本类别；筛选各样本类别样本间基因拷贝数变异显著的基因并无监督聚类得到多个基因类别；基于拷贝数变异计算第一主成分，并通过回归分析确定第一主成分对患者预后的影响；根据第一主成分对患者预后的影响计算各肿瘤组织样本的拷贝数变异分值，并根据该值对各样本类别的样本进行分类，完成对肿瘤的分子分型。其基于每个基因的拷贝数变异进行分子分型，分辨率高、分型精准，且可以显著区分不同分子分型肿瘤患者的预后。
肿瘤分子方法装置终端设备可读存储介质

[发明专利]一种基于高通量靶向测序分析的肿瘤化疗分型系统-CN202310904723.3在审
发明人：李天一;柳佳琦 -专利权人：上海信诺佰世医学检验有限公司
申请日： 2023-07-21 - 公布日： 2023-10-10 - 主分类号： G16B20/50 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于高通量靶向测序分析的肿瘤化疗分型系统，所述分型系统包括检测模块和分型模块；检测模块用于将基因组测序数据比对到人类参考基因组得到含有变异位点信息的文件；分型模块用于对含有变异位点信息的文件进行数据清洗，并结合单位点判型表得到单位点分型结果，再结合已知分型类型和化疗位点进行判型，判型结果包括杂合突变型、纯合突变型及未知类型；所述肿瘤化疗分型系统可以在进行分子生物学诊断时预测患者的化疗位点分型，可分型的点高达99％，准确率高，解决了肿瘤患者在进行化疗用药前缺少患者化疗位点分型结果，进而导致用药不明确的问题。
一种基于通量靶向分析肿瘤化疗系统

[发明专利]基于二代测序数据检测MHC II型肿瘤新生抗原的方法和装置-CN202210592146.4有效
发明人：但旭;王佳茜 -专利权人：深圳裕泰抗原科技有限公司
申请日： 2022-05-27 - 公布日： 2022-12-27 - 主分类号： G16B30/10 文献下载
摘要：本申请公开了一种基于二代测序数据检测MHC II型肿瘤新生抗原的方法和装置。本申请方法包括，分别获取肿瘤样本DNA和RNA测序数据，比对到人全基因组参考序列，分析鉴定肿瘤样本HLA分型，发生变异的基因，并将发生变异的基因翻译为氨基酸序列，将其作为候选集，分析各基因表达量值TPM，最后，根据HLA分型和MHC II型肿瘤新生抗原预测模型，从候选集中筛选表达量值TPM大于TPM阈值的氨基酸序列，作为MHC II型肿瘤新生抗原。本申请方法，直接通过二代测序数据预测MHC II型肿瘤新生抗原，解决了肿瘤免疫治疗中对II型新生抗原预测和筛选的迫切需求，为肿瘤免疫研究和针对新生抗原的免疫治疗提供了帮助。
基于二代序数检测 mhc ii 肿瘤新生抗原方法装置

[发明专利]一组用于肿瘤分子分型的基因及其应用-CN201510550924.3有效
发明人：徐清华;杜祥;王奇峰;陈金影;杨扬 -专利权人：杭州源清生物科技有限公司
申请日： 2015-09-01 - 公布日： 2018-09-07 - 主分类号： C12N15/11 文献下载
摘要：本发明公开了一组用于肿瘤分子分型的基因，包括ACPP基因、AGR2基因等38个基因。此外，本发明还公开了一种用于肿瘤分子分型的试剂盒及应用。本发明有助于识别肿瘤的组织来源，在获得肿瘤样本后，可通过对上述基因组的检测和联合分析，客观准确地判别该肿瘤样本的组织起源和癌症类型，从而对患者进行有针对性的治疗。
一组用于肿瘤分子基因及其应用

