[发明专利]玉米分子育种核心SNP位点组合及其应用

摘要

本发明公开了玉米分子育种核心SNP位点组合及其应用。本发明提供了300个SNP位点在如下(1)‑(4)中至少一种中的应用：(1)检测玉米自交系遗传相似度；(2)检测玉米杂交种杂合度；(3)用于玉米回交转育的分子标记辅助背景选择；(4)玉米分子育种；本发明从740对SNP引物中筛选确定一套适用于玉米分子育种的SNP位点组合。因此本发明基于样品高通量的KASP检测平台，筛选适用于玉米分子育种的核心SNP位点组合，能够显著提高育种效率。

主权项

1.300个SNP位点在如下(1)‑(4)中至少一种中的应用：(1)检测玉米自交系遗传相似度；(2)检测玉米杂交种杂合度；(3)用于玉米回交转育的分子标记辅助背景选择；(4)玉米分子育种；所述300个SNP位点的物理位置是基于玉米品种B73的全基因组序列比对确定的，所述玉米品种B73全基因组序列的版本号为B73 RefGen V4；所述300个SNP位点是BJ001‑BJ300；BJ001位于1号染色体上第2386298位；BJ002位于1号染色体上第9015954位；BJ003位于1号染色体上第11678232位；BJ004位于1号染色体上第18044029位；BJ005位于1号染色体上第21772113位；BJ006位于1号染色体上第24949696位；BJ007位于1号染色体上第27995196位；BJ008位于1号染色体上第30525614位；BJ009位于1号染色体上第36684150位；BJ010位于1号染色体上第44316802位；BJ011位于1号染色体上第44730532位；BJ012位于1号染色体上第57256655位；BJ013位于1号染色体上第62426055位；BJ014位于1号染色体上第64842917位；BJ015位于1号染色体上第80946353位；BJ016位于1号染色体上第88699192位；BJ017位于1号染色体上第99951335位；BJ018位于1号染色体上第108427900位；BJ019位于1号染色体上第110560233位；BJ020位于1号染色体上第113772604位；BJ021位于1号染色体上第123880045位；BJ022位于1号染色体上第157314653位；BJ023位于1号染色体上第158442106位；BJ024位于1号染色体上第166195632位；BJ025位于1号染色体上第182929292位；BJ026位于1号染色体上第200710300位；BJ027位于1号染色体上第212613678位；BJ028位于1号染色体上第223545401位；BJ029位于1号染色体上第239173394位；BJ030位于1号染色体上第245200617位；BJ031位于1号染色体上第246790737位；BJ032位于1号染色体上第249338521位；BJ033位于1号染色体上第252666922位；BJ034位于1号染色体上第257767178位；BJ035位于1号染色体上第270258270位；BJ036位于1号染色体上第278821858位；BJ037位于1号染色体上第286308381位；BJ038位于1号染色体上第287809693位；BJ039位于1号染色体上第290907274位；BJ040位于1号染色体上第294734309位；BJ041位于1号染色体上第295780473位；BJ042位于1号染色体上第297926819位；BJ043位于1号染色体上第302251282位；BJ044位于1号染色体上第304304693位；BJ045位于2号染色体上第3763049位；BJ046位于2号染色体上第6962452位；BJ047位于2号染色体上第9725122位；BJ048位于2号染色体上第13595075位；BJ049位于2号染色体上第30127728位；BJ050位于2号染色体上第38275041位；BJ051位于2号染色体上第39887341位；BJ052位于2号染色体上第48114795位；BJ053位于2号染色体上第53850049位；BJ054位于2号染色体上第61532853位；BJ055位于2号染色体上第64590989位；BJ056位于2号染色体上第82185472位；BJ057位于2号染色体上第91614222位；BJ058位于2号染色体上第106729029位；BJ059位于2号染色体上第115915285位；BJ060位于2号染色体上第131206918位；BJ061位于2号染色体上第152741735位；BJ062位于2号染色体上第171118069位；BJ063位于2号染色体上第178096449位；BJ064位于2号染色体上第183651486位；BJ065位于2号染色体上第187447790位；BJ066位于2号染色体上第191280878位；BJ067位于2号染色体上第198323481位；BJ068位于2号染色体上第201507721位；BJ069位于2号染色体上第205404138位；BJ070位于2号染色体上第209509992位；BJ071位于2号染色体上第219172449位；BJ072位于2号染色体上第222359478位；BJ073位于2号染色体上第225208099位；BJ074位于2号染色体上第227408503位；BJ075位于2号染色体上第230560613位；BJ076位于2号染色体上第231791729位；BJ077位于2号染色体上第232254988位；BJ078位于2号染色体上第242416915位；BJ079位于2号染色体上第243465767位；BJ080位于3号染色体上第5496829位；BJ081位于3号染色体上第8207992位；BJ082位于3号染色体上第10558026位；BJ083位于3号染色体上第14516004位；BJ084位于3号染色体上第17171530位；BJ085位于3号染色体上第41716639位；BJ086位于3号染色体上第110791214位；BJ087位于3号染色体上第108749512位；BJ088位于3号染色体上第89708520位；BJ089位于3号染色体上第117394708位；BJ090位于3号染色体上第110841958位；BJ091位于3号染色体上第126925604位；BJ092位于3号染色体上第133077911位；BJ093位于3号染色体上第135455615位；BJ094位于3号染色体上第143615147位；BJ095位于3号染色体上第142490909位；BJ096位于3号染色体上第152440715位；BJ097位于3号染色体上第157891895位；BJ098位于3号染色体上第167226752位；BJ099位于3号染色体上第177267256位；BJ100位于3号染色体上第180846069位；BJ101位于3号染色体上第182654916位；BJ102位于3号染色体上第187256252位；BJ103位于3号染色体上第198917190位；BJ104位于3号染色体上第206991538位；BJ105位于3号染色体上第211618708位；BJ106位于3号染色体上第212618653位；BJ107位于3号染色体上第215638283位；BJ108位于3号染色体上第218833090位；BJ109位于3号染色体上第219573683位；BJ110位于3号染色体上第230174013位；BJ111位于3号染色体上第233313935位；BJ112位于3号染色体上第235335829位；BJ113位于4号染色体上第1739065位；BJ114位于4号染色体上第14933099位；BJ115位于4号染色体上第19992707位；BJ116位于4号染色体上第21275190位；BJ117位于4号染色体上第23825706位；BJ118位于4号染色体上第34701792位；BJ119位于4号染色体上第39073611位；BJ120位于4号染色体上第58181917位；BJ121位于4号染色体上第69980490位；BJ122位于4号染色体上第82716278位；BJ123位于4号染色体上第116463964位；BJ124位于4号染色体上第123436433位；BJ125位于4号染色体上第128449774位；BJ126位于4号染色体上第131909367位；BJ127位于4号染色体上第134817964位；BJ128位于4号染色体上第148978829位；BJ129位于4号染色体上第152675972位；BJ130位于4号染色体上第154203504位；BJ131位于4号染色体上第157207753位；BJ132位于4号染色体上第172954523位；BJ133位于4号染色体上第176222779位；BJ134位于4号染色体上第180169695位；BJ135位于4号染色体上第198077263位；BJ136位于4号染色体上第205815966位；BJ137位于4号染色体上第212298903位；BJ138位于4号染色体上第214574654位；BJ139位于4号染色体上第218923039位；BJ140位于4号染色体上第225636570位；BJ141位于4号染色体上第227482564位；BJ142位于4号染色体上第236207694位；BJ143位于4号染色体上第238721563位；BJ144位于4号染色体上第241456450位；BJ145位于4号染色体上第243231190位；BJ146位于4号染色体上第245873226位；BJ147位于5号染色体上第7148611位；BJ148位于5号染色体上第8851444位；BJ149位于5号染色体上第11683352位；BJ150位于5号染色体上第13744674位；BJ151位于5号染色体上第21325877位；BJ152位于5号染色体上第21505964位；BJ153位于5号染色体上第30864455位；BJ154位于5号染色体上第34231061位；BJ155位于5号染色体上第36896481位；BJ156位于5号染色体上第43932481位；BJ157位于5号染色体上第51387774位；BJ158位于5号染色体上第60848684位；BJ159位于5号染色体上第62765284位；BJ160位于5号染色体上第66013542位；BJ161位于5号染色体上第74821251位；BJ162位于5号染色体上第82969158位；BJ163位于5号染色体上第90502766位；BJ164位于5号染色体上第103189624位；BJ165位于5号染色体上第118052768位；BJ166位于5号染色体上第134288332位；BJ167位于5号染色体上第140661203位；BJ168位于5号染色体上第144540975位；BJ169位于5号染色体上第155111024位；BJ170位于5号染色体上第164800996位；BJ171位于5号染色体上第170325850位；BJ172位于5号染色体上第177354381位；BJ173位于5号染色体上第183178987位；BJ174位于5号染色体上第185788710位；BJ175位于5号染色体上第195642707位；BJ176位于5号染色体上第205083043位；BJ177位于5号染色体上第210194272位；BJ178位于5号染色体上第222687487位；BJ179位于6号染色体上第3646695位；BJ180位于6号染色体上第6890138位；BJ181位于6号染色体上第17761860位；BJ182位于6号染色体上第34694152位；BJ183位于6号染色体上第47430377位；BJ184位于6号染色体上第56301400位；BJ185位于6号染色体上第59431612位；BJ186位于6号染色体上第63728542位；BJ187位于6号染色体上第86011472位；BJ188位于6号染色体上第89033009位；BJ189位于6号染色体上第99770028位；BJ190位于6号染色体上第105518241位；BJ191位于6号染色体上第111334472位；BJ192位于6号染色体上第118133941位；BJ193位于6号染色体上第122125948位；BJ194位于6号染色体上第127493339位；BJ195位于6号染色体上第133280110位；BJ196位于6号染色体上第1373969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