[发明专利]一种基于蛋白质序列比对的分子虚拟筛选方法在审
| 申请号： | 202011483191.3 | 申请日： | 2020-12-16 |
| 公开（公告）号： | CN112820355A | 公开（公告）日： | 2021-05-18 |
| 发明（设计）人： | 胡俊;郑琳琳;董世建;白岩松;樊学强;张贵军 | 申请（专利权）人： | 浙江工业大学 |
| 主分类号： | G16B35/20 | 分类号： | G16B35/20;G16B30/10;G06K9/62 |
| 代理公司： | 杭州斯可睿专利事务所有限公司 33241 | 代理人： | 王利强 |
| 地址： | 310014 浙江省*** | 国省代码： | 浙江;33 |
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| 摘要： |
一种基于蛋白质序列比对的分子虚拟筛选方法，根据输入的待进行分子筛选的蛋白质序列，使用HHblits程序获取蛋白质的多序列联配信息；计算待预测的蛋白质序列和多序列联配信息对应位置出现相同残基的频率PSFM；使用同样的方法，生成蛋白质‑配体相互作用数据库BioLiP中每条蛋白质序列的PSFM；计算待预测蛋白质与BioLiP中每条蛋白质的残基对齐得分与相似度匹配质量，根据匹配质量得分取得潜在种子分子集；计算分子数据库中每个分子与种子分子集中的所有分子的二维指纹图谱值之和，根据得分对DrugBank中所有分子进行排序，取得分靠前的x·N |
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| 搜索关键词： | 一种 基于 蛋白质 序列 分子 虚拟 筛选 方法 | ||
【主权项】：
暂无信息
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