[发明专利]转录组及代谢组鉴定南瓜运输mRNA响应低温代谢机制的方法在审
申请号: | 202210054872.0 | 申请日: | 2022-01-18 |
公开(公告)号: | CN114891866A | 公开(公告)日: | 2022-08-12 |
发明(设计)人: | 张文娜;刘雯倩;高丽红;刘梦霜;张若妍 | 申请(专利权)人: | 中国农业大学 |
主分类号: | C12Q1/6869 | 分类号: | C12Q1/6869;C12Q1/686;G01N33/50;G16B20/30;G16B30/00;G16B35/00 |
代理公司: | 北京卫平智业专利代理事务所(普通合伙) 11392 | 代理人: | 闫萍 |
地址: | 100193 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | 本发明涉及一种转录组及代谢组鉴定南瓜运输mRNA响应低温代谢机制的方法,包括:黄瓜/南瓜嫁接;黄瓜自嫁接;南瓜自嫁接;南瓜/黄瓜嫁接;嫁接7d后,选取长势一致的植株低温处理,将速冻的组织做转录组分析。根据FPKM值计算南瓜和黄瓜组织DEG;进行非靶向代谢组学测定;根据不同代谢物的离子强度计算相应的差异强度代谢物;转录组结合基因组重测序鉴定响应低温的砧穗间运输性mRNA;DEGs、差异强度代谢物、运输mRNA和代谢途径的综合分析。本发明准确预测mRNA调控功能,节省了大量人力、物力和财力,耗时短、见效快,揭示嫁接黄瓜耐低温的器官互作分子机理,对提高冬春季节黄瓜高效栽培具有重要意义。 | ||
搜索关键词: | 转录 代谢 鉴定 南瓜 运输 mrna 响应 低温 机制 方法 | ||
【主权项】:
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