[发明专利]一种下一代测序文库的制备方法有效
申请号: | 201810596876.5 | 申请日: | 2018-06-11 |
公开(公告)号: | CN108866155B | 公开(公告)日: | 2022-07-26 |
发明(设计)人: | 常玉晓;穆建强;赵胜;卢颖;刘可 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院深圳农业基因组研究所 |
主分类号: | C12Q1/6806 | 分类号: | C12Q1/6806;C12N15/10;C40B50/06 |
代理公司: | 北京华仲龙腾专利代理事务所(普通合伙) 11548 | 代理人: | 李静 |
地址: | 518120 广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | 本发明公开了一种下一代测序文库的制备方法。按照如下步骤进行:DNA定量,在待测DNA片段的两端加上测序时需要的DNA接头序列,DNA文库的浓度和DNA片段长度分布模式的检测,DNA文库混合比例的计算和混合,混合文库的片段选择,被选择DNA文库的检测和定量,被选择DNA文库的测序。本发明的方法将多个文库在PCR后混合在一起进行一次片段分选和Q‑PCR定量,大大的降低了工作量,而且最终的测序数据量在不同样品中的分布没有受到显著影响。 | ||
搜索关键词: | 一种 下一代 序文 制备 方法 | ||
【主权项】:
1.一种下一代测序文库的制备方法,其特征在于,按照如下步骤进行:(1)DNA定量:将抽提的基因组DNA取2‑5μL,测定基因组DNA的浓度;(2)在待测DNA片段的两端加上测序时需要的DNA接头序列;(3)DNA文库的浓度和DNA片段长度分布模式的检测;(4)DNA文库混合比例的计算和混合:根据每个文库的浓度和该文库中目标片段占的比例,两者相乘即得到该文库中目标片段的浓度,该浓度信息是不同DNA文库混合的依据;根据目标片段的浓度,从每个文库都取相同总量的目标DNA进行混合,获得最终混合的文库;(5)混合文库的片段选择:将混合好的文库进行片段选择,可以用磁珠或琼脂糖凝胶切胶的方法选择目的DNA片段,也可以利用Life technology公司开发的
预制琼脂糖凝胶电泳系统或Sage Science公司开发的Sage BluePippin、Sage ELF或Sage PippinHT,进行DNA文库片段选择;(6)被选择DNA文库的检测和定量:采用Fragment analyzer、Agilent Bioanalyzer 2100或Qsep100检测被选择文库的实际片段大小;文库的定量采用
或Q‑PCR来测定;(7)被选择DNA文库的测序:根据文库的浓度,按照Illumina相关仪器的要求,上机测序。
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