[发明专利]一种基于Nanopore宏基因组测序检测环境样品中新抗性基因的方法在审
| 申请号: | 202110789136.5 | 申请日: | 2021-07-13 |
| 公开(公告)号: | CN113512603A | 公开(公告)日: | 2021-10-19 |
| 发明(设计)人: | 李炳;雷华新;黄锦;梁贺彬 | 申请(专利权)人: | 清华大学深圳国际研究生院 |
| 主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/6869 |
| 代理公司: | 北京市诚辉律师事务所 11430 | 代理人: | 范盈;李玉娜 |
| 地址: | 518055 广东省深圳市*** | 国省代码: | 广东;44 |
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| 摘要: | 本发明提供一种基于Nanopore宏基因组测序检测环境样品中新抗性基因的方法,该方法包括以下步骤:1)从样品中提取总DNA,并进行DNA纯化;2)对纯化后的DNA进行宏基因组测序;3)对宏基因组测序后的数据进行分析。本发明通过提取、纯化、提纯等步骤获得满足三代Nanopore测序要求的DNA;通过序列组装以及纠错、校正,获得高质量的长序列,增加序列比对的准确性和可靠性;通过对抗生素抗性基因数据库进行扩展,使得检测结果更加准确、全面。 | ||
| 搜索关键词: | 一种 基于 nanopore 宏基 组测序 检测 环境 样品 抗性 基因 方法 | ||
【主权项】:
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