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[发明专利]一种基于基因大数据进行祖源分析预测的算法-CN202010000024.2在审
发明人：罗奇斌;申玉林;廖胜光;任毅 -专利权人：北京奇云诺德信息科技有限公司
申请日： 2020-01-07 - 公布日： 2020-05-29 - 主分类号： G16B20/20 文献下载
摘要：本发明涉及基因大数据祖源分析预测技术领域，且公开了一种基于基因大数据进行祖源分析预测的算法，包括祖源成分样本数据的收集、数据预处理、祖源成分分析预测、Y染色体单倍群分析、线粒体单倍群分析、结果展示。目前市场上祖源分析技术多使用开源数据库，其中有关中国个体的样本量较少，导致血统和单倍群分型不准确、不够细致等，这里我们在开源数据库的基础上添加本公司收集的大量中国人样本数据，同时对源数据进行进一步优化，
一种基于基因数据进行分析预测算法

[发明专利]一种快速选择繁殖用肉牛系祖的方法-CN201910696150.3在审
发明人：吕世杰;陈付英;张子敬;滑留帅;王二耀;徐照学;魏成斌;施巧婷;柏中林;王泰峰 -专利权人：河南省农业科学院畜牧兽医研究所
申请日： 2019-07-30 - 公布日： 2019-10-11 - 主分类号： C12Q1/6888 文献下载
摘要：本发明涉及一种快速选择繁殖用肉牛系祖的方法，属于肉牛选育技术领域。本发明中的快速选择繁殖用肉牛系祖的方法，综合利用基因组信息、亲缘关系、聚类分析和表征数据等对群体进行分群和个体选择，可用于系祖建系法选育肉牛新品系并避免近亲交配。本发明方法的有益效果是：第一，本发明基于全基因组数据计算待选群的遗传距离，计算结果准确可靠；第二，本发明依据遗传距离进行聚类分析，可对群体进行准确、快速的分群，为选育过程中避免近亲交配提供理论依据；第三，本发明结合基因型和表型数据确定系祖，选择更加高效准确；第四，本发明能快速确定系祖所在亚群，解决近交衰退的问题。
肉牛快速选择聚类分析遗传距离繁殖交配分群基因组信息表征数据个体选择结合基因快速确定亲缘关系全基因组数据计算数据确定新品系表型可用群体亚群衰退

[发明专利]一种小麦骨干亲本染色体中心区祖系单倍群骨架特异性引物对及其开发方法-CN202310789539.9在审
发明人：郭伟龙;孙其信;王梓豪;汪永法;陈哲;王文熙;谢小明;彭惠茹;倪中福;宿振起 -专利权人：中国农业大学
申请日： 2023-06-29 - 公布日： 2023-10-10 - 主分类号： C12Q1/6895 文献下载
摘要：本发明公开了一种小麦骨干亲本染色体中心区祖系单倍群骨架特异性引物对及其开发方法。
一种小麦骨干亲本染色体中心区祖系单倍群骨架特异性引物及其开发方法

[发明专利]一种Y单倍群检测方法-CN201710203496.6有效
发明人：姚笑天;王传超;唐森威;陈钢;郑强 -专利权人：深圳市早知道科技有限公司
申请日： 2017-03-30 - 公布日： 2020-05-12 - 主分类号： G16B20/30 文献下载
摘要：本发明涉及一种Y单倍群检测方法，包括以下步骤：获取用于参照的Y单倍群树的参照Y单倍群树信息，其中，参照Y单倍群树信息包括Y单倍群树中每个参照单倍群的参照单倍群信息；将每个参照单倍群信息与测试SNP信息进行匹配，得到至少一个满足预设条件的目标参照单倍群；根据目标参照单倍群的参照单倍群坐标信息，获取与目标参照单倍群相关的第一数值与第二数值，并对每个目标参照单倍群进行评分，输出评分最高的目标参照单倍群所对应的结果信息本发明实施例通过将参照单倍群与测试单倍群进行比对，基于从根节点出发到目标单倍群的路径的评分系统，可以同时适用二代测序结果和高通量micro array的SNP分型结果，检测适用性更高，提高检测手段的应用广泛度
一种单倍群检测方法

