[发明专利]一种无参考基因组的变异检测的数据工作流处理方法有效
| 申请号： | 202110835302.0 | 申请日： | 2021-07-23 |
| 公开（公告）号： | CN113555061B | 公开（公告）日： | 2023-03-14 |
| 发明（设计）人： | 刘珍;刘志岩;王海宁 | 申请（专利权）人： | 哈尔滨因极科技有限公司 |
| 主分类号： | G16B20/20 | 分类号： | G16B20/20;G16B20/30 |
| 代理公司： | 重庆百润洪知识产权代理有限公司 50219 | 代理人： | 杨光 |
| 地址： | 150000 黑龙江省哈尔滨*** | 国省代码： | 黑龙江;23 |
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| 摘要： | 本发明提出了一种无参考基因组的变异检测的数据工作流处理方法，包括如下步骤：提取原始测序数据FASTQ文件，建立存储库，将FASTQ文件切割为多个数据工作流，并将所述多个数据工作流存储在存储库中；采用基于最近投影算法将多个数据工作流进行投影变换，得到多个虚拟投影序列；利用变换空间索引算法，对所述虚拟投影序列进行字符串的搜索，使用解码操作，查找出所述字符串在数据工作流上的测序序列上的位置；当字符串的搜索步骤中没有找到合适的区间的时候，修改查找的字符串以命中不同的区间，然后在新的区间上继续进行搜索操作。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 参考 基因组 变异 检测 数据 工作流 处理 方法 | ||
【主权项】：
暂无信息
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