本发明提供了与猪产活仔数性状关联的分子标记及其应用，所述的分子标记位于猪DKK2基因第二内含子的部分DNA序列中，所述分子标记的核苷酸序列如序列表SEQ ID NO.1所示，该序列长度为631bp，在该序列中第261bp处存在一处AG碱基突变；本发明还提供了与猪产活仔数性状关联的SNP检测试剂盒，包括：如SEQ ID NO.2～3所示的引物对。本发明首次发掘了猪DKK2基因第二内含子内与猪产活仔数性状相关的分子标记，为猪产活仔数性状的标记辅助育种提供了一个新的分子育种标记。
本发明公开了一种猪SNP分子标记及其在猪产仔数性状筛选和/或猪育种中的应用，涉及猪分子标记技术领域。所述母猪产仔数性状为总产仔数、产活仔数和健仔数；所述分子标记位于猪SRRM3基因第三内含子序列中，该序列长度为447bp，其核苷酸序列如序列表SEQ ID NO.1所示，在该序列的第217bp处存在一处本发明首次发掘了猪SRRM3基因中的一个SNP分子标记与母猪的总产仔数、产活仔数和健仔数性状相关，因此可用于猪标记辅助选择育种，即提供了猪SRRM3基因中一个SNP分子标记在母猪产仔数性状的标记辅助育种的新用途，实现了对母猪产仔数性状的早期筛选，筛选方法简单快速。
所述繁殖性状为总产仔数、产活仔数和健仔数性状；所述分子标记位于猪NCK1基因第1号内含子中，其核苷酸序列如序列表SEQ ID NO.1所示，在该序列的第109bp处存在一处A109‑G109碱基突变。本发明首次发掘了猪NCK1基因中的一个SNP分子标记与猪的总产仔数、产活仔数和健仔数性状相关，因此可用于猪标记辅助选择育种，即提供了猪NCK1基因中一个SNP分子标记在猪繁殖性状的标记辅助育种的新用途，
本发明公开了一种检测猪窝产活仔数性状的方法。片段的自5′末端起第71位核苷酸是G还是A；检测待测猪的基因组中SEQ ID NO：2所示DNA片段的自5′末端起第81位核苷酸是C还是A；确定所述待测猪的单倍体型，根据所述单倍体型确定所述待测猪的窝产活仔数性状本发明方法可在发育早期检测猪的繁殖性状，了解猪的遗传分化程度，对于猪的不同基因型的分型、筛选及辅助育种提供了有用的分子标记，其选择、改变对于提高母猪窝产活仔数具有重要意义。
