[发明专利]预测氨基酸变异对蛋白质结构稳定性影响的系统及其方法

摘要

本发明公开了一种预测氨基酸变异对蛋白质结构稳定性影响的系统及其方法，该系统由氨基酸变异信息输入模块、氨基酸变异位点属性计算模块、蛋白质序列属性计算模块、预测稳定性变化模块、预测结果输出模块组成；该方法的步骤为录入并获取变异信息；提前约AAindex属性特征以及计算氨基酸微电物理化学属性特征；计算与氨基酸变异对应的蛋白质序列的保守性及其蛋白质属性；采用两层三分随机森林算法计算氨基酸变异对蛋白质稳定性的影响；储存并输出预测结果。本发明可以依据用户提供的氨基酸变异和对应的蛋白质序列，准确预测该氨基酸变异会导致所在蛋白质的结构稳定性升高、降低或不变，以及相应概率，并将结果存储并发送用户保存。

主权项

一种预测氨基酸变异对蛋白质结构稳定性影响的系统，其特征在于：由氨基酸变异信息输入模块（1）、氨基酸变异位点属性计算模块（2）、蛋白质序列属性计算模块（3）、预测稳定性变化模块（4）、预测结果输出模块（5）组成，其中，所述氨基酸变异信息输入模块（1）分别与所述氨基酸变异位点属性计算模块（2）和所述蛋白质序列属性计算模块（3）连接，所述氨基酸变异位点属性计算模块（2）和所述蛋白质序列属性计算模块（3）同时与所述预测稳定性变化模块（4）连接，所述预测稳定性变化模块（4）与所述预测结果输出模块（5）连接；所述氨基酸变异信息输入模块（1）的功能为获取用户提交的单个或成组的氨基酸变异及其蛋白质序列，并进行用户信息及数据的存储；所述氨基酸变异位点属性计算模块（2）的功能为根据野生型和变异型位点上的氨基酸情况，提取相对应的AAindex属性特征值，并根据氨基酸变异数据，计算变异后的氨基酸位点物理化学属性特征；所述蛋白质序列属性计算模块（3）的功能为根据氨基酸变异数据计算相关蛋白质的保守性以及蛋白质属性特征；所述预测稳定性变化模块（4）的功能为通过基于随机森林的两层三分类算法将氨基酸变异对蛋白质稳定性的影响进行计算和分类，并给出相应概率，作为预测结果；所述预测结果输出模块（5）的功能为将预测结果生成excel和pdf文件形式，存储并自动邮件发送用户，同时支持用户查询统计。