[发明专利]荧光复合扩增体系、试剂盒及其应用-CN201911323640.5有效
发明人：于在亮;杨凡;郑玉;高运通;李逸凡;陈初光;张蕊 -专利权人：苏州阅微基因技术有限公司
申请日： 2019-12-20 - 公布日： 2021-08-27 - 主分类号： C12Q1/6858 文献下载
摘要：本发明公开了一种荧光复合扩增体系、试剂盒及其应用，所述的荧光复合扩增体系包括多对特异引物，其核苷酸序列如SEQ ID NO.1‑71所示，并将所述的荧光复合扩增体系制作试剂盒，将所述制备的试剂盒应用于法医DNA分析和祖源分析中本发明所提供的Y‑SNP包含了众多单倍群，对于男性群体区分度高，试剂盒独特新颖，信息量大，兼容性好。
荧光复合扩增体系试剂盒及其应用

[发明专利]各人种单倍型祖源数据库的构建方法-CN202210564500.2在审
发明人：宋清;马丽 -专利权人：广州鸿溪见杉科技有限公司
申请日： 2022-05-23 - 公布日： 2022-07-22 - 主分类号： G16B50/00 文献下载
摘要：本发明公开了各人种单倍型祖源数据库的构建方法，步骤包括：大小不同的提取框从各人种的单倍型序列提取信息，并标记人种信息；比对同一人种内SNP位点相同的片段，将SNP位点相同且SNP位点上碱基信息相同的片段进行合并本发明优点有：同一单倍型的遗传信息在不同SNP位点数量的片段中储存，利于待测单倍型比对；SNP位点相同且SNP位点碱基信息相同的片段均标记其对应的所有人种信息，避免在查找疾病关联基因时受到祖源信息不全的干扰而影响准确性
各人种单倍型祖源数据库构建方法

[发明专利]基于大数据人工智能算法的祖源多态性预测方法-CN202011106993.2在审
发明人：刘望霞 -专利权人：深圳市盛景基因生物科技有限公司
申请日： 2020-10-16 - 公布日： 2021-01-15 - 主分类号： G16B20/20 文献下载
摘要：本发明公开了基于大数据人工智能算法的祖源多态性预测方法，包括如下步骤；S1、选取千人基因组数据；S2、对部分不同人群中筛选多个微单倍型位点，根据不同人群的平均有效等位基因数进行大小分类；S3、对部分不同人群进行群体结构分析，对着不同人群进行来源分类；S4、根据信息度值和平均有效等位基因数值挑选出多个微单倍型位点。本发明通过使用微单倍型对人群基因进行检测分类，其具有较好的高度多态性、低突变率和长度优势，可以较好的对人群的基因以及来源地进行预测分析，准确率较高，通过根据信息度、固定指数和有效等位基因数等指标挑选出多个二等位基因SNP位点、多个三等位基因SNP位点和多个微单倍型位点来分别祖源的准确高。
基于数据人工智能算法多态性预测方法

[发明专利]用于二倍体基因组组装和单倍型序列重建的方法、软件和系统-CN201680030485.6有效
发明人： C·金;P·佩鲁索;D·兰克 -专利权人：加利福尼亚太平洋生物科学股份有限公司
申请日： 2016-05-23 - 公布日： 2022-07-05 - 主分类号： G16B20/20 文献下载
摘要：示例性实施方案提供了用于二倍体基因组组装和单倍型序列重建的方法和系统。所述示例性实施方案的各方面包括：从两个单倍型的读段产生融合组装图，所述融合组装图包括所鉴别的主要重叠群和相关重叠群；使用已定相的读段和所述已定相的读段的感知到有单倍型的重叠来产生单倍型特异组装图；将所述融合组装图和所述单倍型特异组装图合并来产生合并的组装单倍型图；从所述合并的组装单倍型图去除交叉定相的连线以产生最终单倍型已分辨的组装图；以及从所述最终单倍型已分辨的组装图重建单倍型特异重叠群，从而产生单倍型特异重叠群。
用于二倍体基因组组装单倍型序列重建方法软件系统

