[发明专利]一种smems算法的优化实现方案在审
| 申请号： | 202010094887.0 | 申请日： | 2020-02-17 |
| 公开（公告）号： | CN111354419A | 公开（公告）日： | 2020-06-30 |
| 发明（设计）人： | 田英轩;牛毅;李甫;李豪;马明明 | 申请（专利权）人： | 西安电子科技大学 |
| 主分类号： | G16B30/10 | 分类号： | G16B30/10;G16B40/00 |
| 代理公司： | 北京劲创知识产权代理事务所(普通合伙) 11589 | 代理人： | 徐家升 |
| 地址： | 710000 陕*** | 国省代码： | 陕西;61 |
| 权利要求书： | 查看更多 | 说明书： | 查看更多 |
| 摘要： | 本发明公开了一种smems算法的优化实现方案，属于生物信息学技术领域，其功能是完成序列在字典(bwt表)上的完全匹配，具体包括以下步骤：(1)保持原输入不变，从序列最左端开始，先向右匹配整条序列,在bwt表上寻找完全匹配，当无法继续向右延拓的时候，停止，记录当前碱基位置s1,将[0,s1]这条smem存入R；(2)将匹配顺序改成先左后右，即：在s1位置开始，先向左匹配到终点，针对当前这条完全匹配，向右延拓到最顶端s2，更新s1为s2；(3)重复第二步，直至s2为序列的右端点；(4)输出所有中间匹配的结果R；本发明将原始算法的循环执行的逻辑改成了顺序执行的逻辑，结构清晰，实现方便快捷，在不改变最终结果的前提下,优化了算法实现。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 smems 算法 优化 实现 方案 | ||
【主权项】：
暂无信息
下载完整专利技术内容需要扣除积分，VIP会员可以免费下载。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息，商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于西安电子科技大学，未经西安电子科技大学许可，擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作，请联系【客服】
本文链接：http://www.vipzhuanli.com/patent/202010094887.0/，转载请声明来源钻瓜专利网。
