[发明专利]一种基于高通量测序对TCR β进行定量的方法在审
申请号: | 202210222259.5 | 申请日: | 2022-03-03 |
公开(公告)号: | CN114561454A | 公开(公告)日: | 2022-05-31 |
发明(设计)人: | 万瑛;倪青山;于海礼;韩清娟;邹丽云;曾聪;黄毅;陈钢 | 申请(专利权)人: | 中国人民解放军陆军军医大学 |
主分类号: | C12Q1/6869 | 分类号: | C12Q1/6869;G16B30/00 |
代理公司: | 上海光华专利事务所(普通合伙) 31219 | 代理人: | 石欢欢 |
地址: | 400038 重*** | 国省代码: | 重庆;50 |
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摘要: | 本发明公开了一种基于高通量测序对TCRβ进行定量的方法,包括如下步骤:使用Trizol裂解样本,在裂解样本中加入外参细胞裂解液;提取样本和外参细胞的总RNA;利用TCRβ的C端特异性引物进行反转录;在反转录产物中加入模板;使用一组优化了序列组成和使用浓度的多重PCR引物构建TCRβ的高通量测序文库,并进行测序;利用2轮外参数据对样本中的TCRβ进行定量。本发明通过加入外参细胞,可对样本的T细胞总数进行有效估计;通过使用优化了序列组成和使用浓度的多重PCR引物,可更好的减少多重引物相互之间的干扰和扩增偏倚;通过加入模板,可帮助TCR高通量测序数据的校正和标准化,最后获得精准而真实的TCRβ库分布。 | ||
搜索关键词: | 一种 基于 通量 tcr 进行 定量 方法 | ||
【主权项】:
暂无信息
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