[发明专利]基于宏基因组学的毒素基因丰度检测方法及注释数据库构建方法在审
| 申请号： | 202210171676.1 | 申请日： | 2022-02-24 |
| 公开（公告）号： | CN114621997A | 公开（公告）日： | 2022-06-14 |
| 发明（设计）人： | 罗文;韩丽娟 | 申请（专利权）人： | 康美华大基因技术有限公司 |
| 主分类号： | C12Q1/6806 | 分类号： | C12Q1/6806;C12Q1/6869;C40B50/06;G16B30/00;G16B50/00 |
| 代理公司： | 广州市越秀区哲力专利商标事务所(普通合伙) 44288 | 代理人： | 杨艳 |
| 地址： | 518000 广东省深圳市宝安区西*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种基于宏基因组学的毒素基因丰度检测方法及注释数据库构建方法，属于生物信息技术领域，包括以下步骤：S1、样本采集并且建库测序，获得待测样本的宏基因组测序数据；S2、对所述宏基因组测序数据进行筛选，得到测序序列；S3、对所述测序序列与毒素基因参考数据库进行比对，获取每个基因的比对reads数量；S4、根据基因长度将reads数量标准化为相对丰度，然后基于内参基因序列的拷贝数计算每个毒素基因的绝对丰度；其中所述新的毒素因子参考序列数据库是通过添加已知量的内参基因序列到毒素因子参考序列数据库中形成的。采用该检测方法，可以检测出疾病相关的毒素因子基因，能够更准确的反映样本中基因的真实拷贝数和样本组间的真实差异。 | ||
| 搜索关键词： | 基于 宏基 毒素 基因 检测 方法 注释 数据库 构建 | ||
【主权项】：
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