[发明专利]谷子在干旱胁迫下H在审
申请号: | 201911251294.4 | 申请日: | 2019-12-09 |
公开(公告)号: | CN110747262A | 公开(公告)日: | 2020-02-04 |
发明(设计)人: | 郝雪峰;金竹萍;裴雁曦;王志清 | 申请(专利权)人: | 太原师范学院 |
主分类号: | C12Q1/6858 | 分类号: | C12Q1/6858 |
代理公司: | 61223 西安铭泽知识产权代理事务所(普通合伙) | 代理人: | 吴林 |
地址: | 030006 山西省晋中市*** | 国省代码: | 山西;14 |
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摘要: | 本发明涉及基因工程技术领域,具体为谷子在干旱胁迫下H | ||
搜索关键词: | 扩增 酶切 银染 检测 谷子基因组DNA 基因工程技术 甲基化修饰 变化检测 费用降低 干旱胁迫 农业植物 植物叶片 根茎 样本DNA 基因学 可用 灵敏 果实 | ||
【主权项】:
1.一种谷子在干旱胁迫下H2S处理后DNA甲基化水平的变化检测方法,其特征在于:该方法包括以下步骤:/nS1、提取谷子基因组DNA,获得DNA提取液;/nS2、对样本DNA做甲基化修饰;/nS3、酶切与连接:利用EcoRⅠ/HpaⅡ和EcoRⅠ/MspⅠ两组限制性内切酶进行剪切,剪切后在8℃的条件下与人工双链接头连接,获得扩增的DNA模板;/nS4、扩增与纯化:对DNA模板进行PCR扩增,对扩增后的产物进行电泳;/nS5、银染:电泳结束后,将大小玻璃板撬开,将大板放入已预冷的10%冰醋酸中进行固定,在摇床上震荡50分钟后,将玻璃板放入双蒸水中震荡2次,每次2分钟,然后将玻璃板放入已预冷的硝酸银溶液中进行染色,在摇床上震荡20分钟后,立即将染色后的玻璃板放入双蒸水中漂洗5-10秒,迅速取出放入预冷的碳酸钠溶液中进行显影,在摇床上震荡直到条带已全部显现并且条带清晰时,则可以终止显影;终止显影是将板放入10%冰醋酸中就可以完成;/nS6、记带及变异条带的回收:对引物组合进行筛选,选择条带多且清晰的条带进行最后的跑板实验,胶板上的每一条带即代表样本的一个CCGG位点,对于每一DNA样品来说,CCGG位点被切开标记为“1”,如果没有被切开,则标记为为“0”,注意的是记带时要挑选清晰明显的条带;最后将发生变异的条带进行切割回收,放入1XTE中冷冻保存;以作为连接转化的DNA模板;/nS7、变异片段的连接转化和测序;/nS8、将变异条带测序完成后,将测序结果放入BioEdit Sequence Alignment Editor软件进行分析,首先将载体和引物的序列找到并删除,即可得到变异条带完整序列;/nS9、通过检索数据库,得到的变异序列通过blastN对其在谷子全基因组中进行探寻和定位,再将变异序列通过blastX对其进行同源性蛋白的探寻与分析。/n
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