[发明专利]基于链式搜索算法的母系MT单倍群鉴定方法、装置及设备-CN202110024674.5在审
发明人：马玉昆;黎松;贾寒;李峰峰;温颜华;李根;吕丽 -专利权人：北京果壳生物科技有限公司
申请日： 2021-01-08 - 公布日： 2021-04-20 - 主分类号： G16B20/30 文献下载
摘要：本发明涉及一种基于链式搜索算法的母系MT单倍群鉴定方法、装置及设备，属于线粒体单倍群鉴定技术领域，通过将目标数据库的母系单倍群数据解析为易读且易处理的txt格式；将样本ASA芯片检测结果转换成forward链、计算检出率和性别；提取每个样本检测结果的突变位点信息，并根据突变位点信息及命名规则，对基因型信息进行命名并进行格式转换，获取目标格式的基因型信息；计算每个样本的所有检测到MT单倍群的初始得分；统计单个样本利用全局链式搜索法给所有候选MT单倍群的最终得分；将全局链式搜索法鉴定的单倍群与Haplogrep2软件进行比较评估方法的鲁棒性。本发明能对被检样本不同IlluminaSNP芯片数据进行母系MT单倍群鉴定，成本低、准确性高、操作方便、适用广。
基于链式搜索算法母系 mt 单倍群鉴定方法装置设备

[发明专利]黑眼大白兔杂交品种的生产方法-CN02110199.X无效
发明人：高鹏飞 -专利权人：高鹏飞
申请日： 2002-03-22 - 公布日： 2003-07-02 - 主分类号： A01K67/027 文献下载
摘要：一种黑眼大白兔杂交品种的生产方法，其特征在于该杂交品种由兴安岭、天山肉兔种组成杂交品系，其生产方法如下：①严格选种；②搞好选配，按同质、异质、年龄、亲缘选配杂交，最后阶段采用亲交；③运用“系祖建系”法选择公、母兔交配，并在后代中选种选配，运用“系统选育”法在选择出若干公母兔的基础群中随机交配，并对后代严格淘汰，直达目的；④将“系祖建系”法与“系统选育”法培育的肉兔品种“创造杂交”，历经30多代、近15年间的选育
黑眼大白兔杂交品种生产方法

[发明专利]用于使用散在遗传元件进行遗传检测的方法：多路复合的DNA分析系统-CN201380062590.4有效
发明人：素德赫·辛哈 -专利权人：素德赫·辛哈
申请日： 2013-10-15 - 公布日： 2019-02-26 - 主分类号： C12Q1/6876 文献下载
摘要：通过利用靶向反转录转座子的靶位点重复(TSD)序列的小‑引物策略，无关插入元件的大小，包括SINE、LINE和SVA的INNUL标志物都可有效地用作用于人鉴定和生物祖系研究的标志物。成功地设计了以四颜色检测的对DNA进行单管扩增的15种RE标志物和珐琅蛋白(用于性别决定)多路复合。该多路复合提供了适于法医学和亲子分析的辨别力。此外，该检测的灵敏度可使得能够对法医学样品和人类学样品进行人身份和生物祖系研究。根据全球群体中的等位基因分布，可选择INNUL用于人身份测试或用于生物祖系研究。
用于使用遗传元件进行检测方法复合 dna 分析系统

