[发明专利]基于Illumina测序的串联条形码、其标记的DNA文库及其构建方法有效
| 申请号： | 201811406204.X | 申请日： | 2018-11-23 |
| 公开（公告）号： | CN109486924B | 公开（公告）日： | 2022-03-01 |
| 发明（设计）人： | 李晨虹;王颖;袁昊 | 申请（专利权）人： | 上海海洋大学 |
| 主分类号： | C12Q1/6869 | 分类号： | C12Q1/6869;C12Q1/6806;C12N15/11;C40B50/06 |
| 代理公司： | 上海伯瑞杰知识产权代理有限公司 31227 | 代理人： | 胡永宏 |
| 地址： | 201306 上*** | 国省代码： | 上海;31 |
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| 摘要： | 本发明公开了基于Illumina测序的串联条形码、其标记的DNA文库及其构建方法，包括样本DNA序列破碎、修复序列平末端、序列末端加上串联条形码接头、修复序列空缺并延伸和PCR扩增的步骤构建DNA文库；其中串联条形码为6bp长度的DNA序列，且同时满足最小编辑长度3以内、包含不同碱基的片段、使用不同激光色的碱基且相邻碱基激光色不同和不含有AAA、ACA、CCC、CAC、GGG、GTG、TTT和TGT的碱基序列。通过提前引入串联条形码进行DNA标记，大大减少污染数据不能被识别的可能性，极大改善在DNA文库构建和基因富集过程中非常普遍的样本之间相互污染问题。 | ||
| 搜索关键词： | 基于 illumina 串联 条形码 标记 dna 文库 及其 构建 方法 | ||
【主权项】：
1.基于Illumina测序的串联条形码，其特征在于，所述串联条形码为6bp长度的DNA序列，且同时满足(ⅰ)最小编辑长度3以内，和(ⅱ)包含不同碱基的片段，和(ⅲ)使用不同激光色的碱基，且相邻碱基激光色不同，和(ⅳ)不含有'AAA'、'ACA'、'CCC'、'CAC'、'GGG'、'GTG'、'TTT'和'TGT'的碱基序列。
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