[发明专利]一种支气管肺病灶灌洗液的SHOX2甲基化检测方法在审

专利信息
申请号: 201811252066.4 申请日: 2018-10-25
公开(公告)号: CN109266722A 公开(公告)日: 2019-01-25
发明(设计)人: 周军;管淑红;张素娟;张秋娣;徐乾乾;徐雄 申请(专利权)人: 常州市第一人民医院
主分类号: C12Q1/6851 分类号: C12Q1/6851
代理公司: 北京天奇智新知识产权代理有限公司 11340 代理人: 任毅
地址: 213000 *** 国省代码: 江苏;32
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摘要: 发明公开了一种支气管肺病灶灌洗液的SHOX2甲基化检测方法,其技术方案要点是:将患者支气管肺病灶处采集的灌洗液等量分为3份,作为3个样本;将S1中的3个样本分别应用DNA提取试剂盒提取DNA,应用UV分光光度计测定DNA浓度及纯度,取浓度大于7ng/ul且OD260/280吸光光度比值为1.8‑1.9为合格样本;利用亚硫酸氢盐转化,将所述S2中合格的样本进行亚硫酸氢盐转化;对所述S3中的样本进行实时荧光定量PCR,并以内参基因β‑actin作为阳性对照,实验时采用20ul PCR反应体系,支气管肺病灶灌洗液的SHOX2甲基化检测方法检测简单、可靠性强。
搜索关键词: 样本 灌洗液 甲基化检测 支气管肺病 亚硫酸氢盐 实时荧光定量PCR 技术方案要点 分光光度计 患者支气管 吸光光度 阳性对照 提取DNA 肺病灶 等量 转化 应用 采集 基因 检测
【主权项】:
1.一种支气管肺病灶灌洗液的SHOX2甲基化检测方法,其特征在于,包括以下步骤:S1、将患者支气管肺病灶处采集的灌洗液等量分为3份,作为3个样本;S2、将S1中的3个样本分别应用DNA提取试剂盒提取DNA,应用UV分光光度计测定DNA浓度及纯度,取浓度大于7ng/ul且OD260/280吸光光度比值为1.8‑1.9为合格样本;S3、亚硫酸氢盐转化,将所述S2中合格的样本进行亚硫酸氢盐转化;S4、对所述S3中的样本进行实时荧光定量PCR,并以内参基因β‑actin作为阳性对照,实验时采用20ul PCR反应体系;S5、对所述S4中的样本进行实时荧光定量PCR仪扩增,PCR反应条件为98℃/10″,并进行60个循环;S6、在阳性对照、阴性对照、空白对照有效的情况下,测量绘制样本中β‑actin和SHOX2基因的指数扩张曲线;S7、若所述S6中样本中β‑actin和SHOX2基因均有指数扩张曲线则判断为甲基化阳性,若样本中β‑actin有指数扩增曲线,而SHOX2基因无扩增曲线则为甲基化阴性。
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