[发明专利]基于EST序列开发EPICs引物的方法有效
| 申请号： | 201810066162.3 | 申请日： | 2018-01-23 |
| 公开（公告）号： | CN108048530B | 公开（公告）日： | 2021-07-27 |
| 发明（设计）人： | 舒琥;江小璐 | 申请（专利权）人： | 广州大学 |
| 主分类号： | C12Q1/6811 | 分类号： | C12Q1/6811;C12Q1/6888 |
| 代理公司： | 广州三环专利商标代理有限公司 44202 | 代理人： | 郝传鑫;宋静娜 |
| 地址： | 510000 广东省广*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种基于EST序列开发EPICs引物的方法，包括如下步骤：(1)检索目标生物或其近缘生物的EST序列，将所述EST序列与NCBI的基因组序列进行比对；(2)若所述EST序列在所述NCBI的基因组内覆盖率小于25％，筛选出单拷贝内含子的长度在400～1600bp，相似度在85％以上的候选基因；(3)针对所述候选基因设计引物，得到所述的EPICs引物。本申请方法操作简便，只需将目标生物基因组序列与EST序列进行比对，挑选出合适的分子标记即可，所得的核基因分子标记应用极广，可用于群体遗传多样性分析。 | ||
| 搜索关键词： | 基于 est 序列 开发 epics 引物 方法 | ||
【主权项】：
1.基于EST序列开发EPICs引物的方法，其特征在于，包括如下步骤：(1)检索目标生物或其近缘生物的EST序列，将所述EST序列与NCBI的基因组序列进行比对；(2)若所述EST序列在所述NCBI的基因组内覆盖率小于25％，筛选出单拷贝内含子的长度在400～1600bp，相似度在85％以上的候选基因；(3)针对所述候选基因设计引物，得到所述的EPICs引物；其中，所述引物的参数包括：GC含量为40％～60％，退火温度为55～65℃，长度为18～27bp。
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