本发明公开了一种阳春砂和海南砂种间杂交种及其亲本的鉴定方法，提供了阳春砂和海南砂的单倍型分子标记，所述单倍型分子标记含有4个SNP位点；所述鉴定方法为：提取被鉴定的样本的基因组DNA；对基因组DNA进行高通量测序；以核苷酸序列如SEQ ID NO：2所示的序列作为参比序列，检测高通量测序数据的单倍型分子标记类型，判定被鉴定的样本的品种；还根据被鉴定的样本及其相近物种的叶绿体基因组构建系统发生树，判定被鉴定的样本的母本本发明提供了一种简便、高效的阳春砂和海南砂种间杂交物种分子鉴定的方法，根据ITS2基因的单倍型鉴定植物种间杂交种，同时结合叶绿体基因组分析，有效判定杂交种的亲本来源，解决了种间杂交种不易区分鉴定的技术难题
利用单个SNP或其组合标记的单倍型对荷斯坦奶牛泌乳性状进行关联分析。5个SNP标记的核苷酸序列分别如序列表SEQ ID NO:1至SEQ ID NO:5所示。本发明还涉及PDIA3_SNP1至PDIA3_SNP5位点基因型的检测引物组合的开发和1个单倍型组合的应用。所述基因型中的两个SNP位点基因型分别与荷斯坦奶牛305d产奶量和乳蛋白量显著相关；单倍型组合与荷斯坦奶牛乳蛋白量显著相关。本发明可在奶牛标记辅助选择中应用。
本发明涉及一种影响小麦耐盐性的SNP和单倍型。所述SNP的核酸的序列如SEQ IDNo.5所示，所述SNP位于SEQ ID No.5上的从5’端起的第1014位点，为T或C。所述单倍型的核酸的序列如SEQ ID No.5所示，所述单倍型的9个SNP差异位点别为如SEQ IDNo.6所示的从5’到3’端的第1014位的CT，第1183位的TG，第1185位的CG，第1189位的
