[发明专利]无芒隐子草LTR-RT分子标记引物及在种质鉴定中的应用

摘要

本发明属于生物技术领域，具体涉及无芒隐子草LTR‑RT(长末端重复反转录转座子)分子标记引物及在隐子草属种质鉴定中的应用。具体采用80对引物对23种无芒隐子草种质进行区分，本发明的鉴定方法可利用较少的引物组合在4h之内完成对供试隐子草属种质的比对鉴定，具有准确、高效、快速、成本低以及操作方便等优势，本申请具有较高的灵敏度和精确度。

主权项

1.无芒隐子草LTR‑RT分子标记引物，其特征在于，所述分子标记引物包括如下80对，其正向引物和反向引物的核苷酸序列具体如下：(1)Cs_LTR_10：正向引物序列为SEQ ID NO.1，反向引物序列为SEQ ID NO.2；(2)Cs_LTR_11：正向引物序列为SEQ ID NO.3，反向引物序列为SEQ ID NO.4；(3)Cs_LTR_13：正向引物序列为SEQ ID NO.5，反向引物序列为SEQ ID NO.6；(4)Cs_LTR_14：正向引物序列为SEQ ID NO.7，反向引物序列为SEQ ID NO.8；(5)Cs_LTR_16：正向引物序列为SEQ ID NO.9，反向引物序列为SEQ ID NO.10；(6)Cs_LTR_17：正向引物序列为SEQ ID NO.11，反向引物序列为SEQ ID NO.12；(7)Cs_LTR_19：正向引物序列为SEQ ID NO.13，反向引物序列为SEQ D NO.14；(8)Cs_LTR_27：正向引物序列为SEQ ID NO.15，反向引物序列为SEQ ID NO.16；(9)Cs_LTR_35：正向引物序列为SEQ ID NO.17，反向引物序列为SEQ D NO.18；(10)Cs_LTR_36：正向引物序列为SEQ ID NO.19，反向引物序列为SEQ ID NO.20；(11)Cs_LTR_39：正向引物序列为SEQ ID NO.21，反向引物序列为SEQ ID NO.22；(12)Cs_LTR_40：正向引物序列为SEQ ID NO.23，反向引物序列为SEQ ID NO.24；(13)Cs_LTR_41：正向引物序列为SEQ ID NO.25，反向引物序列为SEQ ID NO.26；(14)Cs_LTR_50：正向引物序列为SEQ ID NO.27，反向引物序列为SEQ ID NO.28；(15)Cs_LTR_51：正向引物序列为SEQ ID NO.29，反向引物序列为SEQ ID NO.30；(16)Cs_LTR_53：正向引物序列为SEQ ID NO.31，反向引物序列为SEQ ID NO.32；(17)Cs_LTR_59：正向引物序列为SEQ ID NO.33，反向引物序列为SEQ ID NO.34；(18)Cs_LTR_66：正向引物序列为SEQ ID NO.35，反向引物序列为SEQ ID NO.36；(19)Cs_LTR_68：正向引物序列为SEQ ID NO.37，反向引物序列为SEQ ID NO.38；(20)Cs_LTR_69：正向引物序列为SEQ ID NO.39，反向引物序列为SEQ ID NO.40；(21)Cs_LTR_84：正向引物序列为SEQ ID NO.41，反向引物序列为SEQ ID NO.42；(22)Cs_LTR_85：正向引物序列为SEQ ID NO.43，反向引物序列为SEQ ID NO.44；(23)Cs_LTR_94：正向引物序列为SEQ ID NO.45，反向引物序列为SEQ ID NO.46；(24)Cs_LTR_106：正向引物序列为SEQ ID NO.47，反向引物序列为SEQ ID NO.48；(25)Cs_LTR_107：正向引物序列为SEQ ID NO.49，反向引物序列为SEQ ID NO.50；(26)Cs_LTR_110：正向引物序列为SEQ ID NO.51，反向引物序列为SEQ ID NO.52；(27)Cs_LTR_115：正向引物序列为SEQ ID NO.53，反向引物序列为SEQ ID NO.54；(28)Cs_LTR_117：正向引物序列为SEQ ID NO.55，反向引物序列为SEQ ID NO.56；(29)Cs_LTR_122：正向引物序列为SEQ ID NO.57，反向引物序列为SEQ ID NO.58；(30)Cs_LTR_126：正向引物序列为SEQ ID NO.59，反向引物序列为SEQ ID NO.60；(31)Cs_LTR_137：正向引物序列为SEQ ID NO.61，反向引物序列为SEQ ID NO.62；(32)Cs_LTR_138：正向引物序列为SEQ ID NO.63，反向引物序列为SEQ ID NO.64；(33)Cs_LTR_141：正向引物序列为SEQ ID NO.65，反向引物序列为SEQ ID NO.66；(34)Cs_LTR_142：正向引物序列为SEQ ID NO.67，反向引物序列为SEQ ID NO.68；(35)Cs_LTR_144：正向引物序列为SEQ ID NO.69，反向引物序列为SEQ ID NO.70；(36)Cs_LTR_149：正向引物序列为SEQ ID NO.71，反向引物序列为SEQ ID NO.72。