[发明专利]种子植物物种的鉴定方法和用途有效
申请号: | 201710833314.3 | 申请日: | 2017-09-15 |
公开(公告)号: | CN107400723B | 公开(公告)日: | 2019-12-06 |
发明(设计)人: | 张伟;赵宏 | 申请(专利权)人: | 山东大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;G16B30/10;G16B25/10;G16B50/00 |
代理公司: | 37256 青岛清泰联信知识产权代理有限公司 | 代理人: | 梁春艳<国际申请>=<国际公布>=<进入 |
地址: | 264209 *** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | 本发明涉及一种种子植物物种的鉴定方法和用途,包括以下步骤:选取种子植物物种,获取所述种子植物物种的ITS2基因序列,基于ITS2基因序列构建进化树,在进化树中选取多对姊妹种,计算每对姊妹种之间的遗传距离,对属于同一门物种的多组遗传距离进行差异显著性检验,选取差异不显著的遗传距离计算平均值得到分子界值;计算待测物种与目标物种间的遗传距离,将所述遗传距离与待测物种所属门的分子界值比较确定物种类别。本发明的方法只需要将待测样品或疑似的物种与目标物种的ITS2基因序列进行分歧度比较即可,更加简便易行,准确性高,客观性强,不需要对同属其它物种大量取样作为参照,具有较高的应用价值。 | ||
搜索关键词: | 种子 植物 物种 鉴定 方法 用途 | ||
【主权项】:
1.一种种子植物物种的鉴定方法,其特征在于:包括以下步骤:/n确定分子界值:选取属内75%以上的种子植物物种,获取所述种子植物物种的ITS2基因序列,以属为单位将ITS2基因序列采用邻接法构建得到进化树,取位于进化树的同一分支上相邻两个物种作为一对姊妹种,在进化树中选取多对姊妹种,计算每对姊妹种之间的遗传距离,对属于同一门物种的多组遗传距离进行差异显著性检验,选取位于95%置信区间内的差异不显著的遗传距离计算平均值得到分子界值;/n确定物种类别:提取待测物种的ITS2基因序列并测序,将待测样品的ITS2基因序列与数据库中目标物种的ITS2基因序列进行比对,计算待测物种与目标物种间的遗传距离,将所述遗传距离与待测物种所属门的分子界值比较,如其大于分子界值,则待测物种不属于目标物种,如其小于分子界值,则待测物种属于目标物种。/n
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