[发明专利]一种基于Nanopore宏基因组测序检测环境样品中新抗性基因的方法在审

专利信息
申请号: 202110789136.5 申请日: 2021-07-13
公开(公告)号: CN113512603A 公开(公告)日: 2021-10-19
发明(设计)人: 李炳;雷华新;黄锦;梁贺彬 申请(专利权)人: 清华大学深圳国际研究生院
主分类号: C12Q1/689 分类号: C12Q1/689;C12Q1/6869
代理公司: 北京市诚辉律师事务所 11430 代理人: 范盈;李玉娜
地址: 518055 广东省深圳市*** 国省代码: 广东;44
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摘要: 发明提供一种基于Nanopore宏基因组测序检测环境样品中新抗性基因的方法,该方法包括以下步骤:1)从样品中提取总DNA,并进行DNA纯化;2)对纯化后的DNA进行宏基因组测序;3)对宏基因组测序后的数据进行分析。本发明通过提取、纯化、提纯等步骤获得满足三代Nanopore测序要求的DNA;通过序列组装以及纠错、校正,获得高质量的长序列,增加序列比对的准确性和可靠性;通过对抗生素抗性基因数据库进行扩展,使得检测结果更加准确、全面。
搜索关键词: 一种 基于 nanopore 宏基 组测序 检测 环境 样品 抗性 基因 方法
【主权项】:
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