[发明专利]一种调控番茄腺毛形成的基因及克隆方法有效
申请号: | 201811126376.1 | 申请日: | 2018-09-26 |
公开(公告)号: | CN109112124B | 公开(公告)日: | 2021-05-21 |
发明(设计)人: | 杨长宪;叶志彪;廖晓利;朱顺华;裴利菲;王涛涛;李汉霞 | 申请(专利权)人: | 华中农业大学 |
主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12N15/10;C12N15/82;A01H5/00;A01H6/82 |
代理公司: | 北京金智普华知识产权代理有限公司 11401 | 代理人: | 杨采良 |
地址: | 430070*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | 本发明属于植物基因工程技术领域,公开了一种调控番茄腺毛形成的基因及克隆方法,测定转录组数据;TopHat2与参考基因组比对,结合Cufflinks对转录本拼接得转录本;去除表达量和可信度低的单外显子转录本、选择转录本长度200bp转录本、筛除与数据库注释exon区域有重叠转录本、选择FPKM≥0.5转录本,确定疑似lncRNAs;用PFAM和CPC得lncRNAs。本发明确定在番茄I型腺体毛高表达的lncRNA,得调控番茄腺毛形成的lncRNA000100,全长序列为1266bp;该基因在番茄中超量表达,显著抑制I型番茄腺毛形成;可以在番茄抗虫、抗病毒、抗逆境等方面进行应用。 | ||
搜索关键词: | 一种 调控 番茄 腺毛 形成 基因 克隆 方法 | ||
【主权项】:
1.一种调控番茄腺毛形成的基因,其特征在于,所述调控番茄腺毛形成的基因lncRNA全长cDNA序列为1266bp;cDNA序列为SEQ ID NO:1。
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