[发明专利]一种长片段DNA文库长配对末端测序方法在审
| 申请号： | 201910548031.3 | 申请日： | 2019-06-22 |
| 公开（公告）号： | CN110241189A | 公开（公告）日： | 2019-09-17 |
| 发明（设计）人： | 罗美中;戴钊钊 | 申请（专利权）人： | 华中农业大学 |
| 主分类号： | C12Q1/6869 | 分类号： | C12Q1/6869;C12Q1/6806;C40B50/06 |
| 代理公司： | 武汉宇晨专利事务所 42001 | 代理人： | 张红兵 |
| 地址： | 430070 湖*** | 国省代码： | 湖北;42 |
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| 摘要： | 本发明属于全基因测序技术领域，具体涉及一种长片段DNA文库长配对末端测序方法。公开了一种基于单分子测序平台的长片段DNA文库长配对末端测序方法。发明的步骤为：提取全基因组DNA构建大片段文库；通过大片段文库克隆混合池DNA构建长末端paired‑end测序文库及克隆混合池，提取长末端paired‑end测序文库克隆混合池的DNA，去载体后进行测序，利用提取到的paired‑end双末端序列经过去冗余后得到无歧义的长paired‑end序列，用以辅助全基因组的拼装，评估已有基因组拼装的质量，鉴定结构变异位点等，使基因组组装质量得到较大的提升。 | ||
| 搜索关键词： | 文库 长片段DNA 末端测序 混合池 配对 测序文库 长末端 基因组 构建 拼装 克隆 全基因组DNA 大片 测序技术 测序平台 结构变异 末端序列 全基因组 文库克隆 歧义 冗余 单分子 全基因 测序 位点 组装 评估 | ||
【主权项】：
1.一种长片段DNA文库长配对末端测序方法，包括载体改造，构建大片段基因组文库和克隆混合池；通过混合池DNA构建长配对末端文库，克隆混合池；制备测序样品后进行测序；最后利用长配对末端序列进行全基因组序列的组装、验证、多基因组比较以及结构变异位点鉴定，其特征包括：a)使用物理打断或部分酶切的方法得到随机性强的大片段文库克隆的长配对末端；b)使用抗性基因标签筛选长配对末端，区分来自同一克隆的左右末端。
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