[发明专利]自闭症生物标志物及其检测试剂盒、应用

摘要

本发明提供了自闭症生物标志物，包括肠道宏基因组特征，具体表现为酸杆菌门等的水平，由此自闭症的诊断将不依靠主观经验判断，不仅可以对自闭症的发病提供有效预警，而且可对其进行确诊，极大提高了诊断准确率；本发明还提供了用于诊断自闭症的试剂盒，以及预防或治疗自闭症的组合物；本发明进一步提供了自闭症生物标志物、自闭症诊断试剂盒以及预防或治疗自闭症的组合物的应用；本发明更进一步提供了筛选易患自闭症的生物样品的系统，通过此筛选系统，可筛选易患自闭症的生物样品。

主权项

自闭症生物标志物，其特征在于，包括肠道宏基因组特征，具体表现为酸杆菌门的水平；任选的，所述肠道宏基因组特征还表现为放线菌门、衣原体门、螺旋体门、β‑变形菌纲、衣原体纲、Dehalococcoidetes纲、螺旋体纲、酸硫杆菌目、双歧杆菌目、衣原体目、着色菌目、Dehalococcoidales目、虫原体目、丹毒丝菌目、盐厌氧菌目、奈氏球菌目、螺旋体目、Synergistales目、Thermoanaerobacterales目、氨基酸球菌科、酸硫杆状菌科、食烷菌科、双歧杆菌科、短螺旋体科、纤维素单胞菌科、Dehalococcoidaceae科、外硫红螺旋菌科、虫原体科、赤杆菌科、戈登氏菌科、河氏菌科、盐厌氧菌科、军团菌科、甲烷粒菌科、甲烷螺菌科、甲基杆菌科、奈瑟氏菌科、类芽胞杆菌科、粘土杆菌科、消化球菌科、芯卡体科、螺旋体科、葡萄球菌科、互养菌科、互营单胞菌科、醋酸杆菌属、氨基酸球菌属、双歧杆菌属、短螺菌属、短芽孢杆菌属、热解纤维素菌属、柠檬酸杆菌属、克洛诺菌属、脱亚硫酸菌属、脱硫芽孢弯曲菌属、脱硫肠状菌属、产氢新菌属、大芬戈尔德菌属、盐厌氧菌属、纤毛菌属、沙门氏菌属、Sphaerochaeta属、互营单胞菌属、Tepidanaerobacter属、四联球菌属、Thermincola属、密螺旋体属、Acaryochloris marina MBIC 11017、醋酸杆菌属woodii DSM 1030、氨基酸球菌属fermentans、氨基酸球菌属fermentans DSM 20731、氨基酸球菌属intestini、鲍曼不动杆菌属baumannii ATCC 17978、Advenella kashmirensis WT001、Alcanivorax borkumensis SK2、Alicycliphilus denitrificans、Aliivibrio unclassified、Alkalilimnicola ehrlichii MLHE‑1、Alkaliphilus oremlandii OhILAs、Allochromatium vinosum DSM 180、Anaeromyxobacter sp.Fw109‑5、Archaeoglobus veneficus SNP6、节细菌属亚种FB24、Azoarcus sp.BH72、Azospirillum unclassified、芽胞杆菌科unclassified、苏云金杆菌、巴尔通氏体属tribocorum、双歧杆菌animalis、双歧杆菌Bifidobacterium animalis subsp.Lactis、博代氏杆菌属鸟结核197N、Borrelia burgdorferi group、Brachyspira murdochii DSM 12563、Brachyspira pilosicoli 95/1000、Buchnera aphidicola、Burkholderia phymatum STM815、Burkholderia pseudomallei 1710b、Burkholderia sp.CCGE1002、Burkholderia sp.CCGE1003、Burkholderia xenovorans LB400、Caldicellulosiruptor、弯曲杆菌hominis ATCC BAA‑381、弯曲杆菌jejuni subsp.jejuni ICDCCJ07001、Candidatus Accumulibacter phosphatis clade IIA str.UW‑1、Candidatus Chloracidobacterium thermophilum B、Candidatus Protochlamydia amoebophila UWE25、Cellulosilyticum lentocellum、Chlamydophila pneumoniae J138、Chlamydophila unclassified、梭菌属genomosp.BVAB3、梭状芽胞杆菌botulinum Ba4 str.657、梭状芽胞杆菌cellulolyticum、梭状芽胞杆菌cellulovorans 743B、梭状芽胞杆菌clariflavum DSM 19732、梭状芽胞杆菌kluyveri、梭状芽胞杆菌sp.BNL1100、梭状芽胞杆菌sticklandii DSM 519、梭状芽胞杆菌tetani E88、梭状芽胞杆菌thermocellum、梭状芽胞杆菌thermocellum ATCC 27405、棒状杆菌属科unclassified、棒状杆菌属efficiens YS‑314、Cupriavidus metallidurans CH34、Dechlorosoma