[发明专利]一种达旦提狄克氏菌TaqMan荧光定量PCR检测方法及应用在审
申请号: | 201810524467.4 | 申请日: | 2018-05-28 |
公开(公告)号: | CN109136394A | 公开(公告)日: | 2019-01-04 |
发明(设计)人: | 楼兵干;沈肖玲;易建平;仇智灵;王荣洲;李艳敏 | 申请(专利权)人: | 浙江大学;杭州市临安区农业局;浙江省农业厅 |
主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/686;C12Q1/04;C12N15/11 |
代理公司: | 北京轻创知识产权代理有限公司 11212 | 代理人: | 谈杰 |
地址: | 310058 浙江*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | 本发明公开了一种达旦提狄克氏菌TaqMan荧光定量PCR检测方法及应用。该检测方法所用到的引物及探针包括引物Ddad3、Ddad4和TaqMan探针Addad2,其核苷酸序列分别如SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.3所示。该检测方法包括以下步骤:提取待测样品DNA;以样品DNA为模板,加入上述的达旦提狄克氏菌TaqMan荧光定量PCR检测的引物及探针,进行实时荧光定量PCR检测;根据Ct值和预期扩增曲线判断检测样品中是否含有达旦提狄克氏菌。本发明建立的基于TaqMan探针的荧光定量PCR检测体系可用于甘薯茎腐病疑似样本、病残体、田间土壤和种薯种苗的快速检测。 | ||
搜索关键词: | 荧光定量PCR检测 克氏菌 引物 探针 检测 实时荧光定量PCR 核苷酸序列 待测样品 检测样品 快速检测 扩增曲线 田间土壤 样品DNA 病残体 甘薯茎 可用 种苗 种薯 样本 应用 | ||
【主权项】:
1.一种达旦提狄克氏菌TaqMan荧光定量PCR检测的引物及探针,其特征在于,包括引物Ddad3、Ddad4和TaqMan探针Addad2,其中,Ddad3:5’‑ACCCAGGCCACCAGAAGT‑3’,其核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示;Ddad4:5’‑GACGGTACTGTTACCGCTAC‑3’,其核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示;TaqMan探针Addad2:5’‑CAGTGGTGCCTGCGCCAAC‑3’,其核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示;其中,TaqMan探针Addad2的5’端标记荧光报告基因FAM,3’端标记荧光猝灭基团MGB。
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