[发明专利]一种基于对比学习的分子图表示学习方法有效
申请号: | 202011564310.8 | 申请日: | 2020-12-25 |
公开(公告)号: | CN112669916B | 公开(公告)日: | 2022-03-15 |
发明(设计)人: | 陈华钧;杨海宏;方尹;庄祥 | 申请(专利权)人: | 浙江大学 |
主分类号: | G16C20/70 | 分类号: | G16C20/70;G16C20/20;G16C20/80;G06N3/04;G06N3/08;G06N20/00 |
代理公司: | 杭州天勤知识产权代理有限公司 33224 | 代理人: | 彭剑 |
地址: | 310013 浙江*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | 本发明公开了一种基于对比学习的分子图表示学习方法,包括:获取每个分子的分子指纹表示,计算每两个分子指纹之间的相似度;收集全量的化学官能团信息,为分子中的每个原子匹配对应的官能团;用异构图对分子图建模;利用结构感知分子编码器中的RGCN编码分子中每个原子的表示及其所属官能团的表示,通过聚合函数将分子映射到特征空间,得到具有结构感知的特征表示;根据分子之间的指纹相似度,选取正、负样本,在特征空间中进行对比学习;在大样本分子数据集上利用对比学习的方法进行训练,得到具有结构感知的分子编码器,应用于下游分子属性的预测任务。本发明有助于捕捉更丰富的分子结构信息,解决分子属性预测的问题。 | ||
搜索关键词: | 一种 基于 对比 学习 分子 图表 学习方法 | ||
【主权项】:
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