[发明专利]肿瘤确定系统、方法及存储介质-CN201910146428.X有效
发明人：淳秋坪;石峰;詹翊强 -专利权人：上海联影智能医疗科技有限公司
申请日： 2019-02-27 - 公布日： 2020-09-29 - 主分类号： G06T7/00 文献下载
摘要：本发明实施例公开了一种肿瘤确定系统、方法及存储介质。用于从被检组织的病理图像提取一种或多种尺寸的分析图像；分析模块，用于基于一个或多个已训练的检测模型对所述分析图像进行分析以得到多个分类特征，其中，每个已训练的检测模型用于确定至少一种分类特征；输出模块，用于根据分类特征确定并输出肿瘤识别结果本发明实施例的技术方案，可以解决现有技术中肿瘤分型依赖医生的经验，肿瘤分型的准确性较低的问题，达到了自动进行肿瘤分型和肿瘤分级的技术效果。
肿瘤确定系统方法存储介质

[发明专利]一种用于判断早期子宫内膜癌预后的制剂及复发风险模型-CN202110329816.9有效
发明人：于双妮;宗丽菊;陈杰;向阳;卢朝辉;曹冬焱;杨隽钧;常晓燕;姜英;李冬梅;贾丛伟;周娜 -专利权人：中国医学科学院北京协和医院
申请日： 2021-03-26 - 公布日： 2022-07-01 - 主分类号： C12Q1/6886 文献下载
摘要：本发明通过测序判断POLE突变状态，通过免疫组化方法检测4中错配修复蛋白、p53及VISTA，通过显微镜下观察判断肿瘤的组织学级别及免疫组化结果，从而确定内膜癌的分子分型、肿瘤级别和VISTA的表达，然后赋予风险分值，对分子分型中的POLE突变型0分，dMMR和NSMP型1分，p53型2分；对于VISTA阳性赋予0分，VISTA阴性赋予1分；高级别肿瘤赋予1分，低级别肿瘤赋予0分。总的风险评分为上述3项得分之和，总分范围0–4分：0–1分为低危，2分为中危，3–4分为高危。
一种用于判断早期子宫内膜预后制剂复发风险模型

[发明专利]一种基于lncRNA标记物的肿瘤免疫分型方法-CN202010134636.0有效
发明人：姚和瑞;宋尔卫;余运芳;区绮云;张文达;李岸霖 -专利权人：中山大学孙逸仙纪念医院
申请日： 2020-03-02 - 公布日： 2022-05-10 - 主分类号： C12Q1/6886 文献下载
摘要：本发明提供了一组肿瘤免疫分型的长链非编码RNA(lncRNA)标记物，共包括49个lncRNA。本发明还提供了一种基于上述lncRNA标记物肿瘤免疫分型的方法，该方法将49个lncRNA分组，并联合细胞毒性T淋巴细胞(CTL)表达量进一步将患者分层聚类分为免疫激活型(Immune‑Active Class)、免疫排除型(Immune‑Exclusion Class)、免疫失调型(Immune‑Dysfunctional Class)和免疫沙漠型(Immune‑Desert Class)四组。本发明的肿瘤免疫亚型分类方法，与预测抗肿瘤免疫治疗的总体存活率和反应性具有极强的相关性，并且具有高度客观性、准确性及重复性的特点。这一分类方法的建立，为恶性肿瘤患者抗免疫治疗的疗效与预后提供预测指标。
一种基于 lncrna 标记肿瘤免疫方法

[发明专利]一种质谱流式血液肿瘤免疫分型中替代侧向散射光信号的抗体组合及应用-CN202210375754.X有效
发明人：林铖;仇陈盛 -专利权人：浙江普罗亭健康科技有限公司
申请日： 2022-04-11 - 公布日： 2022-09-27 - 主分类号： G01N15/14 文献下载
摘要：本发明公开一种质谱流式血液肿瘤免疫分型中替代侧向散射光信号的抗体组合，为Lactoferrin抗体和Lysozyme抗体。本发明还公开一种质谱流式血液肿瘤免疫分型的圈门方法。本发明还公开一种质谱流式血液肿瘤免疫分型的试剂盒。CD45抗体进行两级圈门策略，配合质谱流式细胞仪，能够取代传统流式CD45/SSC对于骨髓中成熟粒细胞，单核细胞，有核红细胞，淋巴细胞，原始及幼稚细胞，异常细胞亚群等各亚群的区分，突破了质谱流式在血液肿瘤细胞分析中无法检测SSC的技术难题，结合质谱流式多参数高通量特性，能够提高目前血液肿瘤的免疫分型深度。
种质谱流式血液肿瘤免疫分型中替代侧向散射信号抗体组合应用

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