本发明涉及细胞学技术领域,更具体而言,一种识别白菜型油菜染色体的寡核苷酸探针套设计及应用。包括以下步骤:S1:获取白菜型油菜R‑o‑18参考基因组中NR‑TR集合;S2:对NR‑TR集合进行统计聚类并得到其白菜型油菜染色体TR阵列数据;S3:获取在白菜型油菜所有染色体均富集的重复序列簇;S4:将得到的重复序列簇的重复序列代表阵列进行分割;S5:将分割后序列分别使用b l astn比对到白菜型油菜R‑o‑18参考基因组,得到覆盖白菜型油菜10条染色体的寡核苷酸探针套。本发明利用白菜型油菜R‑o‑18参考基因组序列信息,通过生物信息学方法分析串联重复序列,设计了白菜型油菜染色体的寡核苷酸探针套,建立了涂染白菜型油菜染色体的技术,该技术能够批量涂染白菜型油菜染色体材料。
本发明公开了一种鉴定白菜型油菜种皮颜色的InDel分子标记及其应用,属于分子遗传学技术领域。本发明所述InDel分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,利用所述InDel分子标记,通过琼脂糖凝胶电泳,可以高通量、准确地区分白菜型油菜种皮颜色基因型。本发明可以应用于苗期辅助选择育种,可以快速、高效地鉴定白菜型油菜种皮颜色性状,提高白菜型油菜育种效率,加速育种进程。
本发明提供一种与白菜型油菜株高和分枝角度紧密连锁的SSR分子标记及其应用。本发明利用EMS化学诱变的方法获得了新型的白菜型油菜突变体bgr‑JT,该突变体株型矮化且分枝紧凑。所述SSR分子标记位于白菜型油菜基因组A04:14035360bp~20192770bp区域,用于扩增SSR分子标记的引物如SEQ ID NO:1‑2所示。本发明首次提供与白菜型油菜株高和分枝角度紧密连锁的SSR分子标记,并开发了用于检测所述分子标记的引物,可实现白菜型油菜矮化分枝紧凑性状的早期选育,大大推进了油菜育种进程。
本发明提供了白菜型油菜DGAT1基因及其应用,属于基因工程领域。白菜型油菜DGAT1基因序列如SEQ ID No.1所示,其编码蛋白序列如SEQ ID No.2所示。该基因来源于白菜型油菜(Brassica rapa)(芥头2号),编码二酰甘油酰基转移酶,是生物体内TAG合成过程中的关键酶。利用本发明的白菜型油菜DGAT1基因转化酵母细胞能大幅提高酵母细胞的总油脂含量,可将该基因应用于生物油脂制备领域,具有良好的应用前景。