[发明专利]一种用于检测病原体的引物和探针的设计方法在审

专利信息
申请号: 201910012121.0 申请日: 2016-01-15
公开(公告)号: CN109554506A 公开(公告)日: 2019-04-02
发明(设计)人: 刘学锋;张太松;吕娜;朱丽敏 申请(专利权)人: 艾康生物技术(杭州)有限公司
主分类号: C12Q1/70 分类号: C12Q1/70;C12N15/11;C12R1/93
代理公司: 浙江杭州金通专利事务所有限公司 33100 代理人: 徐关寿
地址: 310030 浙*** 国省代码: 浙江;33
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摘要: 发明提供一种用于检测高危型HPV等病原体多种亚型的引物和探针的设计方法,所设计的引物和探针可用于对样品中可能存在的病原体多种亚型进行初步检测和型别鉴定。本发明基于高危型HPV等病原体多种亚型在进化树上的亲缘性,设计病原体多种亚型引物和探针,在保证检测准确性、灵敏度和特异性的同时,显著降低背景荧光值,并显著增加检测通量和极大地降低检测成本。
搜索关键词: 病原体 探针 亚型 引物 检测 高危型HPV 背景荧光 灵敏度 亲缘性 可用 通量 进化 保证
【主权项】:
1.一种用于检测高危型HPV的引物和探针的设计方法,其特征在于:包括以下步骤:在为HPV31、HPV33、HPV 35、HPV52和HPV58设计上下游引物和探针时,选择HPV31、HPV33、HPV 35、HPV52和HPV58在E1基因上比较高的同源性区域,让HPV31和HPV35共用下游引物,HPV33、HPV52和HPV58共用下游引物,同时这5种高危型HPV共用一条探针;在为HPV45和HPV59设计上下游引物和探针时,选择HPV45和HPV59在E2基因上比较高的同源性区域,让HPV45和HPV59共用一条探针;在为HPV39和HPV68设计上下游引物和探针时,选择HPV39和HPV68在E2基因上比较高的同源性区域,让HPV39和HPV68共用上游引物、下游引物和一条探针;在为HPV26、HPV51和HPV82设计上下游引物和探针时,HPV26、HPV51和HPV82在E2基因上比较高的同源性区域,让HPV51和HPV82共用上游引物,HPV51、HPV82和HPV26共用下游引物和一条探针;在为HPV53、HPV56和HPV66设计上下游引物和探针时,选择HPV53、HPV56和HPV66在E7基因上比较高的同源性区域,让HPV56和HPV66共用上游引物,HPV56、HPV66与HPV53共用一条探针。
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