[发明专利]一种检测DNA中的单链断裂的方法有效
| 申请号： | 201910837092.1 | 申请日： | 2019-09-05 |
| 公开（公告）号： | CN110628886B | 公开（公告）日： | 2022-09-30 |
| 发明（设计）人： | 菲利普·卡帕诺夫;曹慧芬;洛雷娜·萨拉萨尔-加西亚;高帆;徐冬旸;蔡烨;韩雪儿;王芳;唐露 | 申请（专利权）人： | 华侨大学 |
| 主分类号： | C12Q1/6869 | 分类号： | C12Q1/6869 |
| 代理公司： | 厦门市首创君合专利事务所有限公司 35204 | 代理人： | 张松亭;游学明 |
| 地址： | 362000 福建省*** | 国省代码： | 福建;35 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种检测DNA中的单链断裂的方法，包括如下步骤：1)对待测DNA进行片段化，由此产生的片段的3’末端不能被加尾；2)对片段化的待测DNA的3’末端进行第一次加尾；3)对第一次加尾后的样品通过以下步骤捕获和识别全基因组中DNA单链断裂(single strand breaks,SSBs)的位置：首先，使用嵌合5’‑DNA‑RNA‑3’引物对加尾后的片段进行线性扩增；其次，对扩增产物的3’末端进行第二次加尾；最后，目标产物通过包含接头序列的寡核苷酸进行PCR扩增建库并进行二代测序。4)通过测序结果确定SSBs位置。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 检测 dna 中的 断裂 方法 | ||
【主权项】：
1.一种检测DNA中的单链断裂的方法，包括如下步骤：/n1)对待测DNA进行片段化，且由此产生的片段的3’末端不能被加尾；/n2)对片段化的待测DNA的3’末端进行第一次加尾；/n3)对第一次加尾后的样品通过以下步骤捕获和识别全基因组中DNA单链断裂—SSBs的位置：/n首先，使用5’-DNA-RNA-3’嵌合引物对加尾后的片段进行线性扩增；/n其次，对扩增产物的3’末端进行第二次加尾；所述的第一次加尾和第二次加尾所用的碱基不互补；/n最后，目标产物通过包含接头序列的寡核苷酸进行PCR扩增建库并进行二代测序；/n4)通过测序结果确定SSBs位置。/n
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