[发明专利]一种检测线粒体基因单倍型类群的方法及应用-CN201010606171.0无效
发明人：杨毅;陈江华;张萍 -专利权人：浙江大学
申请日： 2010-12-27 - 公布日： 2011-07-20 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：本发明提供一种检测线粒体基因单倍型类群的方法，是利用寡核苷酸探针组检测mtDNA单倍型类群特征性位点的方法。本发明方法设计合理，可快速、廉价、准确的进行mtDNA单倍型类群分型，尤其适用于较大样本量的分析；本发明设计的方法不受特定位点限制，可以对任意单倍型类群特征性位点进行检测。本发明方法可在确定任意个体mtDNA单倍型类群中的应用尤其对检测样本的核酸模板要求低，在法医学、考古学等领域的应用具有较大优势。
一种检测线粒体基因单倍型类群方法应用

[发明专利]用于产生内耳毛细胞来治疗听力损失的组合物、系统和方法-CN201580059582.3在审
发明人： J·M·卡普;R·S·兰格;尹晓磊;N·乔希 -专利权人：布里格海姆妇女医院公司;麻省理工学院
申请日： 2015-09-03 - 公布日： 2017-08-18 - 主分类号： A61K35/36 文献下载
摘要：用于诱导耳蜗细胞群中所含的干/祖支持细胞的自我更新的方法和组合物，其包括诱导干/祖支持细胞增殖，同时在子代细胞中保持分化为毛细胞的能力。
用于产生内耳细胞治疗听力损失组合系统方法

[发明专利]基于20个单倍群D的Y-SNP遗传标记的法医学复合检测试剂盒-CN201810753256.8有效
发明人：侯一平;李介男;叶懿;宋凤;罗海玻;谢明坤;郎敏;王正;钱小钦;李英碧 -专利权人：四川大学
申请日： 2018-07-10 - 公布日： 2021-01-26 - 主分类号： C12Q1/6858 文献下载
摘要：本发明属于法医学检测试剂盒领域，具体涉及一种基于20个单倍群D的Y‑SNP遗传标记的法医学复合检测试剂盒。针对现有的检测试剂盒只能准确的将样本归属到Y染色体上，无法更准确的将其归属至单倍群D细枝的问题，本发明提供了一种复合检测试剂盒，包括：分离包装的复合扩增引物混合物、多重单碱基延伸反应引物混合物和标准DNA2800M本发明的试剂盒应用复合扩增以及单碱基延伸技术，可一次性获得生物检材的20个Y染色体单倍群D的SNP遗传标记的基因分型，并将属于单倍群D的中国男性样本准确划分至高分辨率Y染色体系统进化树单倍群D的细枝上，
基于 20 个单倍群 snp 遗传标记法医学复合检测试剂盒

[发明专利]一种利用线粒体DNA单倍型类群M9分析糖尿病视网膜病变风险的方法与应用-CN202110699876.X在审
发明人：周太成;周园媛;杨莹 -专利权人：云南省第二人民医院
申请日： 2021-06-23 - 公布日： 2021-09-10 - 主分类号： C12Q1/6883 文献下载
摘要：本发明公开了一种利用线粒体DNA单倍型类群M9分析糖尿病视网膜病变风险的方法与应用，包括以下步骤：1）外周血采集和外周血DNA提取；（2）线粒体DNA控制区测序；（3）鉴定线粒体单倍型类群判断该受试者发生糖尿病视网膜病变的风险应用为利用线粒体DNA单倍型类群M9分析糖尿病视网膜病变风险的方法在判定、鉴别和筛选糖尿病患者发生糖尿病视网膜病变风险中的应用。本发明的研究证明线粒体DNA单倍型类群背景为M9的2型糖尿病患者发生糖尿病视网膜病变的风险显著低于非M9背景的患者。因此，鉴定2型糖尿病患者的线粒体单倍型类群可以判断该受试者发生糖尿病视网膜病变的风险，从而采取预防糖尿病视网膜病变的方案或者为临床治疗方案的制定提供诊断基础。
一种利用线粒体 dna 单倍型类群 m9 分析糖尿病视网膜病变风险方法应用

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