[发明专利]一种基因组完成图的基因组组装方法在审
| 申请号： | 202110069693.X | 申请日： | 2021-01-19 |
| 公开（公告）号： | CN112786109A | 公开（公告）日： | 2021-05-11 |
| 发明（设计）人： | 卢山;李奎 | 申请（专利权）人： | 南京大学 |
| 主分类号： | G16B30/20 | 分类号： | G16B30/20;G16B30/00;G16B45/00 |
| 代理公司： | 北京众合诚成知识产权代理有限公司 11246 | 代理人： | 刘珊珊 |
| 地址： | 210000 江苏*** | 国省代码： | 江苏;32 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种基因组完成图的基因组组装方法，首先使用高保真测序数据(HiFi)进行基因组组装，生成重叠群、重叠群路径、边信息和重叠信息；将重叠群锚定在参考基因组的染色体上，得到锚定结果；将重叠群路径按照的锚定结果连接成染色体路径；对于每条染色体，按照重叠群在染色体路径的位置在字符串图上遍历每个重叠群，并为每一对重叠群之间的缺口寻找最短路径并填补缺口。本发明实现了高保真测序(HiFi)的无缺口动植物基因组组装完成图，并且完成图准确性高、质量好。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 基因组 完成 组装 方法 | ||
【主权项】：
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