[发明专利]基于单细胞转录组测序数据预测细胞空间关系的方法有效
| 申请号： | 202010038299.5 | 申请日： | 2020-01-14 |
| 公开（公告）号： | CN113192553B | 公开（公告）日： | 2022-09-09 |
| 发明（设计）人： | 张泽民;任仙文;钟国杰 | 申请（专利权）人： | 北京大学 |
| 主分类号： | G16B15/00 | 分类号： | G16B15/00;G16B30/10;G16B40/00 |
| 代理公司： | 北京知元同创知识产权代理事务所(普通合伙) 11535 | 代理人： | 张田勇;张祖萍 |
| 地址： | 100871*** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | 本发明涉及一种基于单细胞转录组测序数据预测细胞空间关系的方法。所述方法包括：获取基于单细胞转录组测序数据的细胞‑细胞相互作用强度矩阵A的概率矩阵P；根据获取的所述细胞‑细胞相互作用强度矩阵A的概率矩阵P，重构细胞相互作用的三维空间结构；对于重构细胞相互作用的三维空间结构中的每个细胞，确定平均每个细胞与h个细胞相互作用的细胞间距离阈值，得到细胞间作用网络。本发明实施例提出的基于单细胞转录组测序数据预测细胞空间关系的方法，只需要单细胞转录组测序数据就可以预测细胞在三维空间中的相互作用，解决了现有技术中必须通过成像才能获得细胞空间关系的限制。 | ||
| 搜索关键词： | 基于 单细胞 转录 序数 预测 细胞 空间 关系 方法 | ||
【主权项】：
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