(37)Cs_LTR_155：正向引物序列为SEQ ID NO.73，反向引物序列为SEQ ID NO.74；(38)Cs_LTR_156：正向引物序列为SEQ ID NO.75，反向引物序列为SEQ ID NO.76；(39)Cs_LTR_159：正向引物序列为SEQ ID NO.77，反向引物序列为SEQ ID NO.78；(40)Cs_LTR_161：正向引物序列为SEQ ID NO.79，反向引物序列为SEQ ID NO.80；(41)Cs_LTR_166：正向引物序列为SEQ ID NO.81，反向引物序列为SEQ ID NO.82；(42)Cs_LTR_168：正向引物序列为SEQ ID NO.83，反向引物序列为SEQ ID NO.84；(43)Cs_LTR_173：正向引物序列为SEQ ID NO.85，反向引物序列为SEQ ID NO.86；(44)Cs_LTR_187：正向引物序列为SEQ ID NO.87，反向引物序列为SEQ ID NO.88；(45)Cs_LTR_188：正向引物序列为SEQ ID NO.89，反向引物序列为SEQ ID NO.90；(46)Cs_LTR_190：正向引物序列为SEQ ID NO.91，反向引物序列为SEQ ID NO.92；(47)Cs_LTR_191：正向引物序列为SEQ ID NO.93，反向引物序列为SEQ ID NO.94；(48)Cs_LTR_199：正向引物序列为SEQ ID NO.95，反向引物序列为SEQ ID NO.96；(49)Cs_LTR_205：正向引物序列为SEQ ID NO.97，反向引物序列为SEQ ID NO.98；(50)Cs_LTR_207：正向引物序列为SEQ ID NO.99，反向引物序列为SEQ ID NO.100；(51)Cs_LTR_208：正向引物序列为SEQ ID NO.101，反向引物序列为SEQ ID NO.102；(52)Cs_LTR_214：正向引物序列为SEQ ID NO.103，反向引物序列为SEQ ID NO.104；(53)Cs_LTR_216：正向引物序列为SEQ ID NO.105，反向引物序列为SEQ ID NO.106；(54)Cs_LTR_220：正向引物序列为SEQ ID NO.107，反向引物序列为SEQ ID NO.108；(55)Cs_LTR_225：正向引物序列为SEQ ID NO.109，反向引物序列为SEQ ID NO.110；(56)Cs_LTR_230：正向引物序列为SEQ ID NO.111，反向引物序列为SEQ ID NO.112；(57)Cs_LTR_231：正向引物序列为SEQ ID NO.113，反向引物序列为SEQ ID NO.114；(58)Cs_LTR_235：正向引物序列为SEQ ID NO.115，反向引物序列为SEQ ID NO.116；(59)Cs_LTR_237：正向引物序列为SEQ ID NO.117，反向引物序列为SEQ ID NO.118；(60)Cs_LTR_238：正向引物序列为SEQ ID NO.119，反向引物序列为SEQ ID NO.120；(61)Cs_LTR_241：正向引物序列为SEQ ID NO.121，反向引物序列为SEQ ID NO.122；(62)Cs_LTR_246：正向引物序列为SEQ ID NO.123，反向引物序列为SEQ ID NO.124；(63)Cs_LTR_250：正向引物序列为SEQ ID NO.125，反向引物序列为SEQ ID NO.126；(64)Cs_LTR_253：正向引物序列为SEQ ID NO.127，反向引物序列为SEQ ID NO.128；(65)Cs_LTR_258：正向引物序列为SEQ ID NO.129，反向引物序列为SEQ ID NO.130；(66)Cs_LTR_260：正向引物序列为SEQ ID NO.131，反向引物序列为SEQ ID NO.132；(67)Cs_LTR_275：正向引物序列为SEQ ID NO.133，反向引物序列为SEQ ID NO.134；(68)Cs_LTR_285：正向引物序列为SEQ ID NO.135，反向引物序列为SEQ ID NO.136；(69)Cs_LTR_298：正向引物序列为SEQ ID NO.137，反向引物序列为SEQ ID NO.138；(70)Cs_LTR_300：正向引物序列为SEQ ID NO.139，反向引物序列为SEQ ID NO.140；(71)Cs_LTR_303：正向引物序列为SEQ ID NO.141，反向引物序列为SEQ ID NO.142；(72)Cs_LTR_309：正向引物序列为SEQ ID NO.143，反向引物序列为SEQ ID NO.144；(73)Cs_LTR_313：正向引物序列为SEQ ID NO.145，反向引物序列为SEQ ID NO.146；(74)Cs_LTR_319：正向引物序列为SEQ ID NO.147，反向引物序列为SEQ ID NO.148；(75)Cs_LTR_324：正向引物序列为SEQ ID NO.149，反向引物序列为SEQ ID NO.150；(76)Cs_LTR_331：正向引物序列为SEQ ID NO.151，反向引物序列为SEQ ID NO.152；(77)Cs_LTR_333：正向引物序列为SEQ ID NO.153，反向引物序列为SEQ ID NO.154；(78)Cs_LTR_338：正向引物序列为SEQ ID NO.155，反向引物序列为SEQ ID NO.156；(79)Cs_LTR_339：正向引物序列为SEQ ID NO.157，反向引物序列为SEQ ID NO.158；(80)Cs_LTR_342：正向引物序列为SEQ ID NO.159，反向引物序列为SEQ ID NO.160。