suillum PS、Desulfitobacterium unclassified、Desulfosporosinus acidiphilus SJ4、Desulfosporosinus orientis DSM 765、Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771、Desulfotomaculum reducens MI‑1、Eggerthella sp.YY7918、Eggerthella unclassified、Erythrobacter litoralis HTCC2594、Fibrobacter succinogenes subsp.succinogenes S85、Finegoldia magna ATCC 29328、Gallionellaceae、Gardnerella vaginalis ATCC 14019、葡糖杆菌属oxydans 621H、Gordonia polyisoprenivorans、Hahella chejuensis KCTC 2396、幽门螺杆菌属cinaedi PAGU611、幽门螺杆菌属felis ATCC 49179、幽门螺杆菌属pylori F30、幽门螺杆菌属pylori Puno120、Ignisphaera aggregans DSM 17230、Kangiella koreensis DSM 16069、Kitasatospora setae KM‑6054、乳酸菌属johnsonii DPC 6026、Laribacter hongkongensis HLHK9、军团菌属longbeachae NSW 150、Marinobacter adhaerens HP 15、Methanocorpusculum labreanum Z、Methanospirillum hungatei JF‑1、Methylobacterium nodulans ORS 2060、Methylotenera mobilis、Mobiluncus curtisii ATCC 43063、Muricauda ruestringensis、分枝杆菌属gilvum、分枝杆菌属smegmatis str.MC2 155、支原体bovis、支原体bovis PG45、支原体putrefaciens KS1、奈瑟氏菌属unclassified、奈瑟氏菌科unclassified、Neorickettsia sennetsu str.Miyayama、亚硝化球菌属halophilus Nc4、Nitrosomonadaceae unclassified、诺卡氏菌科unclassified、Oceanobacillus iheyensis HTE831、Peptococcaceae unclassified、Peptostreptococcaceae、浮霉状菌属limnophilus DSM 3776、Polaromonas sp.JS666、Polynucleobacter necessarius、变形杆菌mirabilis HI4320、Pseudogulbenkiania sp.NH8B、Pseudoxanthomonas spadix BD‑a59、Ralstonia solanacearum PSI07、红球菌属opacus B4、Rhodospirillum photometricum DSM 122、Rhodothermus marinus SG0.5JP17‑172、Riemerella anatipestifer RA‑GD、Saccharopolyspora erythraea NRRL 2338、月形单胞菌属ruminantium subsp.Lactilytica、Shewanella denitrificans OS217、Sphaerochaeta globus str.Buddy、Sphingomonas wittichii RW1、螺旋体thermophila DSM 6192、金黄色葡萄球菌aureus subsp.aureus NCTC 8325、Stenotrophomonas maltophilia、链球菌科unclassified、链球菌属agalactiae A909、链球菌属suis ST3、链霉菌属cattleya NRRL 8057＝DSM 46488、链霉菌属scabiei 87.22、Syntrophobacter fumaroxidans MPOB、Tepidanaerobacter acetatoxydans Re1、Thermoanaerobacterium、Thermoanaerobacterium saccharolyticum、Thermoanaerobacterium saccharolyticum JW/SL‑YS485、Thermotoga lettingae TMO、密螺旋体属brennaborense DSM 12168、密螺旋体属succinifaciens、密螺旋体属succinifaciens DSM 2489、密螺旋体属unclassified、弧菌unclassified、创伤弧菌CMCP6和Xanthomonas oryzae pv.oryzae MAFF 311018中的一种或多种的水平。