[发明专利]一种与水稻稻瘟病抗性基因紧密连锁的分子标记的制备方法有效
| 申请号： | 201910362960.5 | 申请日： | 2019-04-30 |
| 公开（公告）号： | CN109913581B | 公开（公告）日： | 2022-05-20 |
| 发明（设计）人： | 曾跃辉;韦新宇;黄建鸿;张锐;尚伟 | 申请（专利权）人： | 三明市农业科学研究院 |
| 主分类号： | C12Q1/6895 | 分类号： | C12Q1/6895;C12Q1/6806 |
| 代理公司： | 泉州市博一专利事务所(普通合伙) 35213 | 代理人： | 方传榜;蔡俊旭 |
| 地址： | 365509 *** | 国省代码： | 福建;35 |
| 权利要求书： | 暂无信息 | 说明书： | 暂无信息 |
| 摘要： | 一种与水稻稻瘟病抗性基因紧密连锁的分子标记的制备方法，以具有抗稻瘟病特性的水稻品种为父本，感病品种为母本，构建一个用于稻瘟病抗性基因定位的F2分离群体；再从中选取至少10个极端抗病单株和至少10个极端感病单株分别构建抗病基因池和感病基因池；采用改良的CTAB法分别提取两亲本幼苗及两亲本杂交后代幼苗的基因组DNA；筛选两亲本及两基因池间多态性，获得和稻瘟病抗性基因连锁的分子标记，从而对稻瘟病抗性基因进行初步定位；比对粳稻和籼稻两亚种的基因组序列多态性，再对与稻瘟病抗性相关基因进行精细定位，从而获得和抗稻瘟病基因紧密连锁的插入缺失InDel位点，并转化为相关特异性插入缺失InDel分子标记。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 水稻 稻瘟病 抗性 基因 紧密 连锁 分子 标记 制备 方法 | ||
【主权项】：
1.一种与水稻稻瘟病抗性基因紧密连锁的分子标记的制备方法，其特征在于，包括以下步骤：(一)以具有抗稻瘟病特性的水稻品种为父本，感病品种为母本，构建一个用于稻瘟病抗性基因定位的F2分离群体；(二)从所述F2分离群体中随机选取至少10个极端抗病单株和至少10个极端感病单株分别构建抗病基因池和感病基因池；(三)采用改良的CTAB法分别提取两亲本幼苗及两亲本杂交后代幼苗的基因组DNA；(四)根据水稻生物信息学数据库公开发布的SSR分子标记，通过筛选两亲本及两基因池间多态性，获得和稻瘟病抗性基因连锁的分子标记，从而对稻瘟病抗性基因进行初步定位；(五)比对已完成全基因组测序的粳稻和籼稻两亚种在步骤（四）中已初步定位的染色体区域内的基因组序列多态性，再对与稻瘟病抗性相关基因进行精细定位，从而获得和抗稻瘟病基因紧密连锁的插入缺失InDel位点，再将该插入缺失InDel位点利用Primer Premier 5.0软件设计并转化为相关特异性插入缺失InDel分子标记。
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