[发明专利]一种基于纳米孔和高通量测序数据的噬菌体鉴定和宿主预测方法有效
| 申请号： | 202211107292.X | 申请日： | 2022-09-13 |
| 公开（公告）号： | CN115198036B | 公开（公告）日： | 2022-12-30 |
| 发明（设计）人： | 陈勇;陈毅强;涂勇;范亚民;崔韬 | 申请（专利权）人： | 江苏省环境工程技术有限公司 |
| 主分类号： | C12Q1/70 | 分类号： | C12Q1/70;C12Q1/6869;G16B30/10 |
| 代理公司： | 南京知识律师事务所 32207 | 代理人： | 卢亚丽 |
| 地址： | 210019 江苏省南京*** | 国省代码： | 江苏;32 |
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| 摘要： | 本申请涉及生物信息学领域，公开了一种基于纳米孔和高通量测序数据的噬菌体鉴定和宿主预测方法。通过将原始纳米孔测序数据与高通量测序数据相结合，设计了质控过滤流水线对两套测序数据分别进行质控和过滤，再在混合组装后的序列中根据噬菌体基因的特征模型鉴定出潜在的噬菌体序列，接着提取数据库中原有的细菌基因组所携带的特殊间隔序列，最后通过与数据库中提取的特殊间隔序列进行比对，挖掘对应关系，预测噬菌体对应的宿主关系。本发明实现了对纳米孔和高通量测序数据中噬菌体序列的有效挖掘与噬菌体宿主的有效预测，具有十分重要的推广应用价值。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 基于 纳米 通量 序数 噬菌体 鉴定 宿主 预测 方法 | ||
【主权项】：
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